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인용수 2
·2024
Elucidating immunological characteristics of the adenoma-carcinoma sequence in colorectal cancer patients in South Korea using a bioinformatics approach
Jaeseung Song, Daeun Kim, Junghyun Jung, Eun Young Choi, Yubin Lee, Yeonbin Jeong, Byungjo Lee, Sora Lee, Yujeong Shim, Youngtae Won, Hyeki Cho, Dong Kee Jang, Hyoun Woo Kang, Jong Wha J. Joo, Wonhee Jang
IF 3.9 (2024) Scientific Reports
초록

대장암(CRC)은 전 세계적으로 가장 흔하고 생명을 위협하는 악성 종양 중 하나이다. 대부분의 CRC는 전암 단계인 진행성 대장 선종(ACA)에서 시작하여 선종-암종 연속(adenoma-carcinoma sequence) 과정을 거쳐 발생한다. 그러나 종양 미세환경이 어떻게 변화하는지 등 그 근본 기전은 여전히 명확하지 않다. 이에 우리는 동국대학교 일산병원을 방문한 ACA 환자 40명으로부터 수집한 RNA-seq 자료와, 공개 데이터베이스에서 수집한 CRC 환자 18명의 정상 인접 결장 및 종양 샘플을 비교하는 통합 분석을 수행하였다. 차등 발현 분석 결과, 연속 전반에서 각각 상향 또는 하향 조절된 유전자가 순차적으로 21개 및 79개 확인되었다. 연속 유전자들의 기능적 중심성은 네트워크 분석을 통해 평가하였으며, 그 결과 상향 조절 허브 유전자 11개와 하향 조절 허브 유전자 13개가 확인되었다. 이후 Kaplan-Meier 생존 분석을 통해 허브 유전자들의 예후 예측 효과를 검증하였다. 선종-암종 연속의 면역학적 전이를 추정하기 위해 단일세포 분해(single-cell deconvolution) 및 면역 레퍼토리(immune repertoire) 분석을 수행하였다. 선천 면역 세포의 구성 변화가 유의하게 관찰되었고, 면역글로불린 다양성이 감소한 형질세포 B세포(plasma B-cells)가 나타났으며, 뚜렷한 면역글로불린 재조합 패턴이 함께 확인되었다. 종합하면, 본 연구의 결과는 선종-암종 연속 과정에서의 근본적인 전사적 변화와 면역학적 변화가 CRC의 진단 전(pre-diagnostic) 표지자 개발에 기여할 수 있음을 시사한다고 판단한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
Colorectal cancerSequence (biology)AdenomaCarcinomaCancerBioinformaticsComputational biologyMedicineBiologyOncology
타입
Article
IF / 인용수
3.9 / 2
게재 연도
2024