1. 유방암과 치매발병의 상관관계는 임상적 특징만 보고되었을 뿐, 이에 대한 심도 깊은 연구는 현재 미비한 실정이다2. 딥러닝 기반 전유전체 분석을 통하여 유방암의 진행과 치매발병에 영향을 미치는 링크 유전자 및 변이를 발굴하고, 발현양에 따른 질병의 예측 기법을 개발한다 3. 유방암 성장과 뇌신경계로의 전이경로를 파악하여 이를 억제 시킬 수 있는...

1. 유방암과 치매발병의 상관관계는 임상적 특징만 보고되었을 뿐, 이에 대한 심도 깊은 연구는 현재 미비한 실정이다2. 딥러닝 기반 전유전체 분석을 통하여 유방암의 진행과 치매발병에 영향을 미치는 링크 유전자 및 변이를 발굴하고, 발현양에 따른 질병의 예측 기법을 개발한다 3. 유방암 성장과 뇌신경계로의 전이경로를 파악하여 이를 억제 시킬 수 있는...

우리나라 성인 고형암중 여성들의 유방암 비율은 갑상선암 다음으로 많은 걸리는 질환임. 인간 게놈 프로젝트를 통해 약 4만여 개에 달하는 인간 유전자가 밝혀졌으나 이 유전자들의 구체적 기능은 아직 다 밝혀지지 않았음. 특히, 암세포와 치매 특이적으로 발현하는 유전자의 전사(transcription)과정 및 단백질의 활성과 분해조절에 따른 신호전달 체계를 분...

GWAS를 이용한 삼중음성유방암 및 치매조직에서의 전사 및 발현조절 분석 - 전장 유전체 연관 분석 (GWAS)를 통하여 삼중음성유방암과 치매조직에서의 유전자의 발현패턴 분석 및 딥러닝 기반 신규 SNV 동정 - 유전자의 발현량에 연관이 있을 것으로 예상되는 프로모터부위의 modification 분석 실시 삼중음성유방암 및 치매 링크 단백질과 기질단백질의 상호작용 분석 - 신호전달기전의 이해를 위한 질병 내 단백질 발현분석 정량화 및 단백질 복합체 형성 분석 - 링크 단백질의 특이성을 확인하기 위하여 단백질의 발현 및 활성에 따른 side-effect 분석 - 링크 단백질의 생물학적 기능을 연구하기 위해 siRNA library등 사용하여 특정 링크 단백질의 발현에 따라 누적되는 표현형을 암세포 및 신경세포를 사용하여 관찰 - 링크 단백질의 발현양에 따라 신호전달기전이 재구성되는 현상을 이해하기 위하여 양적 접근법 확립 삼중음성유방암과 치매 링크유전자의 숨겨진 변이를 예측하는 알고리즘 개발 및 검증 딥러닝 기반의 숨겨진 유전자 변이 예측 분석 알고리즘 개발 및 in vitro 검증 - 치매와 유방암 유전체 분석 데이터를 기반으로 해당 질환과 관련된 유전자들의 발현 패턴을 딥러닝 기반의 알고리즘을 통하여 모델링 확립 - 개발된 알고리즘에 대한 정확도를 선형회귀 기반으로한 함수화 하여 정립 - 반복된 학습을 통하여 정확한 유전적 변이의 스코어를 도출 (최소 10,000번이상) - 도출된 스코어를 기반으로 세포내에서 변이에 의한 RNA splicing과 같은 processing의 문제를 특별히 제작된 프라이머를 사용하여 RT-PCR을 수행하여 검증 삼중음성유방암과 치매 링크유전자의 변이에 따른 단백질 변형 분석 삼중음성유방암 및 치매 발병시 링크 단백질의 활성도 분석을 위한 뉴런 시스템 개발 - 유방암과 치매사이의 링크 유전자의 SNV에 의한 비정상적 단백질 발현양 및 번역후변형 분석, 및 형태 정량화 - AAV 및 lentivirus 제작을 통한 링크단백질의 신경 세포내 발현기전 분석 - 항암제 처리시 나타나는 신경세포내 신호전달기전 분석치매 진행시 나타나는 단백질 변형 분석 - 단백질변형에 따른 신경세포 내 신호전달기전 분석과 1차년도 스크리닝을 통해 발굴된 기질단백질들과의 연관성 분석 - 링크단백질의 결정화를 통한 구조분석 - 삼중음성유방암 세포주 및 tau-seed cell line에서 링크 단백질의 발현량을 통한 tumorigenesis 및 tau pathology 분석 삼중음성유방암과 치매 링크유전자의 유전자의 RNA processing을 editing하여 In vivo 타당성 검증 비특이적 단백질 번역을 유발하는 유전자의 RNA-splicing과정을 조절하는 기술 확립 - SSO(Splice-switching antisense oligonucleotide)를 이용하여 RNA-splicing 과정을 조절 - in-vitro 에서 SSO를 통한 정상적인 단백질 번역을 확인 - 동물모델에서 SSO를 이용하여 조직에서 기능 확인 및 향 후 치료목적으로서의 가능성 제시 삼중음성유방암 및 치매의 링크단백질을 통한 공유 기전 확립 - 환자유래 조직에서 링크단백질의 생화학적 활성 및 번역후변형의 정량적 분석 - 암세포의 전이에 따른 신경세포의 영향 가능성 확인 - 투과전자현미경(TEM)을 통한 조직 내 단백질의 위치 분석 및 기질단백질과의 정량적 결합 분석 - 동물모델에서 AAV 및 lenti virus를 이용한 링크 단백질의 In vivo 영향 분석