소 바이러스성 설사 바이러스(Bovine viral diarrhea virus, BVDV)는 Flaviviridae 계통의 Pestivirus 속에 속하는 RNA 바이러스이다. BVDV는 급성 질병, 태아 손실, 그리고 지속감염(persistently infected, PI) 동물의 출생과의 관련성 때문에 축산업에 경제적 중요성이 크다. 본 연구는 제주 지역의 한국 재래가축 농장에서 BVDV 감염률을 조사하여 제주도 내 BVDV 통제 프로그램을 추가로 계획하기 위한 목적으로 수행되었다. 2014년 1월부터 2017년 6월까지 302개 한국 재래가축 사육농가에서 수집된 15,842개 혈청에 대하여 효소면역흡착검사(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)로 BVDV 항체 및 항원을 검사하였다. 바이러스 항원은 항원 ELISA 양성 혈청 60개 중에서 역전사-중합효소연쇄반응(reverse transcription-polymerase chain reaction)으로 검출하였다. BVDV 항체는 사육농가의 90.7%(274/302)에서, 소는 61.1%(9,678/15,842)에서 발견되었다. BVDV 항원은 사육농가의 13.2%(40/302)에서, 소는 0.4%(61/15,842)에서 발견되었다. 가장 연령이 높은 군( > 8세 )은 가장 높은 혈청양성률(91%)을 보였으며, 가장 어린 군( < 1세 )은 가장 높은 항원 양성률(0.52%)을 보였다. 항원 양성 혈청 60개 중에서 BVDV type 1과 type 2는 각각 36개 및 12개에서 확인되었다. 또한 연례 검사에서 BVDV가 지속적으로 검출되어 여섯 마리의 동물은 PI로 간주되었다.