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·2023
Large-scale Integrative Analysis of Juvenile Idiopathic Arthritis for New Insight into Its Pathogenesis
Daeun Kim, Jaeseung Song, Nicholas Mancuso, Serghei Mangul, Chul Woo Ahn, Junghyun Jung, Wonhee Jang
medRxiv
초록

【초록 목적】청소년기 특발성 관절염(juvenile idiopathic arthritis, JIA)은 소아에서 가장 흔한 류마티스 질환 중 하나이며, 자가면역질환(autimmune disease, AID)으로 분류된다. JIA의 발병 원인에 대한 견고한 유전적 기여는 이미 규명되었으나, 정확한 병인은 아직 불명확하다. 본 연구는 JIA의 원인에 대한 새로운 통찰을 얻기 위해 포괄적인 통합 분석을 수행하였다. 【방법】JIA에 대한 생물학적으로 해석 가능한 감수성 유전자와 단백질을 우선적으로 선별하기 위해 전사체 수준 및 단백질체 수준 연관성 연구(transcriptome-wide association studies, TWAS / proteome-wide association studies, PWAS)를 수행하였다. 다음으로, JIA의 유전적 아키텍처를 이해하기 위해 자연선택의 특징인 단일염기다형성(SNP) 기반 유전가능성(heritability)과 다유전자성(polygenicity)을 체계적으로 분석하였다. 마지막으로, 다인종(multI-ancestry) RNA 시퀀싱 자료를 이용한 HLA typing을 수행하고, 단일세포 수준에서 T 세포 수용체(T cell receptor, TCR) 레퍼토리를 분석하여 면역과 JIA 위험 간의 연관성을 조사하였다. 【결과】본 연구에서 JIA 위험과 연관된 19개의 TWAS 유전자와 2개의 PWAS 단백질을 확인하였다. 또한 JIA의 유전가능성 및 세포유형 풍부도 분석이 T 림프구와 HLA 영역에서 풍부하게 나타났으며, JIA는 다른 AID에 비해 더 높은 다유전자성을 보였다. 다인종 HLA typing에서 B*45:01은 유럽 JIA 환자보다 아프리카 JIA 환자에서 더 높은 빈도로 관찰되었다. 반면 DQA1*01:01, DQA1*03:01 및 DRB1*04:01은 유럽 JIA 환자에서 더 높은 빈도를 보였다. 단일세포 면역 레퍼토리 분석을 통해, JIA 환자에서 클론성으로 확장된 T 세포 아형을 확인하였으며, CXCL13 + BHLHE40 + T H 세포가 JIA 위험과 유의하게 연관됨을 확인하였다. 【결론】본 연구의 결과는 JIA의 병인에 대해 새로운 관점을 제공하며, JIA의 분자적 동인(molecular drivers)을 규명하기 위한 향후 기전 연구의 강력한 기반을 마련한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
Single-nucleotide polymorphismSNPPathogenesisArthritisBiologyHuman leukocyte antigenTranscriptomeRepertoireImmunologyEtiology
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게재 연도
2023