자가수정은 교배(outcrossing)에 비해 유전적 다양성을 감소시키며, 가설적으로는 다양한 환경에 적응하는 능력을 저하시킬 수 있다. 선충(Caenorhabditis) 중에서 자가수정은 Caenorhabditis elegans, Caenorhabditis briggsae, 그리고 보다 최근에 발견된 Caenorhabditis tropicalis에서 독립적으로 세 차례 진화하였다. C. tropicalis의 유전적 관련성을 조사하고, 종 전체 변이에 대한 지리와 생태적 지위(niche)의 영향 및 선택의 흔적(signatures of selection)을 규명하기 위해, 우리는 야생 785개 균주를 수집하고 그들의 유전체를 서열화한 뒤, 622개의 서로 다른 유전형(isotypes)을 확인하였다. C. elegans 및 C. briggsae와 달리, C. tropicalis의 관련성은 지리와 상당한 연관성을 보이며, 대륙을 가로지르는 선택적 선택(선택적 스윕, selective sweeps)이나 폭넓게 샘플링된 isotype은 관찰되지 않았다. 하와이 제도 또는 대만의 집단은 카리브해 또는 아메리카 대륙의 집단보다 더 많은 유전적 변이를 보유하며, 이는 다른 Elegans 아속(subclade) 구성원들과 유사한 태평양 기원(pacific species origin)을 시사한다. 극단적인 유전적 변이의 점상(punctuated) 유전체 구역이 유전체 전반에 만연해 있다. 이러한 고이질성 영역(hyper-divergent regions, HDRs)은 어떠한 개별 균주에서든 기준 유전체(reference genome)의 6% 미만을 차지하지만, 모든 변이 지점(variant sites)의 73%를 포함하며, 환경 적응에 관여할 가능성이 높은 유전자들에 대해 풍부(enriched)하다. HDRs는 독립적인 진화적 기원을 가짐에도 불구하고 자가수정을 하는 Caenorhabditis 선충의 공통된 유전체 특징을 나타내며, 유전적 다양성이 종 전체 수준에서 낮음에도 불구하고 전 세계적 분포를 설명할 수 있는 기전을 제시한다.
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