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양진아 연구실
제주대학교 화공그린에너지학과 양진아 교수
합성생물학
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양진아 연구실

제주대학교 화공그린에너지학과 양진아 교수

양진아 연구실은 세포·분자 수준의 인식과 공정 기술을 함께 다루는 연구를 수행합니다. CRISPR/dCas9의 염기서열 특이 결합을 기반으로 PCR 비의존 유전자 변이 진단을 위한 마이크로칩 분석을 구현하고, ion concentration polarization 기반 농축으로 표적 검출 성능을 확보합니다. 또한 합성생물학 관점에서 세균의 번역 품질을 제어하여 full-length translation을 향상시키는 전략을 개발합니다. 더불어 해조류를 원료로 한 통합생물공정에서 3-하이드록시프로피온산, 젖산, 이타콘산 등 유기산을 생산해 석유화학 소재 대체용 친환경 플라스틱 원료로 연결하는 기술을 수행합니다.

합성생물학CRISPR/dCas9PCR-free 진단단백질 번역 품질 제어통합생물공정
대표 연구 분야
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CRISPR/dCas9 기반 PCR-Free 유전자 변이 진단 thumbnail
CRISPR/dCas9 기반 PCR-Free 유전자 변이 진단
CRISPR/dCas9 PCR-Free Oncogenic Mutation Detection
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합성생물학 기반 세균 단백질 번역 품질 제어 thumbnail
합성생물학 기반 세균 단백질 번역 품질 제어
Synthetic Protein Quality Control for Full-Length Translation in Bacteria
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해양바이오 기반 통합생물공정 유기산 및 친환경 플라스틱 원료 생산 thumbnail
해양바이오 기반 통합생물공정 유기산 및 친환경 플라스틱 원료 생산
Integrated Marine Bioprocess for Organic Acids and Eco-Friendly Plastic Alternatives
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.
주요 논문
2
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1
Article
|
·
인용수 9
·
2023
dCas9-Mediated PCR-Free Detection of Oncogenic Mutation by Nonequilibrium Nanoelectrokinetic Selective Preconcentration
Sang‐Jun Lee, Seongjun Hong, Jihee Park, Youngil Koh, Hyomin Lee, Jina Yang, Sang Woo Seo, Sung Jae Kim
IF 6.7 (2023)
Analytical Chemistry
본 연구에서의 최첨단 나노전기삼투(나노일렉트로키네틱) 기술은 오류가 없는 PCR 절차 없이 단시간 내에 DNA의 극미량 종양유전자 변이를 검출해야 하는 현재의 임상적 요구에 대한 획기적 돌파구를 제공한다. 본 연구에서는 CRISPR/dCas9의 서열 특이적 표지(labeling) 체계와 이온 농도 편광(ion concentration polarization, ICP) 메커니즘을 결합하여 표적 DNA 분자를 신속한 검출을 위해 각각의 방식으로 사전 농축하였다. dCas9의 돌연변이 특이적 결합에 의해 유발되는 이동도(mobility) 변화를 이용하여 마이크로칩에서 변이 DNA와 정상 DNA를 구별하였다. 이 기술을 바탕으로, 발암(암발생)의 지표인 EGFR DNA에서 dCas9 매개 단일 염기 치환(single base substitution, SBS)의 1분 내 검출을 성공적으로 입증하였다. 또한 ICP의 뚜렷한 사전 농축 메커니즘을 통해, 표적 변이의 농도가 0.1%에 불과하더라도 상용 임신 테스트 키트와 같이 한눈에 표적 DNA의 존재/부재를 판별할 수 있었는데, 양성은 두 줄, 음성은 한 줄로 나타났다.
https://doi.org/10.1021/acs.analchem.2c05539
Chemistry
DNA
Mutant
Intercalation (chemistry)
Molecular biology
Biophysics
Computational biology
Gene
Biochemistry
2
Article
|
·
인용수 19
·
2021
Synthetic protein quality control to enhance full-length translation in bacteria
Jina Yang, Yong Hee Han, Jongwon Im, Sang Woo Seo
IF 16.174 (2021)
Nature Chemical Biology
https://doi.org/10.1038/s41589-021-00736-3
Protein biosynthesis
Translation (biology)
Messenger RNA
Transcription (linguistics)
RNA
Biology
Biochemistry
Cell biology
Computational biology
Gene
최신 정부 과제
7
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1
협동|
2022년 4월-2026년 12월
|801,000,000원
석유화학 소재 대체 친환경 해양바이오 플라스틱 소재 개발
□ 바이오 플라스틱 생산의 필요성 석유 기반 플라스틱 생산 및 후처리 과정 중 발생하는 수많은 환경 문제를 해결하기 위해 바이오 플라스틱의 생산은 필연적으로 달성되어야 하는 과제임. 현재 석유 기반 공정을 통해 생산되는 플라스틱은 지구 온난화 및 미세 플라스틱의 주요 원인임. 이를 해결하기 위해 석유 기반 플라스틱의 대체재로써 바이오 플라스틱을 도입하고자 하는 노력이 지속되고 있음. □ 바이오 플라스틱 생산 공정을 위한 해양 바이오매스의 활용 값비싼 육상계 바이오매스를 원료로 사용하여 경제성이 떨어지는 현행 바이오 플라스틱 생산 공정을 개선하기 위해 해양 바이오매스를 대체 원료로 사용할 필요성이 있음. 바이오 플라스틱의 생산량은 증가하고 있으나, 경제성이 떨어져 여전히 총 플라스틱 생산량의 2% 수준임. 현재 상용화된 생물 기반 플라스틱 생산 공정은 육상계 바이오매스 중 식용작물을 원료로 이루어지기 때문에 전체 공정 비용 중 큰 부분을 비싼 원료비가 차지하고 있음. 육상계 바이오매스를 이용한 바이오 플라스틱 단량체 생산의 윤리적, 경제적 문제를 극복할 수 있는 대체 원료로써 해조류 바이오매스가 각광받고 있음. 특히, 대한민국을 포함한 아시아 국가의 해조류 생산량 및 양식업 부산물 폐기량이 증가하는 추세인 바, 양식 부산물을 자원화하는 방안으로 본 기술의 성과를 활용할 수 있음. 더불어, 최근 몇 년간 이상증식하여 해양 생태계에 피해를 주고 있는 해적해조류도 바이오매스 공급원으로 활용할 수 있음. 이처럼 국내에서 값싼 해조류 부산물 및 해적해조류의 수급이 지속적으로 가능하기 때문에, 이를 원료로 한 바이오 플라스틱 생산 공정은 경제성 측면에서 다른 원료를 쓰는 것에 비해 비교우위를 점할 수 있음. □ 경제성 있는 바이오 플라스틱 단량체 생산을 위한 해양 바이오매스 직접 활용의 중요성 해조류를 이용한 바이오 플라스틱 생산 공정의 상용화를 위해서는 전체 공정 비용의 상승을 야기하는 해조류 전처리 과정이 생략된 해조류 직접 활용 공정의 개발이 필요함. 해조류의 특성상 건조, 탈염, 산 처리나 효소 처리를 통한 당화 등 복잡한 전처리 공정이 필수적이었다는 한계를 가지고 있음. 특히, 당화 과정에는 막대한 비용이 소모되어 공정의 경제성을 낮추는데 주요 원인이 됨. 본 연구개발에서 사용하고자 하는 Vibrio sp. dhg 균주는 고농도의 염에서도 잘 생육하는 특성을 가지고 있으며 동시에 해조류 부산물의 대부분을 차지하는 갈조류의 대사능이 매우 뛰어나기 때문에 전처리 없이 갈조류 포함한 대부분의 해조류 바이오매스를 빠르게 대사할 수 있어 별도 전처리없는 해조류 바이오매스의 직접 전환이 가능함. 해당 균주를 활용한 통합생물공정의 구축을 통해서 경제성 있는 바이오 플라스틱 단량체를 생산할 수 있을 것으로 기대됨. 따라서, 본 연구팀은 해조류 바이오매스의 직접 전환이 가능한 균주를 활용하여 해조류로부터 유망한 바이오 플라스틱 단량체(이타콘산, 3-HP, 젖산)를 효율적으로 생산하는 공정을 구축한 후, 각 단량체를 분리정제 및 중합하고 마지막으로는 다양한 플라스틱을 블렌딩하여 다양한 물성의 바이오 플라스틱을 생산하는 제작하는 공정을 개발하는 것을 목표로 함.
해조류
통합생물공정
3-하이드록시프로피온산
젖산
이타콘산
2
2022년 4월-2026년 12월
|1,611,000,000원
석유화학 소재 대체 친환경 해양바이오 플라스틱 소재 개발
본 연구팀은 해조류 바이오매스의 직접 전환이 가능한 균주를 활용하여 해조류로부터 유망한 바이오 플라스틱 단량체(이타콘산, 3-HP, 젖산)를 효율적으로 생산하는 공정을 구축하는 것을 목표로 함. 해당 목표를 위해서 본 연구팀은 고효율 해조류 직접 전환 균주의 구축 및 생산 능력 최대화를 위한 발효 공정의 최적화 기술을 개발하고자 함. 이에 더불어, 본 연구...
해조류
통합생물공정
3-하이드록시프로피온산
젖산
이타콘산
3
협동|
2022년 4월-2026년 12월
|300,000,000원
석유화학 소재 대체 친환경 해양바이오 플라스틱 소재 개발
□ 바이오 플라스틱 생산의 필요성 석유 기반 플라스틱 생산 및 후처리 과정 중 발생하는 수많은 환경 문제를 해결하기 위해 바이오 플라스틱의 생산은 필연적으로 달성되어야 하는 과제임. 현재 석유 기반 공정을 통해 생산되는 플라스틱은 지구 온난화 및 미세 플라스틱의 주요 원인임. 이를 해결하기 위해 석유 기반 플라스틱의 대체재로써 바이오 플라스틱을 도입하고자 하는 노력이 지속되고 있음. □ 바이오 플라스틱 생산 공정을 위한 해양 바이오매스의 활용 값비싼 육상계 바이오매스를 원료로 사용하여 경제성이 떨어지는 현행 바이오 플라스틱 생산 공정을 개선하기 위해 해양 바이오매스를 대체 원료로 사용할 필요성이 있음. 바이오 플라스틱의 생산량은 증가하고 있으나, 경제성이 떨어져 여전히 총 플라스틱 생산량의 2% 수준임. 현재 상용화된 생물 기반 플라스틱 생산 공정은 육상계 바이오매스 중 식용작물을 원료로 이루어지기 때문에 전체 공정 비용 중 큰 부분을 비싼 원료비가 차지하고 있음. 육상계 바이오매스를 이용한 바이오 플라스틱 단량체 생산의 윤리적, 경제적 문제를 극복할 수 있는 대체 원료로써 해조류 바이오매스가 각광받고 있음. 특히, 대한민국을 포함한 아시아 국가의 해조류 생산량 및 양식업 부산물 폐기량이 증가하는 추세인 바, 양식 부산물을 자원화하는 방안으로 본 기술의 성과를 활용할 수 있음. 더불어, 최근 몇 년간 이상증식하여 해양 생태계에 피해를 주고 있는 해적해조류도 바이오매스 공급원으로 활용할 수 있음. 이처럼 국내에서 값싼 해조류 부산물 및 해적해조류의 수급이 지속적으로 가능하기 때문에, 이를 원료로 한 바이오 플라스틱 생산 공정은 경제성 측면에서 다른 원료를 쓰는 것에 비해 비교우위를 점할 수 있음. □ 경제성 있는 바이오 플라스틱 단량체 생산을 위한 해양 바이오매스 직접 활용의 중요성 해조류를 이용한 바이오 플라스틱 생산 공정의 상용화를 위해서는 전체 공정 비용의 상승을 야기하는 해조류 전처리 과정이 생략된 해조류 직접 활용 공정의 개발이 필요함. 해조류의 특성상 건조, 탈염, 산 처리나 효소 처리를 통한 당화 등 복잡한 전처리 공정이 필수적이었다는 한계를 가지고 있음. 특히, 당화 과정에는 막대한 비용이 소모되어 공정의 경제성을 낮추는데 주요 원인이 됨. 본 연구개발에서 사용하고자 하는 Vibrio sp. dhg 균주는 고농도의 염에서도 잘 생육하는 특성을 가지고 있으며 동시에 해조류 부산물의 대부분을 차지하는 갈조류의 대사능이 매우 뛰어나기 때문에 전처리 없이 갈조류 포함한 대부분의 해조류 바이오매스를 빠르게 대사할 수 있어 별도 전처리없는 해조류 바이오매스의 직접 전환이 가능함. 해당 균주를 활용한 통합생물공정의 구축을 통해서 경제성 있는 바이오 플라스틱 단량체를 생산할 수 있을 것으로 기대됨. 따라서, 본 연구팀은 해조류 바이오매스의 직접 전환이 가능한 균주를 활용하여 해조류로부터 유망한 바이오 플라스틱 단량체(이타콘산, 3-HP, 젖산)를 효율적으로 생산하는 공정을 구축한 후, 각 단량체를 분리정제 및 중합하고 마지막으로는 다양한 플라스틱을 블렌딩하여 다양한 물성의 바이오 플라스틱을 생산하는 제작하는 공정을 개발하는 것을 목표로 함.
해조류
통합생물공정
3-하이드록시프로피온산
젖산
이타콘산
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상태출원연도과제명출원번호상세정보
공개20233-하이드록시프로피온산 생산을 감지하는 비브리오속 미생물용 전사인자 기반 바이오센서 및 이의 용도1020230182223
공개2023이타콘산 생산을 감지하는 비브리오속 미생물용 전사인자 기반 바이오센서 및 이의 용도1020230182222
등록2013리보스위치를 이용한 L-트립토판 고생산균 스크리닝 방법1020130069803
전체 특허

3-하이드록시프로피온산 생산을 감지하는 비브리오속 미생물용 전사인자 기반 바이오센서 및 이의 용도

상태
공개
출원연도
2023
출원번호
1020230182223

이타콘산 생산을 감지하는 비브리오속 미생물용 전사인자 기반 바이오센서 및 이의 용도

상태
공개
출원연도
2023
출원번호
1020230182222

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상태
등록
출원연도
2013
출원번호
1020130069803