미생물 감염 장기칩 모델과 바이오인포매틱스 시각화 도구 개발 연구

Lung-on-a-Chip models and bioinformatics visualization tools for infectious disease data

연구 내용

장기칩 기반 미생물 감염 연구와 RNA-seq 분석용 시각화 도구를 함께 개발하는 연구

조용준 연구실은 Nontuberculous Mycobacterial pulmonary disease 연구에서 환자 유래 상피 구성을 Lung-on-a-Chip 플랫폼으로 구현하고, 감염 환경에서의 기질·세포 구성 차이를 비교 분석합니다. 동시에 대규모 omics 데이터가 연구실 내부에서 재현 가능하게 해석되도록, Shiny 기반의 웹 도구를 통해 publication-ready 시각화를 생성하고 통계 비교를 지원하는 워크플로를 제공합니다. 실험 모델과 데이터 해석 도구의 결합을 통해 미생물 감염 연구의 분석 접근성을 높이는 방향으로 수행합니다.

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연구 흐름

2024년에는 환자 유래 상피 구성을 반영하는 Lung-on-a-Chip 플랫폼을 통해 Nontuberculous Mycobacteria 폐질환 연구를 수행했습니다. 이후 데이터 기반 분석의 접근성을 높이기 위해 2025년에는 RNA-seq 중심의 시각화 및 통계 비교 기능을 갖춘 SimpleViz를 개발했습니다. 같은 시기, 임상·환경 요인이 감염 표현형에 미치는 영향에 대한 관찰과 해석을 반복하면서, 플랫폼 실험과 분석 도구를 함께 고도화하는 흐름을 형성했습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

환자 유래 상피 기반 감염 모델
장기칩 비교 실험 설계
omics 데이터 시각화 표준안
publication-ready 그림 자동화
RNA-seq 탐색 분석
통계 비교 기반 결과 정리
감염 병태 기전 데이터 패키징
실험-분석 연결 워크플로
생물정보학 교육용 도구
재현 가능한 데이터 리포팅