RnDCircle Logo
이도엽 연구실
서울대학교 농생명공학부
이도엽 교수
기본 정보
연구 분야
프로젝트
발행물
구성원

이도엽 연구실

서울대학교 농생명공학부 이도엽 교수

이도엽 연구실은 발효·식품미생물과 장내 마이크로바이옴을 중심으로 질량분석 기반 대사체학 및 멀티오믹스 분석을 수행하며, 유산균과 미생물 유래 대사산물의 기능 규명, 장-간 축 기반 간질환 연구, 다양한 질환의 바이오마커 발굴과 정밀의료 응용까지 아우르는 융합형 생명공학 연구를 전개하고 있다.

대표 연구 분야
연구 영역 전체보기
발효·식품미생물 대사체학 thumbnail
발효·식품미생물 대사체학
주요 논문
5
논문 전체보기
1
article
|
gold
·
인용수 9
·
2025
<i>Phocaeicola dorei</i> ameliorates progression of steatotic liver disease by regulating bile acid, lipid, inflammation and proliferation
Jieun Choi, Ye Rin Choi, Min Kyo Jeong, Hyun Song, Jeong Seok Yu, Soon H Song, Jeong Ha Park, Min Ju Kim, Hyunjoon Park, Young Lim Ham, Sang Hak Han, Dong Joon Kim, Do Yup Lee, Ki Tae Suk
IF 11
Gut Microbes
Gut microbiota and their metabolites are known to influence the pathogenesis and progression of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD). In this study, we investigated the potential beneficial effects of <i>Phocaeicola dorei</i> in modulating MASLD progression, beginning with clinical observations and followed by mechanistic validation in animal models. Human data (49 healthy controls and 129 MASLD patients) were collected to investigate gut microbial biomarkers. The relative abundance of <i>P. dorei</i> was found to significantly vary with MASLD severity in human. Western diet-induced MASLD mice supplemented <i>with P. dorei</i> (12 weeks, 10<sup>9</sup> CFU/g twice/week) or 100 μl of <i>P. dorei</i> cell-free supernatant (CFS, 5 times/week) were utilized. STAM<sup>TM</sup> mice (10 weeks, 10<sup>8</sup> CFU/g four times/week) and RAW 264.7 cells were used for the validation. MASLD severity was determined based on liver/body weight, pathology, and biochemistry markers. Cecum feces were collected for 16S rRNA gene sequencing and metabolite profiles. In the animal model, <i>P. dorei</i> oral administration and its CFS alleviated lipid accumulation by increasing β-oxidation gene expression and inhibited inflammatory response from fatty liver to hepatitis progression. In the STAM<sup>TM</sup> model, <i>P. dorei</i> decreased nuclear atypia and cell proliferation. Additionally, <i>P. dorei</i> CFS inhibited TNF-α and CXCL10 in activated macrophages, and this result was consistent with the results of animal models. <i>P. dorei</i> and its metabolites ameliorate MASLD progression by modulating bile acid, lipid accumulation, inflammation, and proliferation. <i>P. dorei</i> could be a promising candidate for novel microbiota-based therapeutic strategies against MASLD.
https://doi.org/10.1080/19490976.2025.2539448
Biology
Inflammation
Bile acid
Disease
Steatosis
Liver disease
Internal medicine
Biochemistry
Immunology
Endocrinology
2
article
|
gold
·
인용수 125
·
2020
&lt;i&gt;Lactobacillus&lt;/i&gt; attenuates progression of nonalcoholic fatty liver disease by lowering cholesterol and steatosis
Na Young Lee, Min Jea Shin, Gi Soo Youn, Sang Jun Yoon, Ye Rin Choi, Hyeong Seop Kim, Haripriya Gupta, Sang Hak Han, Byoung Kook Kim, Do Yup Lee, Tae‐Sik Park, Hotaik Sung, Byung‐Yong Kim, Ki Tae Suk
IF 16.9
Clinical and Molecular Hepatology
Ingestion of Lactobacillus, such as L. acidophilus, L. fermentum, and L. plantarum, ameliorates the progression of nonalcoholic steatosis by lowering cholesterol. The use of Lactobacillus can be considered as a useful strategy for the treatment of NAFLD.
https://doi.org/10.3350/cmh.2020.0125
Fatty liver
Steatosis
Nonalcoholic fatty liver disease
Internal medicine
Gut flora
Akkermansia
Medicine
Gastroenterology
Endocrinology
Biology
3
article
|
bronze
·
인용수 147
·
2019
Metabolic Reprogramming in Astrocytes Distinguishes Region-Specific Neuronal Susceptibility in Huntington Mice
Aris Polyzos, Do Yup Lee, Rupsa Datta, Meghan Hauser, Helen Budworth, Amy Holt, Stephanie J. Mihalik, Pike Goldschmidt, Ken A. Frankel, Kelly S. Trego, Michael J. Bennett, Jerry Vockley, Ke Xu, Enrico Gratton, Cynthia T. McMurray
IF 30.9
Cell Metabolism
https://doi.org/10.1016/j.cmet.2019.03.004
Biology
Reprogramming
Pentose phosphate pathway
Neurodegeneration
Cell biology
Mitochondrion
Huntington's disease
Glycolysis
Huntingtin
Biochemistry
정부 과제
41
과제 전체보기
1
2025년 6월-2029년 12월
|900,000,000
약물 중독 자가투여 설치류 모델 기반 멀티오믹스 분석을 통한 중독기전 규명 및 제어 기술 개발
Self-administration∥을 이용해 핵심 마약*의 마우스 투여 후, 뇌#/간/혈액† 시료의 종단¶ 멀티오믹스‡ 분석을 통해 중독 관련 분자지도 구축, 멀티오믹스 데이터 통합분석을 통한 중독기전 규명 및 중독 제어/치료 분자타겟 발굴 및 검증∥마약을 인위적으로 마우스에 주입하는 것이 아니라, 마우스가 우연한 노출이후에 버튼을 눌러 자의적으로 마약을...
다중오믹스
대사체
후성유전체
중독
바이오마커
2
2025년 6월-2029년 12월
|300,000,000
약물 중독 자가투여 설치류 모델 기반 멀티오믹스 분석을 통한 중독기전 규명 및 제어 기술 개발
Self-administration∥을 이용해 핵심 마약*의 마우스 투여 후, 뇌#/간/혈액† 시료의 종단¶ 멀티오믹스‡ 분석을 통해 중독 관련 분자지도 구축, 멀티오믹스 데이터 통합분석을 통한 중독기전 규명 및 중독 제어/치료 분자타겟 발굴 및 검증∥마약을 인위적으로 마우스에 주입하는 것이 아니라, 마우스가 우연한 노출이후에 버튼을 눌러 자의적으로 마약을...
다중오믹스
대사체
후성유전체
중독
바이오마커
3
2024년 3월-2028년 12월
|5,713,000,000
유전체 등 오믹스 데이터 생산·분석
100만 통합 바이오 빅데이터 기반의 정밀의료 구현을 위한 고품질의 희귀질환·중증질환·일반인 전장유전체 등 멀티 오믹스 데이터 구축
개인 유전체 서열분석
멀티 오믹스
데이터 큐레이션
빅데이터
집단 유전체학
최신 특허
특허 전체보기
상태출원연도과제명출원번호상세정보
공개2024그람 양성 세균의 세포외소낭을 검출 및 정량하는 방법1020240003653
공개2023락토바실러스 람노서스 GG 유래 세포외소낭체를 유효성분으로 포함하는 암 예방, 개선 또는 치료용 조성물1020230171092
등록2021LED 광원을 이용한 식품의 발효단계별 발효 방법1020210166075
전체 특허

그람 양성 세균의 세포외소낭을 검출 및 정량하는 방법

상태
공개
출원연도
2024
출원번호
1020240003653

락토바실러스 람노서스 GG 유래 세포외소낭체를 유효성분으로 포함하는 암 예방, 개선 또는 치료용 조성물

상태
공개
출원연도
2023
출원번호
1020230171092

LED 광원을 이용한 식품의 발효단계별 발효 방법

상태
등록
출원연도
2021
출원번호
1020210166075