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인용수 5
·2023
A Transcriptome-Wide Analysis of Psoriasis: Identifying the Potential Causal Genes and Drug Candidates
Yeonbin Jeong, Jaeseung Song, Yubin Lee, Eun‐Young Choi, Youngtae Won, Byunghyuk Kim, Wonhee Jang
IF 4.9 (2023) International Journal of Molecular Sciences
초록

건선은 피부 발진과 가려움증을 특징으로 하는 만성 염증성 피부 질환이다. 건선의 유전적 배경은 부분적으로만 밝혀져 있으므로, 통합적이고 엄밀한 연구가 필요하다. 우리는 새 Genotype-Tissue Expression(version 8) 참조 패널을 사용하여 전사체 전반 연관 연구(transcriptome-wide association study, TWAS)를 수행하였으며, 이전에는 사용되지 않았던 일부 조직 및 다중 조직 패널을 포함하였다. 또한 TWAS 분석을 위한 조직 패널을 우선순위화하기 위해, 전장 유전체 연관 연구(genome-wide association study, GWAS) 데이터에 대해 조직 특이적 유전력 분석을 수행하였다. 조직 특이성 및 통계적 검정력을 높이기 위해, CONTENT(context-specific genetics)의 단일 조직 패널과 다중 조직 패널로부터 8개 조직을 대상으로 TWAS 및 공분리(colocalization, COLOC) 분석을 수행하였다. TWAS 결과, 단일 조직 패널에서는 101개의 유의한 유전자, 다중 조직 패널에서는 64개의 유의한 유전자를 확인하였으며, 이들 중 26개 유전자가 COLOC에서 재현되었다. 기능 주석 및 네트워크 분석을 통해 해당 유전자들이 건선 및/또는 면역 반응과 연관됨을 확인하였다. 아울러 조건부 및 공동 분석을 통해, 함께 유의한 유전자들과 상호작용하는 약물 후보들도 제시하였다. 종합하면, 본 연구 결과는 건선의 기저 유전 기전 규명에 기여하고, 건선 치료에 대한 새로운 통찰을 제공할 수 있을 것이다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
TranscriptomeGenome-wide association studyPsoriasisBiologyContext (archaeology)Genetic associationComputational biologyGeneticsGeneExpression quantitative trait loci
타입
Article
IF / 인용수
4.9 / 5
게재 연도
2023