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Review|
인용수 13
·2023
Meta-analysis of single-cell RNA-sequencing data for depicting the transcriptomic landscape of chronic obstructive pulmonary disease
Yubin Lee, Jaeseung Song, Yeonbin Jeong, Eun‐Young Choi, Chul Woo Ahn, Wonhee Jang
IF 7 (2023) Computers in Biology and Medicine
초록

만성폐쇄성폐질환(COPD)은 기류 제한과 폐의 만성 염증을 특징으로 하는 호흡기 질환으로, 전 세계 사망의 주요 원인이다. 단일 세포 수준에서의 완전한 병리 기전이 아직 충분히 규명되지 않았으므로, COPD의 단일세포 해상도 지형을 특성화하기 위한 통합적 접근이 필요하다. COPD의 발병과 연관된 세포 유형 및 기전을 규명하기 위해, 우리는 COPD의 세 가지 단일세포 RNA 시퀀싱 데이터셋을 활용한 메타분석을 수행하였다. 16명의 COPD 환자와 18명의 건강한 대상에서 총 154,011개의 세포 중 17개의 서로 다른 세포 유형이 관찰되었다. 17개의 세포 유형 중 단핵구, 비만세포, 그리고 폐포 제2형 세포(AT2 cells)는 유전적 및 전사체적 특징에 근거하여 COPD의 병인과 연관된 것으로 확인되었다. 세 가지 병인 관련 세포 유형에서 전사체적으로 가장 다양한 상태들은 면역/염증 반응(단핵구 및 비만세포) 및/또는 미토콘드리아 기능장애(단핵구 및 AT2 세포)에서 유의한 농축을 보였다. 이어서 우리는 이들 세 가지 병인 관련 세포 유형에서 유전자 발현 양상을 조절함으로써 COPD를 유발할 수 있을 가능성이 있는 세 가지 화학적 후보 물질을 확인하였다. 전반적으로, 본 연구는 COPD의 병인에 대한 단일세포 수준 기전을 시사하며, COPD의 잠재적 위험요인이 될 수 있는 독성 화합물에 관한 정보를 제공할 수 있을 것으로 보인다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
COPDTranscriptomeCellCell typePathogenesisInflammationMast cellDiseaseEtiologyMedicine
타입
Review
IF / 인용수
7 / 13
게재 연도
2023