결장암은 전장유전체(whole genome) 시퀀싱을 포함한 다양한 분자 기법을 통해 잘 연구되어 왔다. 그러나 결장암에서 가장 중요한 예후 인자인 림프절(LN) 침범 여부를 예측하는 데 사용할 수 있는 유전적 표지자는 아직 확인되지 않았다. 본 연구에서는 차등 유전자 발현 및 네트워크 분석을 통해 LN(+)와 LN(-) 결장암 환자를 비교하였다. 결장암 유전자 발현 데이터는 The Cancer Genome Atlas에서 획득하였고, 이를 LN(+)와 LN(-)의 두 군으로 분류하였다. 유전자 발현 네트워크는 LASSO(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator) 회귀를 사용하여 구축하였다. APBB1, AHSA2, ZNF767, JAK2와 같은 허브 유전자들이 높은 수준으로 차등 발현됨을 확인하였다. AHSA2, CDK10, CWC22 등 선택된 허브 유전자를 이용한 생존분석 결과, 이들의 발현 수준이 결장암 환자의 생존율과 유의한 관련성을 보였으며, 이는 예후 표지자로서의 가능성을 시사한다. 또한 결장암에서 허브 유전자와 LN 침범 사이의 조절 관계를 규명하기 위해 각 군에서 선택된 허브 유전자를 대상으로 단백질-단백질 상호작용 네트워크, GO 농축, KEGG 경로 분석을 수행하였고, 이러한 분석들은 LN(-)군과 LN(+)군 간의 차이를 보여주었다. 본 네트워크 분석은 결장암 치료를 위한 새로운 후보 유전자 탐색의 범위를 좁히는 데 도움을 줄 수 있으며, 동시에 LN 침범의 기저가 되는 생물학적 과정에 대한 이해를 향상시킬 수 있을 것이다. 모든 R 구현 코드는 저널 웹사이트의 부록 자료(Supplementary Materials)로 제공된다.

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