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정순영 연구실
고려대학교 컴퓨터학과
정순영 교수
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정순영 연구실

고려대학교 컴퓨터학과 정순영 교수

정순영 연구실은 데이터베이스 시스템, 공간 데이터 처리, 그리드·P2P 기반 분산시스템을 중심으로 대규모 데이터 관리와 고성능 질의 처리 기술을 연구해 왔으며, 최근에는 딥러닝 기반 오디오·영상 신호처리와 지능형 멀티미디어 분석으로 연구 영역을 확장하여 이론적 알고리즘 연구와 실제 응용 시스템 개발을 함께 수행하는 컴퓨터 분야 연구실이다.

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데이터베이스 시스템과 공간 데이터 관리
주요 논문
5
논문 전체보기
1
article
|
hybrid
·
인용수 26
·
2023
TRIM22 facilitates autophagosome-lysosome fusion by mediating the association of GABARAPs and PLEKHM1
Hansol Heo, Hyungsun Park, Myung‐Shin Lee, Jongyoon Kim, Juyeong Kim, Soonyoung Jung, Sun Kyeon Kim, Seongju Lee, Jaerak Chang
IF 14.3
Autophagy
Tripartite motif (TRIM) proteins are a large family of E3 ubiquitin ligases implicated in antiviral defense systems, tumorigenesis, and protein quality control. TRIM proteins contribute to protein quality control by regulating the ubiquitin-proteasome system, endoplasmic reticulum-associated degradation, and macroautophagy/autophagy. However, the detailed mechanisms through which various TRIM proteins regulate downstream events have not yet been fully elucidated. Herein, we identified a novel function of TRIM22 in the regulation of autophagy. TRIM22 promotes autophagosome-lysosome fusion by mediating the association of GABARAP family proteins with PLEKHM1, thereby inducing the autophagic clearance of protein aggregates, independent of its E3 ubiquitin ligase activity. Furthermore, a TRIM22 variant associated with early-onset familial Alzheimer disease interferes with autophagosome-lysosome fusion and autophagic clearance. These findings suggest TRIM22 as a critical autophagic regulator that orchestrates autophagosome-lysosome fusion by scaffolding autophagy-related proteins, thus representing a potential therapeutic target in neurodegenerative diseases.<b>Abbreviations:</b> AD: Alzheimer disease; ADAOO: AD age of onset; AICD: APP intracellular domain; APP: amyloid beta precursor protein; BSA: bovine serum albumin; cDNAs: complementary DNAs; CQ: chloroquine; CTF: carboxyl-terminal fragment; EBSS: Earle's balanced salt solution; GABARAP: GABA type A receptor-associated protein; GST: glutathione S-transferase; HA: hemagglutinin; HOPS: homotypic fusion and protein sorting; IFN: interferon; IL1A/IL-1α: interleukin 1 alpha; KO: knockout; MTORC1: mechanistic target of rapamycin kinase complex 1; NFKBIA/IκBα: NFKB inhibitor alpha; NFE2L2/NRF2: NFE2 like bZIP transcription factor; PBS: phosphate-buffered saline; PI3K: class I phosphoinositide 3-kinase; PLA: proximity ligation assay; PLEKHM1: pleckstrin homology and RUN domain containing M1; PSEN1: presenilin 1; SEM: standard errors of the means; SNAREs: soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptors; SNCA: synuclein alpha; SNP: single nucleotide polymorphism; TBS: tris-buffered saline; TNF/TNF-α: tumor necrosis factor; TRIM: tripartite motif; ULK1: unc-51 like autophagy activating kinase 1; WT: wild-type.
https://doi.org/10.1080/15548627.2023.2287925
Autophagy
Biology
Lysosome
Cell biology
Autophagosome
TFEB
Genetics
Biochemistry
2
article
|
인용수 12
·
2022
SF3B4 Depletion Retards the Growth of A549 Non-Small Cell Lung Cancer Cells via UBE4B-Mediated Regulation of p53/p21 and p27 Expression
Hyungmin Kim, Jeehan Lee, Soonyoung Jung, Hye Hyeon Yun, Jeong‐Heon Ko, Jeong Hwa Lee
IF 6.5
Molecules and Cells
Splicing factor B subunit 4 (SF3B4), a component of the U2-pre-mRNA spliceosomal complex, contributes to tumorigenesis in several types of tumors. However, the oncogenic potential of SF3B4 in lung cancer has not yet been determined. The <i>in vivo</i> expression profiles of SF3B4 in non-small cell lung cancer (NSCLC) from publicly available data revealed a significant increase in SF3B4 expression in tumor tissues compared to that in normal tissues. The impact of SF3B4 deletion on the growth of NSCLC cells was determined using a siRNA strategy in A549 lung adenocarcinoma cells. SF3B4 silencing resulted in marked retardation of the A549 cell proliferation, accompanied by the accumulation of cells at the G0/G1 phase and increased expression of p27, p21, and p53. Double knockdown of SF3B4 and p53 resulted in the restoration of p21 expression and partial recovery of cell proliferation, indicating that the p53/p21 axis is involved, at least in part, in the SF3B4-mediated regulation of A549 cell proliferation. We also provided ubiquitination factor E4B (UBE4B) is essential for p53 accumulation after SF3B4 depletion based on followings. First, co-immunoprecipitation showed that SF3B4 interacts with UBE4B. Furthermore, UBE4B levels were decreased by SF3B4 depletion. UBE4B depletion, in turn, reproduced the outcome of SF3B4 depletion, including reduction of polyubiquitinated p53 levels, subsequent induction of p53/p21 and p27, and proliferation retardation. Collectively, our findings indicate the important role of SF3B4 in the regulation of A549 cell proliferation through the UBE4B/p53/p21 axis and p27, implicating the therapeutic strategies for NSCLC targeting SF3B4 and UBE4B.
https://doi.org/10.14348/molcells.2022.0037
A549 cell
Gene knockdown
Cell growth
Carcinogenesis
Cancer research
Gene silencing
Lung cancer
Biology
Cell cycle
Cell
3
article
|
green
·
인용수 20
·
2020
Hereditary spastic paraplegia SPG8 mutations impair CAV1-dependent, integrin-mediated cell adhesion
Seongju Lee, Hyungsun Park, Peng‐Peng Zhu, Soonyoung Jung, Craig Blackstone, Jaerak Chang
IF 6.6
Science Signaling
Mutations in <i>WASHC5</i> (also known as <i>KIAA0196</i>) cause autosomal dominant hereditary spastic paraplegia (HSP) type SPG8. WASHC5, commonly called strumpellin, is a core component of the Wiskott-Aldrich syndrome protein and SCAR homolog (WASH) complex that activates actin nucleation at endosomes. Although various other cellular roles for strumpellin have also been described, none account for how SPG8-associated mutations lead to HSP. Here, we identified protein interactors of the WASH complex by immunoprecipitation and mass spectrometry and assessed the functions of strumpellin in cultured cells using both overexpression and RNA interference along with cell-spreading assays to investigate cell adhesion. We uncovered a decrease in CAV1 protein abundance as well as endosomal fission defects resulting from pathogenic SPG8 mutations. CAV1, a key component of caveolae, interacted with strumpellin in cells, and strumpellin inhibited the lysosomal degradation of CAV1. SPG8-associated missense mutations in strumpellin did not rescue endosomal tubulation defects, reduction in CAV1 protein abundance, or integrin-mediated cell adhesion in strumpellin-deficient cells. Mechanistically, we demonstrated that the WASH complex maintained CAV1 and integrin protein amounts by inhibiting their lysosomal degradation through its endosomal actin nucleation activity. In addition, the interaction of strumpellin with CAV1 stimulated integrin recycling, thereby promoting cell adhesion. These findings provide a molecular link between <i>WASHC5</i> mutations and impairment of CAV1- and integrin-mediated cell adhesion, providing insights into the cellular pathogenesis of SPG8.
https://doi.org/10.1126/scisignal.aau7500
Hereditary spastic paraplegia
Integrin
Cell adhesion
Paraplegia
Cell biology
Mutation
Spastic
Adhesion
Cell adhesion molecule
Biology
정부 과제
24
과제 전체보기
1
2024년 4월-2027년 4월
|241,816,000
다방향 영상·음향에 대한 음원 분리 및 로컬라이제이션 모델 연구
본 연구의 최종 목표는 공통의 관심 영역으로부터 여러 방향으로 수집된 영상/음향 데이터를 입력받았을 때, 다방향 영상·음향 기반의 음원 분리/로컬라이제이션 (multi-faceted audio-visual source separation and localization)을 수행할 수 있는 딥러닝 기반 모델을 개발하는 것임.
신호처리
다방향 영상·음향
음원 분리
소스 로컬라이제이션
딥러닝
2
주관|
2021년 2월-2024년 2월
|183,612,000
딥러닝 기반의 다중음원 오디오에 대한 음원선별적 편집 모델 연구
연구목표 달성을 위해 다음 세부 모델 및 프레임워크를 연구/개발함: - 다중음원 데이터셋 기반 훈련 프레임워크 (다중음원 데이터셋은 음원 별 오디오가 제공하지 않는다고 가정) - 잠재 음원성분 분석모델 - Language Model 기반 편집명령 해석모델 - 선별적 편집을 위한 Attention 기반 변조모델
심층학습
음향신호처리
잠재 음원성분
음원선별적 편집
음원분리
어텐션네트워크
3
주관|
2021년 2월-2024년 2월
|160,020,000
딥러닝 기반의 다중음원 오디오에 대한 음원선별적 편집 모델 연구
딥러닝 기반의 음원선별적 편집 모델 학습을 위한 세부연구 내용은 다음과 같음. - 세부연구 1: 다중음원 데이터셋 기반 훈련 프레임워크 연구 - 음원선별적 편집을 위한 데이터셋은 존재하지 않는 것으로 파악됨. 이러한 데이터를 on-the-fly로 생성하여 학습하는 다중음원 데이터셋 기반 훈련 프레임워크를 개발함. - 세부연구 2: 잠재 음원성분 분석 기반 음원선별적 편집 모델 연구 - 잠재 음원성분 분석 기법을 세부연구 1의 프레임워크에 추가하여, 음원을 구성하는 세분된 성분을 attention 기반으로 추출하여 편집 대상 음원에 대한 선별 능력을 향상시킴. 또한, 전문지식이 없는 사용자를 위해 텍스트 기반 명령을 통한 음원선별적 편집도 제공함.
심층학습
음향신호처리
잠재 음원성분
음원선별적 편집
음원분리
어텐션네트워크
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상태출원연도과제명출원번호상세정보
취하2018메신저 CHAT BOT을 이용한 화학사고 대응정보 검색 서비스1020180134568
등록2018클러스터링 알고리즘의 비교 학습 장치 및 방법, 그 방법을 수행하기 위한 기록 매체1020180134548
등록2018GIS 기반 화학안전관리 장치 및 방법1020180089235
전체 특허

메신저 CHAT BOT을 이용한 화학사고 대응정보 검색 서비스

상태
취하
출원연도
2018
출원번호
1020180134568

클러스터링 알고리즘의 비교 학습 장치 및 방법, 그 방법을 수행하기 위한 기록 매체

상태
등록
출원연도
2018
출원번호
1020180134548

GIS 기반 화학안전관리 장치 및 방법

상태
등록
출원연도
2018
출원번호
1020180089235