Transcriptomic profiling of habenula responses to chronic stress and neural circuit pathway mapping
연구 내용
만성 구속 스트레스 노출 후 설치류 habenula 전사체 변화를 규명하고 스트레스-우울 관련 분자 표적과 신경회로 신호경로를 도출하는 연구
우울의 위험을 높이는 만성 스트레스가 habenula의 분자 변화로 어떻게 연결되는지 규명하기 위해 유전체 수준의 전사체 분석을 수행합니다. 만성 스트레스 조건에서 차등발현유전자를 도출하고, KEGG 및 Gene Ontology 기반 경로/기능 풍부화로 신경활성 리간드-수용체 상호작용, cAMP 신호, synaptic signaling과 같은 축을 정리합니다. 또한 단백질-단백질 상호작용 네트워크로 세부 서브클러스터를 구성하고, 공개 단일세포 RNA-seq 정보를 이용해 차등발현유전자의 세포유형 및 habenular 영역 특이성을 추정하여 후보 표적의 우선순위를 제안합니다.
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연구 흐름
초기에는 만성 구속 스트레스 노출 후 habenula의 전사체 변화를 폭넓게 파악하여 차등발현유전자 세트를 확보했습니다. 이후 KEGG 및 Gene Ontology를 통해 신경활성 리간드-수용체 상호작용, cAMP 관련 신호, circadian entrainment, 시냅스 전달 기능을 중심으로 기능 축을 재구성했습니다. 다음 단계에서는 PPI 네트워크와 단일세포 RNA-seq 기반 세포유형·영역 매핑을 결합하여, 후보 변화가 medial habenular neuron에 농축되는 양상을 확인했습니다. 그 결과 스트레스 반응을 매개할 분자 타깃을 제안하는 방향으로 확장되었습니다.
활용 가능성
활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.
관련 논문
구분
제목
Gene Expression Profiling of the Habenula in Rats Exposed to Chronic Restraint Stress