벼 도열병 감염 단계 비암호 RNA 프로파일링과 RNA 조절 기작 연구

Infection-stage profiling of non-coding RNAs and RNA regulatory mechanisms in rice blast

연구 내용

벼 도열병균에서 감염 단계별 lncRNA와 small RNA를 전수 프로파일링하고, 숙주-병원체 상호작용과 병원성 관련 유전자 조절의 연결고리를 도출하는 연구

본 연구는 벼 도열병균 Magnaporthe oryzae의 감염 단계 전반에 걸친 lncRNA와 non-canonical small RNA 양상을 규명하는 데 초점을 둡니다. 단계 구분에 따라 감염 특이 발현 lncRNA를 추출하고, 이들과 연관된 단백질 코딩 유전자의 기능 예측을 통해 병원성 관련 조절 네트워크를 구성합니다. 또한 Dicer 의존 경로 외에 존재하는 비정형 RNAi 축을 비교 프로파일링하여, conidiation 및 발달 과정 조절과의 연계를 확인합니다. 이를 통해 감염 단계별 RNA 조절 요소를 정량화하기보다는, 기능 연관성과 조절 축을 중심으로 분자 수준의 기작을 정리하는 방향을 취합니다.

관련 프로젝트

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연구 흐름

초기에는 감염 과정에서 lncRNA가 단계적·감염 특이적으로 축적된다는 관찰을 바탕으로, 6단계 호스트 감염 모델에서 lncRNA를 전장 유전체 수준으로 발굴하는 프로파일링 연구를 수행했습니다. 이후 2022년에는 발굴된 lncRNA를 감염 특이 집합으로 분류하고, 연관 단백질 코딩 유전자를 통해 병원성 관련 기능을 추론하는 흐름으로 확장했습니다. 이어 2022년 후반에는 canonical과 non-canonical small RNA를 비교하여, Dicer 의존성 외의 RNAi 조절이 conidiation과 연동됨을 확인하는 방향으로 심화되었습니다. 현재는 RNA 조절 축을 감염 단계 변화와 연결하는 통합 분석을 통해 표적 후보 도출을 위한 기반을 축적하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

감염 단계 특이 lncRNA 진단 표지자
non-canonical RNAi 경로 타깃 방제 전략
병원성 연관 RNA 조절 네트워크 지도
RNA 기반 저항성 예측 알고리즘
RNA 발현 패널을 활용한 작물 방어 평가
기주 반응과 연계된 RNA 기능 검증 체계
전사 단계별 표적 유전자 후보군 도출
RNA 전달 및 표적화 기작 연구 도구
병원체 발달 조절 축 기반 품질 관리
감염 억제 스크리닝을 위한 RNA 리포터 설계