항생제 내성 황색포도상구균(Staphylococcus aureus), 특히 메티실린 내성 S. aureus(MRSA)의 식용 가축에 대한 집락화(colonization)는 전 세계적으로 심각한 공중보건 문제로 대두되고 있다. 본 연구에서는 육계 농장, 도축장, 소매 판매 닭고기에서 수집한 가축 연관(livestock-associated) S. aureus 분리주의 클론 다양성을 조사하였다. 총 200개의 S. aureus 분리주(43 MRSA 및 157 메티실린 감수성 S. aureus[methicillin-susceptible S. aureus, MSSA] 분리주)를 분석하여 1) 분리주의 유전형(다중좌위 서열, agr 및 spa 유형), 2) 메티실린 내성 표현형과 포도상구균 카세트 염색체 mec(SCCmec) 유형, 3) 항균제 내성 프로파일, 4) 플루오로퀴놀론 내성 분리주에서의 gyrA, gyrB, parC 및 parE의 변이 변화(mutational changes)를 확인하였다. 육계 농장, 도축장, 소매 판매 닭고기에서 상대적으로 높은 수준의 유전적 다양성을 보이는 MSSA 균주 15개의 서로 다른 서열 유형(ST)이 검출되었다. MSSA와 달리, 건강한 육계에서는 MRSA 2개의 우점 유전 계통이 발견되었는데, ST692-SCCmecV( spa 유형 t2249)와 ST188-SCCmecIVa( spa 유형 t189)였다. 건강한 육계에서 ST692 및 ST188의 높은 유병률은 다중 항균제 내성 표현형, 특히 플루오로퀴놀론 내성과 높은 수준의 관련이 있다. 모든 플루오로퀴놀론 내성 분리주는 ST 또는 메티실린 내성 여부와 무관하게 gyrA(S84L) 및 parC(S80F)에서 이중 점 돌연변이를 모두 포함하고 있었다. 주목할 점은, ST188 계통만 gyrB(D494N)에서 추가적인 세 번째 돌연변이를 보였으며, 이는 이중 돌연변이를 가진 균주에 비해 시프로플록사신의 최소억제농도(minimum inhibitory concentration) 값의 증가와 상관되었다. 이러한 결과는 한국의 닭고기 생산 사슬(건강한 육계를 포함)과 연관된 항균제 내성 S. aureus 균주의 유전적 다양성에 대한 중요한 통찰을 제공한다.

플루오로퀴놀론은 그람양성 및 그람음성 병원체 모두에 대한 광범위한 항균 활성 때문에 사람과 식용 가축, 특히 가금류에서 중증 감염의 치료 또는 예방에 널리 사용되어 왔다. 그러나 가금류 생산에서 플루오로퀴놀론을 사용하면 퀴놀론 내성에 대한 유전적 결정인자를 보유한 세균이 선택된다. 여기서는 한국에서 건강한 브로일러로부터 분리된 퀴놀론 내성을 나타내는 메티실린 내성 황색포도상구균(MRSA) 2개 균주의 완전한 게놈 서열을 제시한다.