RnDCircle Logo
김은배 연구실
강원대학교 동물응용과학과 김은배 교수
Multiplex PCR
Lactobacillus species-specific primers
Gut microbiota dynamics
기본 정보
연구 분야
프로젝트
논문
구성원

김은배 연구실

강원대학교 동물응용과학과 김은배 교수

김은배 연구실은 프로바이오틱과 가축 장내미생물에 대한 분자 동정과 기능성 평가를 수행합니다. Lactobacillus 유전체 비교를 기반으로 종특이 다중 PCR 프라이머를 설계·최적화하여 신속 동정 체계를 구축합니다. 또한 분변 및 장 내용물에서 16S rRNA gene 서열을 분석해 산란계와 브로일러의 발달 및 사육환경·사료 변화에 따른 장내미생물 변동을 규명합니다. 더 나아가 Lactococcus lactis 유래 cell extract에 재조합 RANKL 등 postbiotic 기반 요소를 적용해 M cell 분화와 점막성 면역 반응을 유도하고, 경구 백신 효율을 평가하는 연구를 병행합니다.

Multiplex PCRLactobacillus species-specific primersGut microbiota dynamics16S rRNA sequencingPostbiotic
대표 연구 분야
연구 영역 전체보기
게놈 비교 기반 프로바이오틱 균 동정용 다중 PCR 프라이머 설계 연구 thumbnail
게놈 비교 기반 프로바이오틱 균 동정용 다중 PCR 프라이머 설계 연구
Genome-guided multiplex PCR for species-specific identification of probiotic Lactobacilli
연구 분야 상세보기
연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.

5개년 연도별 논문 게재 수

17총합

5개년 연도별 피인용 수

207총합
주요 논문
5
논문 전체보기
1
article
|
인용수 3
·
2025
Effects of Increased Housing Space Without Altering Stocking Density on Body Weight, Stress, and Gut Microbiome in Broiler Chickens
Eun Bae Kim, Seojin Choi, Jongbin Park, Biao Xuan
IF 2.7 (2025)
Animals
< 0.05) 각각 아미노산 및 질소 대사에 관여하는 39 및 25 MetaCyc 경로의 풍부함이 증가하였다. 이러한 결과는 사육 밀도나 추가적인 처리의 변화를 없이 사육 공간을 늘리는 것만으로도 육계에서 성장과 장내 미생물군집 건강을 모두 향상시킬 수 있음을 시사한다. 본 연구 결과는 닭의 사육 환경과 장내 미생물군집 간의 관계에 대한 통찰을 제공한다.
https://doi.org/10.3390/ani15030441
Broiler
Stocking
Biology
Microbiome
Animal science
Lactobacillus
Abundance (ecology)
Amen
Veterinary medicine
Food science
2
article
|
인용수 3
·
2025
A longitudinal investigation of gut microbiota dynamics in laying hens from birth to egg-laying stages
Seojin Choi, Eun Bae Kim
IF 2.5 (2025)
Animal Bioscience
목적: 산란계는 전 세계 농업에서 핵심적인 자원으로, 알 생산을 통해 경제적이면서도 영양가 높은 단백질 공급원으로 평가된다. 본 연구의 목적은 Hy-Line Brown 산란계의 출생부터 산란 후 단계까지 장내 미생물군집의 발달적 변화 양상을 종합적으로 특성화하는 것이다. 방법: 총 100마리의 Hy-Line Brown 산란계를 통제된 조건에서 사육하고, 산란 후 3개 시점(151, 302, 422일)에 분변과 회장(ileal) 내용물을 수집하였다. 시료에서 DNA를 추출한 뒤, Illumina MiSeq 플랫폼을 이용하여 16S rRNA 유전자의 V4 영역을 시퀀싱하였다. 랜덤 포레스트 알고리즘을 적용하여 미생물 예측인자를 확인하고 연령과의 관련성을 탐색하였다. 결과: 체중 증가는 151일까지 빠르게 증가하다가 그 이후 422일까지 안정화되었다. 분변 미생물군집의 다양성은 302일까지 증가한 반면, 회장 내용물에서는 101일까지 증가하였다가 감소하였다. 모든 단계에서 Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes가 우점하는 문(phylum)이었다. Lactobacillus의 풍부도는 모든 채집 지점에서 10일에 최고치(33.75%)를 보였으며, Escherichia-Shigella는 21일에 최대에 도달했으나 422일에 이르러 점차 2.88%로 감소하였다(p<0.05). 기계학습 분석 결과, Candidatus Arthromitus와 Clostridia vadinBB60 그룹은 모든 시점과 채집 지점에서 일관되게 가장 높은 중요도 점수를 나타냈다. 302일에 체중은 분변의 Brevibacterium(R = -0.87; p<0.05) 및 Brachybacterium(R = -0.79; p<0.05)과 음의 상관관계를 보였다. 결론: 본 연구는 산란 시작부터 산란 후 1년까지 Hy-Line Brown에서 장내 미생물군집의 변화를 조사하였으며, 칼슘이 풍부한 산란계 사료의 영향을 강조하였다. 본 결과는 미생물군집의 동태와 연령 간의 관련성에 대한 통찰을 제공하며, 이를 식이 전략을 최적화하고 산란계의 생산성과 건강을 향상시키는 데 적용할 수 있다.
https://doi.org/10.5713/ab.24.0889
Laying
Biology
Dynamics (music)
Zoology
Engineering
Psychology
3
article
|
인용수 2
·
2024
Postbiotic-based recombinant receptor activator of NF-κB ligand enhanced oral vaccine efficiency in chicken
Biao Xuan, Jongbin Park, Seojin Choi, Eun Bae Kim
IF 4.3 (2024)
Applied Microbiology and Biotechnology
기능성 M 세포는 수용체 활성화인자 NF-κB 리간드(RANKL)에 의해 분화되고, 장강 내 항원을 포획하여 면역 반응을 개시한다. 우리는 M 세포 분화를 촉진하고 경구 백신의 효능을 평가하기 위해, 포스트바이오틱 기반 재조합 병아리 RANKL(cRANKL)을 사용하고자 하였다. 병아리는 인산완충식염수(PBS), 야생형 Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403의 세포 추출물(WT_CE), 또는 cRANKL을 발현하는 재조합 L. lactis의 세포 추출물(cRANKL_CE)을 투여받는 세 군으로 나누었다. M 세포 표지자의 발현을 측정하였고, 장내 미생물군을 프로파일링하였다. 감염성 버설질병(IBD) 백신의 효능은 cRANKL_CE를 12일 연속 투여한 후 평가하였다. cRANKL_CE를 투여한 닭은 PBS 군과 비교하여 Annexin A5(ANXA5) mRNA 발현 수준이 유의하게 더 높았다(p = 0.038). 반면 PBS 대 WT_CE 간에는 유의한 차이가 없었다(p = 0.657). 장내 미생물군 분석에서는 유의한 변화가 관찰되지 않았다. 그러나 Peyer’s patches에서 Escherichia-Shigella의 상대적 풍부도는 ANXA5 mRNA 발현과 음의 상관관계를 보였으며(r = -0.43, p = 0.019), cRANKL_CE/IBD는 PBS/IBD보다 IBD 특이적 분변 IgA 수준이 유의하게 더 높았다(p = 0.018; PBS/IBD 대 WT_CE/IBD, p = 0.217). 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 M 세포 표지자의 발현과 경구 백신의 효능을 효과적으로 향상시켰다. 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL 투여 후 장내 미생물군에는 유의한 변화가 관찰되지 않았다. 이러한 전략은 사료 첨가제 및 보조제(adjuvant) 개발에 활용될 수 있다. 핵심 포인트: • 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 닭에서 ANXA5 발현을 증가시켰다. • Escherichia-Shigella의 상대적 풍부도는 ANXA5 발현과 음의 상관관계를 보였다. • 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 경구 백신의 효능을 효과적으로 향상시켰다.
https://doi.org/10.1007/s00253-024-13237-9
Recombinant DNA
Lactococcus lactis
Biology
Receptor
Antigen
Microbiology
Immune system
Molecular biology
Immunology
Bacteria
최신 정부 과제
14
과제 전체보기
1
2024년 4월-2027년 4월
|289,987,000
특정 장내미생물 종을 억제하기 위한 신규 플랫폼 개발 및 이를 활용한 닭의 체중 변화 유도
최종 목표 1: 특정 “Target 장내미생물” 억제를 위한 백신 플랫폼의 개발최종 목표 2: 백신을 활용한 닭의 경제형질(체중) 변화 유도
장내미생물
체중
백신
사료 첨가제
2
주관|
2019년 2월-2023년 2월
|100,000,000
M Cell 조절 기능성 단백질(Chicken RANKL)을 통한 양계 감염성 질병 예방 전략 개발
면역 보강 단백질인 RANKL을 함유하고 있는 유산균 배양액을 닭에게 사료와 함께 급여하여 장내 M Cell의 수, 혈중 면역글로불린과 골건강 지표, 장내 Commensal 또는 Pathogenic Bacteria/Virus Profile의 변화, 경구백신 투여 후 항체 형성 등에 관한 효과를 검증하는 기초 연구를 수행하고자 함. - Chicken 유래 RANKL 유전자(cRANKL라고 지칭. cRANKL을 활용한 선행 연구 없음)를 합성(Gene Synthesis)하여 유산균에서 발현/분비시키고, 발현된 cRANKL 단백질이 유산균 배양액에 분비가 되면, in vitro Cell Culture System에서 이 cRANKL 단백질이 Activity를 지니는지 확인. - Chicken용 cRANKL 함유 유산균 배양액이 Mouse 장내 M Cell 수의 증가, 면역력/골건강, 장내미생물균총 등에 미치는 영향을 확인. (양계 사양실험 전 단계 규모로 실시) - Chicken용 cRANKL 함유 유산균 배양액이 장내 M Cell 수의 증가, 면역력/골건강, 장내미생물균총 등에 미치는 영향을 확인하고, 최적의 급여량(Dose)을 결정. - Chicken에게 최적 Dose(3차년도)의 cRANKL 함유 유산균 배양액을 급여 후, 경구 Vaccine(IBD 경구 백신)을 투여하여 항체의 증가 여부 확인, 면역력/골건강, 장내미생물균총 등에 미치는 영향을 확인.
면역 환경
환경 미생물
면역 보강 단백질
RANKL
경구백신
면역 증강
질병예방
육계
M Cell
3
주관|
2019년 2월-2023년 2월
|100,000,000
M Cell 조절 기능성 단백질(Chicken RANKL)을 통한 양계 감염성 질병 예방 전략 개발
면역 보강 단백질인 RANKL을 함유하고 있는 유산균 배양액을 닭에게 사료와 함께 급여하여 장내 M Cell의 수, 혈중 면역글로불린과 골건강 지표, 장내 Commensal 또는 Pathogenic Bacteria/Virus Profile의 변화, 경구백신 투여 후 항체 형성 등에 관한 효과를 검증하는 기초 연구를 수행하고자 함. - Chicken 유래 RANKL 유전자(cRANKL라고 지칭. cRANKL을 활용한 선행 연구 없음)를 합성(Gene Synthesis)하여 유산균에서 발현/분비시키고, 발현된 cRANKL 단백질이 유산균 배양액에 분비가 되면, in vitro Cell Culture System에서 이 cRANKL 단백질이 Activity를 지니는지 확인. - Chicken용 cRANKL 함유 유산균 배양액이 Mouse 장내 M Cell 수의 증가, 면역력/골건강, 장내미생물균총 등에 미치는 영향을 확인. (양계 사양실험 전 단계 규모로 실시) - Chicken용 cRANKL 함유 유산균 배양액이 장내 M Cell 수의 증가, 면역력/골건강, 장내미생물균총 등에 미치는 영향을 확인하고, 최적의 급여량(Dose)을 결정. - Chicken에게 최적 Dose(3차년도)의 cRANKL 함유 유산균 배양액을 급여 후, 경구 Vaccine(IBD 경구 백신)을 투여하여 항체의 증가 여부 확인, 면역력/골건강, 장내미생물균총 등에 미치는 영향을 확인.
면역 환경
환경 미생물
면역 보강 단백질
RANKL
경구백신
면역 증강
질병예방
육계
M Cell
최신 특허
특허 전체보기
상태출원연도과제명출원번호상세정보
거절2022RANKL 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터, 이것을 이용하는 양계용 면역증강용 보조제 및 사료 첨가제1020220052747
등록2020빙어 종 판별용 프라이머 세트, 이를 포함하는 키트, 및 이를 이용한 판별 방법1020200034254
소멸2018락토바실러스 속 진단용 종-특이적 프라이머 및 이의 용도1020180153563
전체 특허

RANKL 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터, 이것을 이용하는 양계용 면역증강용 보조제 및 사료 첨가제

상태
거절
출원연도
2022
출원번호
1020220052747

빙어 종 판별용 프라이머 세트, 이를 포함하는 키트, 및 이를 이용한 판별 방법

상태
등록
출원연도
2020
출원번호
1020200034254

락토바실러스 속 진단용 종-특이적 프라이머 및 이의 용도

상태
소멸
출원연도
2018
출원번호
1020180153563

주식회사 디써클

대표 장재우,이윤구서울특별시 강남구 역삼로 169, 명우빌딩 2층 (TIPS타운 S2)대표 전화 0507-1312-6417이메일 info@rndcircle.io사업자등록번호 458-87-03380호스팅제공자 구글 클라우드 플랫폼(GCP)

© 2026 RnDcircle. All Rights Reserved.