교모세포종(GBM)은 다양한 종양유전적 진화 과정에 따른 종양 내 이질성을 보인다. 우리는 GBM의 동일한 조직 샘플로부터 유래하였으면서 형태적 및 생물학적 특성이 서로 다른 두 가지 구별되는 암세포주를 성공적으로 분리·확립하였다. 두 세포주의 유전체 및 전사체 특성을 비교한 결과, 각 세포주는 서로 다른 돌연변이 군집을 지니는 한편, 핵심 유전자 동인(driver) 돌연변이는 공유하고 있었다. 전사체 분석에서는 한 세포주가 다른 세포주와 달리 중간엽 전이 과정(mesenchymal transition)을 진행하고 있음을 보여주었다. 또한 공개되어 있는 단일세포 RNA-seq 데이터로부터 우리의 세포주와 유사한 군집을 포함하는 네 개의 종양 샘플을 확인할 수 있었고, 짝지어진 종단적 GBM 샘플의 한 세트에서는 반복(recurrent) 샘플이 중간엽 전이를 겪는 우리의 세포주 특이 유전자에 풍부하게 농축된 세 쌍의 경우를 확인할 수 있었다. 본 연구는 GBM에서 진행 중인 세포 수준의 중간엽 전이를 규명하기 위한 직접적인 근거와 유용한 자원을 제공하며, 이는 예후 및 치료에 대한 함의를 가진다.
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