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오병근 연구실
서강대학교 화공생명공학전공 오병근 교수
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CRISPR-Cas12a
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오병근 연구실

서강대학교 화공생명공학전공 오병근 교수

오병근 연구실은 생체분자-나노소재 계면을 기반으로 바이오칩과 바이오센서의 검출 성능을 향상하는 기술을 수행합니다. 특히 CRISPR-Cas12a 및 등온 핵산증폭을 이용한 엑소좀 miRNA 분석을 one-pot 방식으로 구현하고, 항체 기능화 나노입자와 효소-나노클러스터를 결합하여 전기화학 및 형광·색변환 신호를 생성하는 센싱 플랫폼을 개발합니다. 동시에 그래핀옥사이드 코팅 나노구조를 폴리머 패턴에 적용하여 세포 접착과 형태를 제어하고 골격근 분화를 유도하는 나노 바이오소재 연구도 수행합니다. 이와 병행하여 일산화탄소 등 C1 가스를 생물 촉매로 전환하는 공정에서 질량전달을 개선하는 설계와 반응 시스템 고도화를 진행합니다.

바이오칩바이오센서CRISPR-Cas12a등온 핵산증폭엑소좀 miRNA
대표 연구 분야
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CRISPR 기반 등온 증폭 일체형 엑소좀 miRNA 및 다중 바이오센싱 연구 thumbnail
CRISPR 기반 등온 증폭 일체형 엑소좀 miRNA 및 다중 바이오센싱 연구
CRISPR-based One-pot Isothermal Amplification for Exosomal miRNA and Multiplex Biosensing
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그래핀옥사이드 코팅 나노구조 기반 골격근 세포분화 조절 연구 thumbnail
그래핀옥사이드 코팅 나노구조 기반 골격근 세포분화 조절 연구
Graphene Oxide Coated Nanopillar Microgroove Arrays for Skeletal Muscle Differentiation Control
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C1 가스 생물전환을 위한 일산화탄소-포름산염 전환 및 고농도 생산 공정 연구 thumbnail
C1 가스 생물전환을 위한 일산화탄소-포름산염 전환 및 고농도 생산 공정 연구
Bioconversion of C1 Gases: CO-to-Formate and High-Titer Production Process Development
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.
주요 논문
5
논문 전체보기
1
Article
|
·
인용수 1
·
2025
Enhancing Biological CO to Formate Conversion: Application of Aerophobic Coatings to Mitigate Bubble Coalescence
Taehwan Kim, Jiung Yun, Jang-Seob Lee, Myeong-Jun Lee, Jung Kyu Kim, Jinwon Lee, Yong Hwan Kim, Jeong‐Geol Na, Byung‐Keun Oh
IF 7.6 (2025)
ACS Sustainable Chemistry & Engineering
포르메이트를 형성하기 위한 일산화탄소(CO)의 생물학적 전환은 버블(기포) 합체로 인해 기-액 간 물질전달 한계가 발생함에 따라 저해된다. 이는 기체 교환을 위한 계면적을 감소시킨다. 본 연구에서는 공기리프트(bioreactor)에 천공(b) 배플(perforated baffle)을 적용하고, 그 위에 혐기성(air-ophobic) 코팅을 도입하는 새로운 접근을 제시한다. 혐기성 코팅은 버블 합체를 억제하여 물질전달 효율을 향상시키고 CO의 포르메이트 전환 속도를 증가시킨다. 먼저, 효소 반응에서 CO 기체의 물질전달 속도가 최적 조건에서 최대 생산성을 결정한다는 것을 확인하였다. 이어서 천공 배플에 대한 혐기성 코팅 조건을 최적화하여 효과적인 기포 파쇄를 달성하였다. 최적화된 코팅 조건의 혐기성 코팅 천공 배플을 반응기에 설치함으로써 효율적인 기포 파쇄를 유도하고, 기포 크기를 감소시키며, 기-액 물질전달 계수를 증가시켰다. 그 결과 CO-포르메이트 전환에서 최대 부피 생산성 60.4 mM/h를 달성하였으며, 이는 코팅 배플이 없는 바이오리액터 대비 72% 증가한 값이다. 이러한 유의미한 개선은 기-액 물질전달을 향상시키는 데서 혐기성 코팅의 효과를 보여주며, 생물학적 기체 전환 산업에서 효율과 확장성을 높이기 위한 새로운 전략을 제공한다.
https://doi.org/10.1021/acssuschemeng.5c00198
Bubble
Formate
Coalescence (physics)
Nanotechnology
Materials science
Chemical engineering
Biochemical engineering
Chemistry
Process engineering
Catalysis
2
Article
|
인용수 12
·
2025
Hourglass-inspired total analysis system for the sensitive colorimetric detection of exosomal miRNA using the CRISPR-Cas12a system with isothermal amplification
Myeong-Jun Lee, Jeong‐Hyeop Shin, Seunghun Jung, Jeong‐Woo Choi, Jeong-Woo Choi, H. R. Ahn, Jin-Ha Choi, Jin-Ha Choi, Byung‐Keun Oh
IF 12.5 (2025)
Chemical Engineering Journal
• 세포배양 배지로부터 엑소좀 miRNA 분석을 위해 새로운 H-TAS(hourglass-inspired total analysis system)가 개발되었다. • H-TAS는 간단한 뒤집기 동작 하나로 원팟(one-pot)에서 필요한 모든 공정을 수행하였다. • 나노프로브/CRIPSR-Cas12a/isothermal amplification의 조합을 통해 H-TAS를 구현하였다. • H-TAS는 190분 내에 Exo-miR-21을 우수한 감도로 분석하였으며(검출한계, LOD = 1.308 fM), • H-TAS는 복잡한 생물학적 시료로부터 엑소좀 miR-21도 성공적으로 분석하였다. 규칙적으로 군집된 짧은 회문 반복서열-CRISPR(CRISPR) 계열의 CRISPR-Cas 시스템은(클러스터드 정규 간격 짧은 회문 반복-카스; clustered regularly interspaced short palindromic repeat-Cas) 등온 핵산 증폭(isothermal nucleic acid amplification)과 결합될 때, 서열 특이적 정보를 전달(transducing)하는 강력한 센싱 메커니즘을 제공한다. 그러나 CRISPR-Cas 시스템을 이용한 엑소좀 miRNA(Exo-miRs) 분석은 여전히 어렵고, 외부에서 엑소좀 분리/농축 또는 복잡한 신호 증폭 및 검출과 같은 복잡한 단계가 종종 필요하다. 본 연구에서는 CRISPR-Cas12a 시스템과 등온 핵산 증폭을 이용하여 원팟(one-pot) 조건에서 Exo-miR을 쉽고 민감하게 색도계(colorimetric)로 검출하기 위한 hourglass-inspired total analysis system(H-TAS)를 제안한다. 이 장치에서는 전체 시스템이 두 가지 혁신적 시스템의 연속적 구성에 의해 작동한다: (i) 촉매/항체가 풍부하게 결합된 금-위성-자기 나노입자(promoter/antibody-enriched gold-satellite-magnetic nanoparticles)를 이용한 엑소좀 분리/농축 및 원팟 등온 Exo-miR 증폭, 그리고 (ii) 다중 효소가 캡슐화된 나노입자(multi-enzyme-encapsulated nanoparticles)와 CRISPR-Cas12a 시스템을 활용한 향상된 색도계 신호 분석이다. 또한 두 시스템의 연속적 결합을 용이하게 하고 사용성을 높이기 위해, 반응 바이알을 바꾸지 않고도 Exo-miRs를 검출하기 위해 모든 분석 단계를 수행할 수 있는 hourglass-inspired 장치를 개발하였다. 그 결과, 개발된 H-TAS는 단 한 번의 단순한 뒤집기 동작만으로 Exo-miR 검출에 필요한 모든 공정을 손쉽게 진행할 수 있다. 개념 증명(proof-of-concept)으로서 우리는 H-TAS를 miR-21 및 Exo-miR-21 분석에 적용하고, 190분(시료-투-답(sample-to-answer) 시간) 내에 적절한 특이성 및 감도를 확인하였다(각각 검출한계 = 0.711 fM, 1.308 fM). 또한 특수 장비가 필요하지 않았다. 더 나아가, 제안된 장치의 적용 가능성은 다양한 유방 세포 유래 엑소좀과 임상 시료로부터 Exo-miR-21을 분석함으로써 검증되었다. 따라서 H-TAS는 매우 높은 민감도, 선택성, 간편함 및 시간 효율성을 갖춘 방식으로 Exo-miRs를 검출하기 위한 유망한 플랫폼이 될 수 있다.
https://doi.org/10.1016/j.cej.2025.162729
CRISPR
Loop-mediated isothermal amplification
Hourglass
Trans-activating crRNA
microRNA
Isothermal process
Chemistry
Computational biology
Nanotechnology
Biological system
3
Article
|
·
인용수 6
·
2025
Two-stage continuous CO fermentation process strategy for high-titer bioethanol production using Clostridium autoethanogenum
Tae-Hwan Kim, Jang-Seob Lee, Myeong-Jun Lee, Jinwon Lee, Young‐Kee Kim, Jeong‐Geol Na, Byung‐Keun Oh
IF 8.2 (2025)
Bioresource Technology
https://doi.org/10.1016/j.biortech.2025.132152
Biofuel
Renewable energy
Fossil fuel
Carbon monoxide
Stage (stratigraphy)
Fermentation
Environmental science
Biomass (ecology)
Pulp and paper industry
Chemistry
최신 정부 과제
18
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1
2024년 7월-2028년 12월
|9,795,000,000원
부생 CO/CO2 효소전환 통합 시스템 개발 및 고도화
o 부생가스내 CO/CO2 효소 전환 개미산염 생산 통합 시스템 고도화 및 고부가가가치 화합물 생산 기반기술 개발- 부생가스 효소 전환 통합 시스템 및 개미산염 고부가화 기술 개발- 철강 부생가스 생물전환을 위한 핵심 효소 촉매 개발- 개미산을 단일탄소원으로 고부가가치 산물 생산 균주 구축- 부생가스를 활용한 핵심기술 고도화 및 상용화를 위한 현장실증- 효...
일산화탄소
효소
미생물
부생가스
생물공정
2
2022년 3월-2026년 2월
|376,308,000원
종양 유래 엑소좀 다종 바이오마커 동시 검출용 등온 핵산증폭 바이오칩 플랫폼 개발
등온 핵산 증폭/검출이 동시에 가능한 전기 회로 기반 디바이스를 개발하고, 이를 이용하여 암질환 관련 엑소좀의 표면 단백질 및 miRNA를 핵산 증폭 시스템을 이용하여 엑소좀 유래의 다종 바이오마커의 표준화된 정량/정성 분석이 가능한 All-in-one 디바이스 기반의 진단용 바이오칩을 제작한다.
엑소좀
등온 핵산 증폭
전기회로
마이크로플루이딕
엑소좀 표면 단백질
3
2021년 4월-2025년 12월
|8,717,947,000원
녹색성장을 위한 CCUS 전문인력양성
녹색성장을 위한 CCUS 생태계의 조성에 기여할 수 있는 다학제 인력양성시스템 개발 - CCUS포럼의 네트워크 및 CCUS 데이터베이스 구축을 통한 실질적인 교류시스템 - 클러스터 중심의 교육 및 기술개발을 통한 융복합, 현장요구형 인력 양성
이산화탄소포집
이산화탄소저장
이산화탄소활용
인력양성
클러스터
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상태출원연도과제명출원번호상세정보
공개2024정확한 사람 세포 유래 엑소좀 바이오마커의 분석을 위해 소 태아 혈청 유래 엑소좀의 영향을 최소화하는 방법1020240121229
공개2024이온성 액체를 이용한 바이오 에탄올 연속 생산 방법1020240044260
공개2024일산화탄소를 이용한 개미산 연속 생산 시스템 및 개미산 연속 생산 방법1020240018315
전체 특허

정확한 사람 세포 유래 엑소좀 바이오마커의 분석을 위해 소 태아 혈청 유래 엑소좀의 영향을 최소화하는 방법

상태
공개
출원연도
2024
출원번호
1020240121229

이온성 액체를 이용한 바이오 에탄올 연속 생산 방법

상태
공개
출원연도
2024
출원번호
1020240044260

일산화탄소를 이용한 개미산 연속 생산 시스템 및 개미산 연속 생산 방법

상태
공개
출원연도
2024
출원번호
1020240018315