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신근유 연구실
서울대학교 생명과학부 신근유 교수
Organoid
Assembloids
Stem cell
기본 정보
연구 분야
프로젝트
논문
구성원

신근유 연구실

서울대학교 생명과학부 신근유 교수

신근유 연구실은 ESC·iPSC 및 성체줄기세포로부터 오가노이드와 어셈블로이드를 구축하여 인간 질병을 모사하는 연구를 수행합니다. 종양에서는 종양기질세포를 포함한 환자유래 어셈블로이드로 TME 상호작용을 재구성하고, 잉크젯 기반 단일세포 분배로 종양 내 이질성을 정량화합니다. 뇌에서는 단일 로제트 기반 모듈형 재구성으로 균일한 forebrain/코르텍스 어셈블로이드를 만들고, AAVS1 안전대 표적 삽입을 통해 ChR2를 안정 발현한 빛 유도 조절 시스템으로 신경회로 활성화를 일관되게 측정합니다. 또한 전주기 줄기세포 ATLAS와 다중오믹스 분석을 통해 세포군 발굴 및 질환모델 개발에 필요한 세포 상태 정보를 확보합니다.

OrganoidAssembloidsStem cellTumor microenvironment (TME)Intratumoral heterogeneity
대표 연구 분야
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환자유래 종양 오가노이드·어셈블로이드 기반 종양기질 상호작용과 약제저항성 제어 연구 thumbnail
환자유래 종양 오가노이드·어셈블로이드 기반 종양기질 상호작용과 약제저항성 제어 연구
Patient-derived tumor organoids and assembloids for TME interactions and drug resistance
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.

5개년 연도별 논문 게재 수

15총합

5개년 연도별 피인용 수

817총합
주요 논문
5
논문 전체보기
1
article
|
인용수 8
·
2025
Generation of prostate cancer assembloids modeling the patient-specific tumor microenvironment
J.-H. Lee, Yun‐Hee Kim, Cheolmin Matthew Lee, Seong Soo Jeon, H.K. Seo, Jong Won Lee, Jungmin Choi, Minyong Kang, Eunjee Kim, Kunyoo Shin
IF 3.7 (2025)
PLoS Genetics
Prostate cancer (PC) is the most frequently diagnosed malignancy among men and contributes significantly to cancer-related mortality. While recent advances in in vitro PC modeling systems have been made, there remains a lack of robust preclinical models that faithfully recapitulate the genetic and phenotypic characteristics across various PC subtypes-from localized PC (LPC) to castration-resistant PC (CRPC)-along with associated stromal cells. Here, we established human PC assembloids from LPC and CRPC tissues by reconstituting tumor organoids with corresponding cancer-associated fibroblasts (CAFs), thereby incorporating aspects of the tumor microenvironment (TME). Established PC organoids exhibited high concordance in genomic landscape with parental tumors, and the tumor assembloids showed a higher degree of phenotypic similarity to parental tumors compared to tumor organoids without CAFs. PC assembloids displayed increased proliferation and reduced sensitivity to anti-cancer treatments, indicating that PC assembloids are potent tools for understanding PC biology, investigating the interaction between tumor and CAFs, and identifying personalized therapeutic targets.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1011652
Tumor microenvironment
Prostate cancer
Biology
Organoid
Cancer
Stromal cell
Cancer research
Malignancy
Concordance
Cancer-Associated Fibroblasts
2
article
|
인용수 2
·
2025
Single rosette-based generation of uniform cortical assembloids recapitulating cellular interactions between neurons and glial cells
E.H. Kim, Yunhee Kim, Soo-Jung Hong, I.S. Kim, J.-H. Lee, Jong-Yeon Yoo, Jihyun Kim, Kwangmin Yoo, Ho‐Jin Lee, Joung‐Hun Kim, Jungmin Choi, Kunyoo Shin
IF 15.7 (2025)
Nature Communications
Despite recent advances, current brain organoid technologies face ongoing challenges in managing heterogeneity and representing the diverse structure and cell types of the human brain. Here, we develop a module-based cellular reconstitution technology to sequentially build uniform cortical assembloids with mature cortical structures and functional connectivity. The uniformity and maturity of the cortical assembloids are achieved by creating single-rosette-based organoids at the early stage, whose sizes were big and consistent with the treatment of Wnt and Hedgehog agonists, followed by spatial reconstitution with the Reelin-expressing neuronal layer and non-neuronal glial cells. The resulting single-rosette-based cortical assembloids are highly uniform and reproducible without significant batch effects, solving major heterogeneity issues caused by difficulties in controlling the number and size of rosettes in conventional multi-rosette organoids. Furthermore, these cortical assembloids structurally and functionally recapitulate the physiology of the human brain, including the six-layered cortical structure, functional connectivity, and dynamic cellular interplay between neurons and glial cells. Our study thus provides an innovative preclinical model to study a range of neurological disorders, understanding the pathogenesis of which requires an organoid system capable of representing the dynamic cellular interactions and the maturity of the human brain.
https://doi.org/10.1038/s41467-025-66440-1
Organoid
Human brain
Cortical neurons
Cell type
Wnt signaling pathway
Hedgehog
Cellular neuroscience
3
article
|
인용수 5
·
2024
AAVS1‐targeted, stable expression of ChR2 in human brain organoids for consistent optogenetic control
Soo-Jung Hong, Ju Hee Lee, Yunhee Kim, E.H. Kim, Kunyoo Shin
IF 5.7 (2024)
Bioengineering & Translational Medicine
safe harbor locus-targeted, ChR2 knocked-in human pluripotent stem cells (hPSCs), followed by the differentiation of these genetically engineered hPSCs into forebrain organoids. The resulting ChR2-expressing human forebrain organoids showed homogeneous cellular expression of ChR2 throughout entire regions without any structural and functional perturbations and displayed consistent and robust neural activation upon light stimulation, allowing for the non-virus mediated, spatiotemporal optogenetic control of neural activities. Furthermore, in the hybrid platform in which brain organoids are connected with spinal cord organoids and skeletal muscle spheroids, ChR2 knocked-in forebrain organoids induced strong and consistent muscle contraction upon brain-specific optogenetic stimulation. Our study thus provides a novel, non-virus mediated, preclinical human organoid system for light-inducible, consistent control of neural activities to study neural circuits and dynamics in normal and disease-specific human brains as well as neural connections between brain and other peripheral tissues.
https://doi.org/10.1002/btm2.10690
Optogenetics
Organoid
Forebrain
Induced pluripotent stem cell
Neuroscience
Human brain
Biology
Cell biology
Locus coeruleus
Embryonic stem cell
최신 정부 과제
22
과제 전체보기
1
2024년 9월-2028년 3월
|2,366,659,000
인간 다중 장기 어셈블로이드 구축을 통한 뇌세포-뇌조직-신체기관 간 상호작용 규명 및 질환 치료 제어 기술 개발
최종목표: 인간 다중 장기 어셈블로이드 구축을 통한 뇌세포, 뇌조직, 신체기관 간 상호작용 이상으로 발생하는 질환 기작 규명 및 치료제 개발본 연구에서는 뇌세포, 뇌조직, 신체기관 간의 상호작용을 모사하는 인간 다중 장기 어셈블로이드를 구축하려고 함. 구축된 다중 장기 어셈블로이드를 기반으로, 비정상적인 세포 및 조직 간 상호작용으로 발생하는 인체 질환 모...
뇌 어셈블로이드
줄기세포/오가노이드
뇌질환
비만
신약개발
2
2024년 9월-2028년 3월
|1,861,274,000
인간 다중 장기 어셈블로이드 구축을 통한 뇌세포-뇌조직-신체기관 간 상호작용 규명 및 질환 치료 제어 기술 개발
최종목표: 인간 다중 장기 어셈블로이드 구축을 통한 뇌세포, 뇌조직, 신체기관 간 상호작용 이상으로 발생하는 질환 기작 규명 및 치료제 개발본 연구에서는 뇌세포, 뇌조직, 신체기관 간의 상호작용을 모사하는 인간 다중 장기 어셈블로이드를 구축하려고 함. 구축된 다중 장기 어셈블로이드를 기반으로, 비정상적인 세포 및 조직 간 상호작용으로 발생하는 인체 질환 모...
뇌 어셈블로이드
줄기세포/오가노이드
뇌질환
비만
신약개발
3
주관|
2023년 3월-2027년 12월
|750,000,000
비뇨기계 전주기 줄기세포 ATLAS 구축을 통한 신줄기세포군 발굴 및 신개념 질환모델 개발
○ 1차년도 - 전주기 (태아-정상-질환) 비뇨기계 조직 (신장-방광-전립선) 확보 및 뱅킹 [삼성서울병원] - 다중오믹스 분석 파이프라인 구축 및 DB 설계 [성균관대학교] - 인간 인공 배아 배양조건 및 방법 최적화 [서울대학교] ○ 2차년도 - 단일세포 전사체 시퀀싱 및 공간전사체 시퀀싱 데이터 생산 [삼성서울병원] - 전장 유전체, 후성유전체 시퀀싱 수행 및 DB 자료 확보 [성균관대학교] - 인공 배반포 (Blastoid) 및 인공 창자배 (gastruloid) 구축 [서울대학교] ○ 3차년도 - 단일세포 전사체 및 공간 전사체 특성 비교 분석 [삼성서울병원] - 오믹스 데이터 분석 및 전체 다중오믹스 통합 빅데이터 DB 구축 [성균관대학교] - 인간초기 인공배아의 유전체, 전사체 및 단일세포별 전사체 분석 [서울대학교] - 비뇨기계 줄기세포 및 인간초기배아발생 줄기세포 ATLAS 구축을 통한 신줄기세포군 발굴 [전기관] - 다중오믹스 데이터를 활용한 AI 플랫폼 기반 신치료 표적 발굴 스크리닝 수행 [온코크로스 (위탁)]
비뇨기계
다중오믹스
오가노이드
줄기세포 아틀라스
질환 모델링
최신 특허
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상태출원연도과제명출원번호상세정보
등록2019줄기세포 또는 종양세포 기반 다종세포 조직 구조 모사체 및 이의 제조 방법1020190113709
전체 특허

줄기세포 또는 종양세포 기반 다종세포 조직 구조 모사체 및 이의 제조 방법

상태
등록
출원연도
2019
출원번호
1020190113709

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