< 0.05) 각각 아미노산 및 질소 대사에 관여하는 39 및 25 MetaCyc 경로의 풍부함이 증가하였다. 이러한 결과는 사육 밀도나 추가적인 처리의 변화를 없이 사육 공간을 늘리는 것만으로도 육계에서 성장과 장내 미생물군집 건강을 모두 향상시킬 수 있음을 시사한다. 본 연구 결과는 닭의 사육 환경과 장내 미생물군집 간의 관계에 대한 통찰을 제공한다.

목적: 산란계는 전 세계 농업에서 핵심적인 자원으로, 알 생산을 통해 경제적이면서도 영양가 높은 단백질 공급원으로 평가된다. 본 연구의 목적은 Hy-Line Brown 산란계의 출생부터 산란 후 단계까지 장내 미생물군집의 발달적 변화 양상을 종합적으로 특성화하는 것이다. 방법: 총 100마리의 Hy-Line Brown 산란계를 통제된 조건에서 사육하고, 산란 후 3개 시점(151, 302, 422일)에 분변과 회장(ileal) 내용물을 수집하였다. 시료에서 DNA를 추출한 뒤, Illumina MiSeq 플랫폼을 이용하여 16S rRNA 유전자의 V4 영역을 시퀀싱하였다. 랜덤 포레스트 알고리즘을 적용하여 미생물 예측인자를 확인하고 연령과의 관련성을 탐색하였다. 결과: 체중 증가는 151일까지 빠르게 증가하다가 그 이후 422일까지 안정화되었다. 분변 미생물군집의 다양성은 302일까지 증가한 반면, 회장 내용물에서는 101일까지 증가하였다가 감소하였다. 모든 단계에서 Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes가 우점하는 문(phylum)이었다. Lactobacillus의 풍부도는 모든 채집 지점에서 10일에 최고치(33.75%)를 보였으며, Escherichia-Shigella는 21일에 최대에 도달했으나 422일에 이르러 점차 2.88%로 감소하였다(p<0.05). 기계학습 분석 결과, Candidatus Arthromitus와 Clostridia vadinBB60 그룹은 모든 시점과 채집 지점에서 일관되게 가장 높은 중요도 점수를 나타냈다. 302일에 체중은 분변의 Brevibacterium(R = -0.87; p<0.05) 및 Brachybacterium(R = -0.79; p<0.05)과 음의 상관관계를 보였다. 결론: 본 연구는 산란 시작부터 산란 후 1년까지 Hy-Line Brown에서 장내 미생물군집의 변화를 조사하였으며, 칼슘이 풍부한 산란계 사료의 영향을 강조하였다. 본 결과는 미생물군집의 동태와 연령 간의 관련성에 대한 통찰을 제공하며, 이를 식이 전략을 최적화하고 산란계의 생산성과 건강을 향상시키는 데 적용할 수 있다.

기능성 M 세포는 수용체 활성화인자 NF-κB 리간드(RANKL)에 의해 분화되고, 장강 내 항원을 포획하여 면역 반응을 개시한다. 우리는 M 세포 분화를 촉진하고 경구 백신의 효능을 평가하기 위해, 포스트바이오틱 기반 재조합 병아리 RANKL(cRANKL)을 사용하고자 하였다. 병아리는 인산완충식염수(PBS), 야생형 Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403의 세포 추출물(WT_CE), 또는 cRANKL을 발현하는 재조합 L. lactis의 세포 추출물(cRANKL_CE)을 투여받는 세 군으로 나누었다. M 세포 표지자의 발현을 측정하였고, 장내 미생물군을 프로파일링하였다. 감염성 버설질병(IBD) 백신의 효능은 cRANKL_CE를 12일 연속 투여한 후 평가하였다. cRANKL_CE를 투여한 닭은 PBS 군과 비교하여 Annexin A5(ANXA5) mRNA 발현 수준이 유의하게 더 높았다(p = 0.038). 반면 PBS 대 WT_CE 간에는 유의한 차이가 없었다(p = 0.657). 장내 미생물군 분석에서는 유의한 변화가 관찰되지 않았다. 그러나 Peyer’s patches에서 Escherichia-Shigella의 상대적 풍부도는 ANXA5 mRNA 발현과 음의 상관관계를 보였으며(r = -0.43, p = 0.019), cRANKL_CE/IBD는 PBS/IBD보다 IBD 특이적 분변 IgA 수준이 유의하게 더 높았다(p = 0.018; PBS/IBD 대 WT_CE/IBD, p = 0.217). 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 M 세포 표지자의 발현과 경구 백신의 효능을 효과적으로 향상시켰다. 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL 투여 후 장내 미생물군에는 유의한 변화가 관찰되지 않았다. 이러한 전략은 사료 첨가제 및 보조제(adjuvant) 개발에 활용될 수 있다. 핵심 포인트: • 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 닭에서 ANXA5 발현을 증가시켰다. • Escherichia-Shigella의 상대적 풍부도는 ANXA5 발현과 음의 상관관계를 보였다. • 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 경구 백신의 효능을 효과적으로 향상시켰다.

mRANKL_CE 군에서 다른 두 군보다 더 풍부하게 나타났다. 우리의 결과는 mRANKL_CE의 세포 추출물이 장에 유의한 영향을 주지 않으면서 효과적인 역할을 할 수 있음을 시사한다. 이러한 전략은 단백질 의약품의 개발에 유용할 수 있다.

이러한 결과는 HFD(고지방식이) 급여 마우스에서 식이 보충이 장내 미생물 군집 구성과 서로 다르게 연관됨을 집합적으로 시사한다. 본 연구는 탐색적 범위에서 수행되었고 표본 크기도 제한적이었음에도 불구하고, 관찰된 미생물 변화는 대사 변화와 일관되게 평행하게 나타났으며, 이는 생물학적으로 그럴듯한 연관성을 뒷받침하여 추가적인 기전 연구가 필요함을 시사한다.

목적: Lacticaseibacillus rhamnosus는 인간 및 동물 건강에서 치료적 용도로 활용되는, 널리 알려진 프로바이오틱 박테리아이다. Panax ginseng에서 분리된 L. rhamnosus B3421 균주는 항산화 및 항염증 특성과 관련이 있는 것으로 보고되어, 그 기능적 잠재력을 뒷받침한다. 본 연구에서는 L. rhamnosus B3421의 게놈을 서열분석하고 특성화하여, 안전성과 기능성과 관련된 유전체 특징에 초점을 맞춰 인간의 건강관리 및 동물 적용을 위한 프로바이오틱 잠재력을 평가하고자 하였다. 자료 설명: 본 연구에서 우리는 Panax ginseng C. A. Meyer(인삼)로부터 L. rhamnosus B3421을 분리하고 전장유전체(whole-genome) 서열분석을 수행하였다. L. rhamnosus B3421의 게놈은 3,000,051개의 염기쌍(bp)으로 구성되며, 구아닌+시토신(G+C) 함량은 46.70%이다. 59개의 tRNA, 15개의 rRNA, 그리고 2,807개의 코딩 서열(CDSs)을 암호화한다. 이들 CDS 중 99.13%(2,758개 단백질)는 Orthologous Group(COGs) 분류 시스템에서 기능적 범주로 할당되었고, 49개 단백질은 특성 규명이 이루어지지 않았다. 게놈 분석 결과 항생제 내성(ABR) 또는 항균제 내성(AMR) 유전자는 확인되지 않았으며, 이는 L. rhamnosus B3421이 안전한 프로바이오틱 박테리아로서 장내 미생물군에서 항생제 내성의 수평적 전이에 기여할 위험이 최소임을 시사한다. 또한 게놈에는 BAGEL4 분석을 통해 확인된 ggmotif(PF10439), Enterocin X chain beta, Carnocin CP52와 관련된 유전자들이 포함되어 있으며, 환원효소 또는 퍼옥시다아제(peroxidase) 활성과 관련된 24개의 다른 유전자도 함께 존재한다. 이러한 유전자들은 병원성 박테리아 및 산화 스트레스에 대한 경쟁적 우위를 제공할 수 있다. 본 연구의 결과는 L. rhamnosus B3421의 프로바이오틱 잠재성과 인간 및 동물 건강 증진을 위한 향후 적용 가능성을 강조한다.

목적: Leuconostoc menseteroides는 안전성이 확립된 젖산균의 한 종으로, 김치를 비롯한 발효식품에서 흔히 분리되며 Generally Regarded as Safe (GRAS)로 분류된다. 이 종은 대한민국에서 김치 발효를 위한 스타터 배양균으로 사용된다. 본 연구에서는 Panax ginseng C. A. Meyer(인삼, Ginseng)에서 분리한 Leconostoc menseteroides B22051의 프로바이오틱 잠재력을 평가하고자, 사람과 가축 모두의 적용과 관련된 항생제 내성, 박테리오신, 레독스(redox) 유전자를 포함한 프로바이오틱 특성을 유전체 분석을 통해 조사하였다. 자료 설명: 우리는 Panax ginseng Meyer에서 후보 프로바이오틱 균주를 분리하였고, L. menseteroides B22051의 완전한 유전체를 해독하였다. 완전 유전체의 크기는 1,994,797 bp였으며, guanine + cytosine(G + C) 함량은 37.7%였다. 유전체는 1개의 염색체(1,943,350 bp)와 2개의 플라스미드(37,364 bp 및 14,083 bp)로 구성되었다. 유전체 주석 결과 71개의 전달 RNA(tRNA), 24개의 리보솜 RNA(rRNA), 그리고 1,987개의 코딩 서열(CDSs)이 확인되었다. 또한, 이 1,987개의 CDS 중 각각 98.09%와 64.92%가 COG 및 Gene Ontology 분류 체계에 할당되었다. CARD v3.2.0 분석을 통해 vanT(32.61% 상동성) 및 vanY(34.36% 상동성)의 부분 서열 2개가 검출되었으며, 시험관 내(in vitro)에서 반코마이신 내성이 확인되었음에도 불구하고 낮은 서열 상동성과 완전한 van 오페론의 부재는 이 내성이 획득된 것이 아니라 내재적(intrinsic)임을 시사한다. Bacteriocin Class IIC(염색체에 암호화됨) 내 Enterocin과 연관된 entero_X_chain_beta 유전자와, Gene Ontology 분석을 통해 확인된 28개의 환원효소(reductase) 유전자 및 1개의 산화효소(oxidase) 유전자가 L. mesenteroides B22051에 존재한다. 이러한 유전체 기반의 결과는 L. menseteroides B22051의 프로바이오틱 특성을 뒷받침한다.

서론: , 체질량지수(BMI) 및 대사 지표와의 관련성에 관하여. 방법: 감염, 위축성 위염, 또는 장상피화생은 제외하였다. 대상자당 4개의 전정부 생검으로부터 위 미생물군을 16S rRNA 시퀀싱 및 메타게놈 예측을 통한 기능 프로파일링으로 분석하였다. 결과 및 논의: , 과체중/비만군에서 유의하게 감소하였다. 기능 예측 결과, BMI 범주 전반에 걸쳐 지방산, 아미노산, 비타민 및 탄수화물 대사와 관련된 경로가 서로 다르게 풍부하게 나타났다. 이러한 결과는 위 미생물군의 변화가 비만 및 대사 이상 조절과 연관될 수 있음을 시사한다.

< 0.05) 각각 아미노산 및 질소 대사에 관여하는 39 및 25 MetaCyc 경로의 풍부함이 증가하였다. 이러한 결과는 사육 밀도나 추가적인 처리의 변화를 없이 사육 공간을 늘리는 것만으로도 육계에서 성장과 장내 미생물군집 건강을 모두 향상시킬 수 있음을 시사한다. 본 연구 결과는 닭의 사육 환경과 장내 미생물군집 간의 관계에 대한 통찰을 제공한다.

목적: 산란계는 전 세계 농업에서 핵심적인 자원으로, 알 생산을 통해 경제적이면서도 영양가 높은 단백질 공급원으로 평가된다. 본 연구의 목적은 Hy-Line Brown 산란계의 출생부터 산란 후 단계까지 장내 미생물군집의 발달적 변화 양상을 종합적으로 특성화하는 것이다. 방법: 총 100마리의 Hy-Line Brown 산란계를 통제된 조건에서 사육하고, 산란 후 3개 시점(151, 302, 422일)에 분변과 회장(ileal) 내용물을 수집하였다. 시료에서 DNA를 추출한 뒤, Illumina MiSeq 플랫폼을 이용하여 16S rRNA 유전자의 V4 영역을 시퀀싱하였다. 랜덤 포레스트 알고리즘을 적용하여 미생물 예측인자를 확인하고 연령과의 관련성을 탐색하였다. 결과: 체중 증가는 151일까지 빠르게 증가하다가 그 이후 422일까지 안정화되었다. 분변 미생물군집의 다양성은 302일까지 증가한 반면, 회장 내용물에서는 101일까지 증가하였다가 감소하였다. 모든 단계에서 Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes가 우점하는 문(phylum)이었다. Lactobacillus의 풍부도는 모든 채집 지점에서 10일에 최고치(33.75%)를 보였으며, Escherichia-Shigella는 21일에 최대에 도달했으나 422일에 이르러 점차 2.88%로 감소하였다(p<0.05). 기계학습 분석 결과, Candidatus Arthromitus와 Clostridia vadinBB60 그룹은 모든 시점과 채집 지점에서 일관되게 가장 높은 중요도 점수를 나타냈다. 302일에 체중은 분변의 Brevibacterium(R = -0.87; p<0.05) 및 Brachybacterium(R = -0.79; p<0.05)과 음의 상관관계를 보였다. 결론: 본 연구는 산란 시작부터 산란 후 1년까지 Hy-Line Brown에서 장내 미생물군집의 변화를 조사하였으며, 칼슘이 풍부한 산란계 사료의 영향을 강조하였다. 본 결과는 미생물군집의 동태와 연령 간의 관련성에 대한 통찰을 제공하며, 이를 식이 전략을 최적화하고 산란계의 생산성과 건강을 향상시키는 데 적용할 수 있다.

기능성 M 세포는 수용체 활성화인자 NF-κB 리간드(RANKL)에 의해 분화되고, 장강 내 항원을 포획하여 면역 반응을 개시한다. 우리는 M 세포 분화를 촉진하고 경구 백신의 효능을 평가하기 위해, 포스트바이오틱 기반 재조합 병아리 RANKL(cRANKL)을 사용하고자 하였다. 병아리는 인산완충식염수(PBS), 야생형 Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403의 세포 추출물(WT_CE), 또는 cRANKL을 발현하는 재조합 L. lactis의 세포 추출물(cRANKL_CE)을 투여받는 세 군으로 나누었다. M 세포 표지자의 발현을 측정하였고, 장내 미생물군을 프로파일링하였다. 감염성 버설질병(IBD) 백신의 효능은 cRANKL_CE를 12일 연속 투여한 후 평가하였다. cRANKL_CE를 투여한 닭은 PBS 군과 비교하여 Annexin A5(ANXA5) mRNA 발현 수준이 유의하게 더 높았다(p = 0.038). 반면 PBS 대 WT_CE 간에는 유의한 차이가 없었다(p = 0.657). 장내 미생물군 분석에서는 유의한 변화가 관찰되지 않았다. 그러나 Peyer’s patches에서 Escherichia-Shigella의 상대적 풍부도는 ANXA5 mRNA 발현과 음의 상관관계를 보였으며(r = -0.43, p = 0.019), cRANKL_CE/IBD는 PBS/IBD보다 IBD 특이적 분변 IgA 수준이 유의하게 더 높았다(p = 0.018; PBS/IBD 대 WT_CE/IBD, p = 0.217). 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 M 세포 표지자의 발현과 경구 백신의 효능을 효과적으로 향상시켰다. 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL 투여 후 장내 미생물군에는 유의한 변화가 관찰되지 않았다. 이러한 전략은 사료 첨가제 및 보조제(adjuvant) 개발에 활용될 수 있다. 핵심 포인트: • 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 닭에서 ANXA5 발현을 증가시켰다. • Escherichia-Shigella의 상대적 풍부도는 ANXA5 발현과 음의 상관관계를 보였다. • 포스트바이오틱 기반 재조합 cRANKL은 경구 백신의 효능을 효과적으로 향상시켰다.

mRANKL_CE 군에서 다른 두 군보다 더 풍부하게 나타났다. 우리의 결과는 mRANKL_CE의 세포 추출물이 장에 유의한 영향을 주지 않으면서 효과적인 역할을 할 수 있음을 시사한다. 이러한 전략은 단백질 의약품의 개발에 유용할 수 있다.