자가접힘 등온증폭 및 qPCR 기반 고신속 분자진단 플랫폼 연구

Rapid molecular diagnostics based on self-folding isothermal amplification and qPCR

연구 내용

등온 증폭과 qPCR 신호를 최적화하여 짧은 시간 내 핵산 표적을 정량·정성 검출하는 분자진단 연구

핵산 표적의 증폭 효율과 비특이 신호를 동시에 다루는 접근으로 연구를 수행합니다. LAMP 계열의 primer·ligation 설계를 통해 미량 표적(예: miRNA)을 민감하게 검출하고, extension-mediated self-folding 등온 증폭으로 반응 구성을 단순화합니다. 또한 SF-qPCR 및 ROC-qPCR처럼 정량성을 강화하는 PCR 구성을 적용하고, 짧은 템플릿에 대응하는 TaqMan probe 설계로 신호 대 잡음비를 개선합니다. 아울러 G-quadruplex DNAzyme−LAMP 기반의 색도 기반 readout을 결합해 자원 제한 환경에서의 판독 가능성을 확장합니다.

관련 프로젝트

3건

연구 흐름

초기에는 LAMP 변형과 primer extension 기반 등온 증폭을 통해 짧은 시간 내 표적 핵산을 검출하는 프로토콜을 구축했습니다. 이후 SF-qPCR을 포함한 정량형 PCR 구성과 짧은 템플릿용 TaqMan probe 설계로 측정 재현성과 시그널 특이성을 보강하는 방향으로 연구를 확장했습니다. 최근에는 self-folding 등온 증폭의 진단 적용과 함께 on-chip ROC-qPCR 및 DNAzyme−LAMP의 색도 판독을 연계하여, 현장형 분자진단 시스템의 구성요소를 구체화하는 흐름으로 진행되었습니다. 관련 과제에서는 디지털 PCR 대체 nest PCR 기반 현장형 검사를 목표로 워크플로를 최적화하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

현장형 호흡기 감염 진단키트
다중 표적 LAMP 분석 플랫폼
혈청 miRNA 기반 암 선별 검사
짧은 템플릿용 정량 PCR 프로토콜
즉시 판독 가능한 색 변화 판독 소자
온칩 형광 신호 기반 정량 분석
위양성 보정형 PCR 워크플로
전처리 포함 현장형 분자진단 시스템
저비용 위해요소(변이) 검사 체계
표적별 프라이머·프로브 설계 도구