질환·독성 기전 규명을 위한 단일세포 전사체 기반 세포 계통 분석

Single-cell transcriptome-based lineage analysis for disease and toxicology mechanisms

연구 내용

질환 조직과 독성 반응 시료의 단일세포 RNA-seq 전사체를 분석하여 세포 계통 다양성과 반응·분화 경로를 규명하는 연구

단일세포 수준에서 위 전암 병변과 위암의 전사체 이질성을 해석하고, 종양 미세환경 및 분화 계통의 변화를 세포 유형별로 구분하는 분석을 수행합니다. RNA-seq 기반 클러스터링과 계통 해석을 통해 장형·미만형 암세포가 서로 다른 전구 세포 경로를 따르는 양상을 정리합니다. 또한 단일세포 전사체를 독성유전체학에 적용하여 표적 세포 순도 불확실성 문제를 보완하는 연구 방향을 제시합니다. 이를 바탕으로 전암 단계에서의 분자 표지자 후보와 진단·기전 해석의 연결 전략을 확보하고 있습니다.

관련 프로젝트

5건

연구 흐름

초기에는 위 전암 병변과 위암을 단일세포 해상도로 분해하여 세포 유형 구성과 종양 내부 이질성을 정리하는 데 집중하였습니다. 이후 미세환경의 주요 세포 집단과 암세포의 분화 계통을 연동해 전암 단계에서의 유전자 변화와 경로별 세포 기원을 탐색하는 흐름으로 확장되었습니다. 최근에는 동일한 단일세포 전사체 분석 논리를 독성유전체학으로 전환하여, 약물 내성 및 독성 기전 해석에서의 이질성 문제를 정리하는 방향으로 연구를 수행하고 있습니다. 결과적으로 질환 기전 규명과 응용 해석을 함께 다루는 궤적을 형성하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

전암 병변 분자 표지자 패널
세포 계통 기반 조기 진단 분류
종양 미세환경 표적 치료 설계
약물 내성 기전 해석
독성 반응 세포 상태 지도
환자 맞춤형 위험도 계층화
전사체 기반 치료 반응 예측
단일세포 공정 표준화
샘플 이질성 정량화 지표
세포전이(분화) 경로 추적