배경 및 목적: 간경변증과 간세포암은 높은 이환율과 사망률을 특징으로 하는 주요한 전 세계적 건강 문제이다. RNA 결합 단백질은 후성전사 유전자 조절에서 중요한 역할을 하며, 이러한 질환의 병인에 관여하는 것으로 알려져 있다. 본 연구의 목적은 간경변증과 간세포암 진행에 관여하는 새로운 표적화 가능한(druggable) RNA 결합 단백질을 규명하고 그 타당성을 검증하는 데 있다. 재료 및 방법: 생물정보학 분석과 실험적 검증을 결합한 통합적 접근법을 사용하였다. 연구는 Gene Expression Omnibus 데이터베이스로부터 유전자 발현이 상향 조절된 유전자를 확인하기 위해 데이터 마이닝을 수행하였다. 생체 내 검증은 알코올성 간경변증 및 비바이러스성 간세포암 환자의 사람 간 조직 샘플을 통해 실시하였다. 시험관 내에서는 사람 간종양 세포를 사용하여 화합물 alpha-naphthoflavone이 세포 생존성과 유전자 발현에 미치는 영향을 평가하였다. 결과: RNA 결합 단백질 데이터베이스와의 중복을 통해 총 10개의 RNA 결합 단백질 표적(HNRNPA1, HNRNPC, NONO, KHDRBS1, SRSF1, XRN2, YWHAZ, ANXA4, HDAC2 및 ITGB1)을 확인하였다. 실험적 검증에서 이들 표적의 발현은 종양이 없는 대조군에 비해 환자 샘플에서 유의하게 증가하였다. 간종양 세포에 alpha-naphthoflavone을 처리한 결과, 약물 유발 간손상 모델에서 세포 생존성이 농도 의존적으로 증가하였고, 발암성 키나아스 및 다수의 RNA 결합 단백질의 발현이 하향 조절되었다. 결론: 이러한 결과는 RNA 결합 단백질을 표적으로 하는 접근이 치료 효능과 안전성을 향상시키는 새로운 치료 전략으로 이어질 수 있음을 시사한다. 유망한 다중표적 억제제로서 alpha-naphthoflavone의 생체 내 효능에 대한 추가 연구가 필요하다.

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