illumina 시퀀싱 기반 tRNA-Seq을 이용한 전달 RNA(tRNA)의 정량화는 높은 수준의 중복성과 광범위한 변형 정도 때문에 복잡하다. 그에 따라, 어떤 tRNA-Seq 방법도 널리 확립되지 않았으며, 시퀀싱 읽기에서 tRNA를 정량화하기 위한 다양한 접근법이 제안되어 왔다. 여기서는 현실적인 tRNA-Seq 시뮬레이션을 사용하여, 두 가지의 새로운 접근법을 포함한 tRNA-Seq 정량화 접근법들을 벤치마킹한다. 우리는 서로 다른 5가지 tRNA-Seq 방법을 모사하도록 설계된 데이터를 사용하여, 이 새로운 접근법들이 일관되게 가장 정확함을 보여준다. 또한 이러한 시뮬레이션 기반 벤치마킹은 각 정량화 접근법의 특정한 한계점을 규명하고, 실제 tRNA-Seq 데이터에서 세포주 간 관찰되는 변이의 최대 13%가 정량화 정확도의 체계적 차이에 기인할 수 있음을 시사한다.
*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.