주요 논문
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Article
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인용수 7
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2025Encoded Display of Chemical Libraries on Nanoparticles as a Versatile Selection Tool To Discover Protein Ligands
KangJu Lee, Hee Myeong Wang, Minkyung Kim, Junhyung Park, Jungyeon Kim, Seungyoon Jang, Dahye Im, Beomjoon Goh, Min Hyeon Shin, Ji Hoon Shim, Sungjee Kim, Jongcheol Seo, Hyun‐Suk Lim
IF 15.6 (2025)
Journal of the American Chemical Society
DNA-encoded library(DEL) 기술은 생물학적 표적에 대한 강력한 리간드를 발견하는 데 유용한 강력한 도구이지만, 유기 용매에서의 DNA 불용성과 다양한 반응 조건에서의 불안정성 등 여러 제약에 의해 제한된다. 이러한 제약은 라이브러리 합성에서 구현 가능한 반응성 범위와 구조적 다양성을 제한한다. 본 연구에서는 나노입자 표면에 라이브러리 분자와 DNA 태그를 함께 고정하여 제시하는 nanoDEL이라는 새로운 전략을 소개한다. 나노입자는 유기 용매와 수용액 모두에서 잘 분산되므로, DEL 합성은 잘 확립된 유기 용매 기반 조건을 사용하여 수행할 수 있으며, 수용 조건이 필요 없다. 또한 nanoDEL은 수용 조건에 의존하는 기존 DEL 방법으로는 불가능한 공기 민감 반응을 가능하게 한다. 특히 nanoDEL에서는 단일 나노입자에 다수의 DNA 태그 사본을 부착하여 단일 화합물을 인코딩함으로써 DNA 손상 조건에 대한 내성을 현저히 향상시킨다. 대부분의 DNA 태그가 손상되더라도, 온전한 태그의 증폭을 통해 서열 분석이 여전히 가능하다. 결과적으로 nanoDEL은 DNA에 호환되는 반응을 개발할 필요 없이 기존의 유기 반응을 손쉽게 활용할 수 있게 한다. nanoDEL의 잠재력은 모델 시스템으로서 streptavidin에 대한 친화도 선택을 통해 검증되었고, 또한 키나아제에 대한 강력한 저분자 억제제의 발견과 단백질-단백질 상호작용을 표적하는 스태플드 펩타이드 억제제의 발견에 성공적으로 적용되었으며, 해리 상수는 나노몰(nanomolar) 범위로 나타났다. 더 나아가, 기존 DEL에서는 불가능한 수분 민감 반응 단계들을 포함하는 합성 도식을 사용하여 나노입자 상에서 대규모 조합 라이브러리를 효율적으로 합성할 수 있음을 보여주었다.
https://doi.org/10.1021/jacs.4c13487
Chemistry
Selection (genetic algorithm)
Nanoparticle
Nanotechnology
Combinatorial chemistry
Computational biology
Artificial intelligence
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인용수 4
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2025Synthesis of Au13Cu4 Nanoclusters with Isomeric Mercaptobenzoic Acid Ligands
Munjeong Kim, Sanghwang Park, Sanghwang Park, Min-Su Kim, Sinhyeop Kim, Jongcheol Seo, Sarah S. Park, Sarah S. Park
IF 9.1 (2025)
Nano Letters
이러한 결과는 수용성이면서 크기에 초점을 둔 Au 기반 합금 나노클러스터(NCs)를 합성하기 위한 새로운 접근법을 제시하며, 향상된 특성을 갖는 새로운 금 합금 클러스터에 대한 연구와 더 넓은 적용 가능성을 열어준다.
https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.5c01792
Nanoclusters
Alloy
Chemistry
Chirality (physics)
Electrospray ionization
Crystallography
Yield (engineering)
Mass spectrometry
Nanotechnology
Ion
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인용수 2
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2023Distinguishing Protein Chemical Topologies Using Supercharging Ion Mobility Spectrometry‐Mass Spectrometry
Jiyeon Lee, Dahye Im, Yajie Liu, Jing Fang, Xibao Tian, Minsu Kim, Wenbin Zhang, Jongcheol Seo
IF 16.1 (2023)
Angewandte Chemie International Edition
이온 이동도 분광법-질량분석법(IMS-MS)과 초고전하(슈퍼차지) 전기분무 이온화(supercharging electrospray ionization; ESI)를 결합한 기법은 단백질의 화학적 토폴로지를 효과적으로 구별할 수 있음을 입증하였다. 초고전하 ESI를 통해 단백질에 가능한 한 많은 전하를 도입하면 단백질 사슬이 대체로 펼쳐지고 신장되어, 숨겨진 화학적 토폴로지가 드러난다. 서로 다른 화학적 토폴로지는 순환 도메인에서의 비틀림(토셔널) 회전 제한으로 인해 펼쳐진 단백질의 기하학적 크기가 다르게 나타난다. 사슬-길이 정규화 충돌 단면적(chain-length-normalized collision cross-section; CCS)과 광범위하게 펼쳐진 상태에서의 최대 전하 상태(maximum charge state; z M )와 같은 새로운 토폴로지 지표를 도입함으로써, 선형 사슬, 고리(링)를 포함하는 토폴로지(라소, 테드폴, 다중고리 등), 그리고 카테네인(catenanes)과 같은 기계적으로 맞물린 고리까지 다양한 단백질 화학적 토폴로지를 성공적으로 구별할 수 있었다.
https://doi.org/10.1002/anie.202314980
Mass spectrometry
Ion-mobility spectrometry
Topology (electrical circuits)
Electrospray ionization
Network topology
Chemistry
Chemical physics
Chromatography
Computer science
Mathematics
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인용수 50
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2023Controlling π–π Interactions of Highly Soluble Naphthalene Diimide Derivatives for Neutral pH Aqueous Redox Flow Batteries
Vikram Singh, Seongyeon Kwon, Yunseop Choi, Seongmo Ahn, Gyumin Kang, Yelim Yi, Mi Hee Lim, Jongcheol Seo, Mu‐Hyun Baik, Hye Ryung Byon
IF 27.4 (2023)
Advanced Materials
2 m 전자 저장 용량과 함께 99.5%의 쿨롱 효율을 나타냄.
https://doi.org/10.1002/adma.202210859
Redox
Electron transfer
Materials science
Molecule
Aqueous solution
Naphthalene
Electron transport chain
Stacking
Chemical engineering
Photochemistry
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인용수 5
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2022Trapping Alkali Halide Cluster Ions Inside the Cucurbit[7]uril Cavity
Jiyeon Lee, Seongjae Jang, Minsu Kim, Deepak R. Boraste, Kimoon Kim, Kyeng Min Park, Jongcheol Seo
IF 5.7 (2022)
The Journal of Physical Chemistry Letters
]), 이는 액적 증발 동안 공동(cavity) 내부에 다양한 알칼리 할로겐화물 클러스터를 포집하는데 관여하는 것으로, 이온 이동도 분광법-질량 분석(ion mobility spectrometry-mass spectrometry)을 사용하여 조사되었다. 전기분무 이온화(electrospray ionization) 과정에서 생성되는 다양한 알칼리 염화물 클러스터 양이온 또는 음이온을 갖는 CB[7]의 복합체를 연구하였으며, 이들 클러스터가 공동 내부에 포집되었는지 여부를 확인하기 위해 충돌 단면적(collision cross-section, CCS) 값을 얻었다. 특정 임계 크기보다 작은 클러스터는 기체 상에서 CB[7] 공동 내부에 포집되는 것으로 밝혀졌는데, 이는 주어진 농도에서 알칼리 할로겐화물 클러스터의 포집이 용액에서는 불리할 것으로 예상된다는 점과는 대비된다. 우리는 급속한 용매 증발이 이온 농도를 빠르게 증가시켜 이후 알칼리-염화물 접촉 이온쌍(contact ion pairs)을 형성한다고 제안하며, 따라서 포함 복합체(inclusion complexes)의 형성을 가능하게 하는 특정한 환경을 제공할 수 있을 것으로 보인다.
https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.2c02583
Halide
Alkali metal
Chemistry
Ion
Chloride
Cluster (spacecraft)
Evaporation
Mass spectrometry
Ion-mobility spectrometry
Inorganic chemistry