채수천 연구실
원광대학교 의예과
채수천 교수
microRNA
대장암
염증성 대장염
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채수천 연구실
원광대학교 의예과 채수천 교수
채수천 연구실은 대장암과 염증성장질환에서 마이크로RNA가 유전자 발현과 신호전달을 조절하여 종양 진행에 영향을 주는 기전을 연구합니다. IL20RA 연계 JAK1/STAT3 축을 포함한 염증-종양 신호를 분석하고, CDH3, SOX9, SQLE, GTF2E1, ASB8, NOL8, CDR2, TIMP2 및 MMPs 등 표적 유전자의 변화가 세포 기능과 분자 네트워크에 미치는 영향을 규명합니다. 이를 위해 유전자 조절 기반 실험과 단백질 수준 확인, 전사·발현 변화 평가를 결합한 실험 설계를 수행합니다.
microRNA대장암염증성 대장염유전자 발현 조절JAK1/STAT3 신호전달
대표 연구 분야
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IL20RA-매개 JAK1/STAT3 염증-종양 신호 조절 마이크로RNA 연구
MicroRNA-mediated regulation of IL20RA-JAK1/STAT3 inflammatory tumor signaling
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IL20RA-매개 JAK1/STAT3 염증-종양 신호 조절 마이크로RNA 연구
MicroRNA-mediated regulation of IL20RA-JAK1/STAT3 inflammatory tumor signaling
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대장암 세포 증식·이동·사멸 조절 마이크로RNA 표적 유전자 기능 연구
Functional study of microRNA target genes controlling proliferation, migration, and apoptosis in col
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전사 조절자·발현 패턴 및 ECM 리모델링을 조절하는 마이크로RNA 기전 연구
Mechanistic research on microRNA control of transcriptional regulators and extracellular matrix remo
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.
주요 논문
5
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1
Article
|
인용수 0
·
2025MicroRNA 133A Regulates Squalene Epoxidase Expression in Colorectal Cancer Cells to Control Cell Proliferation and Cholesterol Production
Ji‐Su Mo, Santosh Lamichhane, Grinsun Sharma, Soo‐Cheon Chae
IF 1.5 (2025)
Gastroenterology Insights
배경/목적: 대장암(CRC)은 전 세계적으로 가장 흔한 암 중 하나로, 높은 발병률과 사망률을 보인다. 마이크로RNA는 내인성(non-endogenous) 비암호화 RNAs로서, 특정 유전자를 표적함으로써 다양한 암의 발생과 진행에 핵심적인 역할을 한다. 이전에 우리는 인간 CRC 조직에서 MIR133A가 유의하게 감소함을 확인하였다. 본 연구의 목적은 MIR133A의 후보 표적 유전자인 SQLE와의 관련성을 규명하고, CRC 세포에서 이들 간 상호작용을 연구하는 것이다. 방법: 루시퍼레이스 리포터 분석, 정량적 RT-PCR(qRT-PCR), 및 웨스턴 블롯 분석을 통해 수행하였다. 결과: 우리는 SQLE가 MIR133A의 직접 표적 유전자임을 확인하였다. CRC 세포주에 MIR133A1 또는 MIR133A2를 knock-in한 MIR133A KI 세포주와, siSQLE를 형질전환한 CRC 세포를 이용하여, MIR133A가 SQLE 매개 PIK3CA-AKT1 및 CYP24A1 신호전달을 조절함으로써 CRC 세포의 증식과 이동성을 조절함을 확인하였다. 또한 MIR133A가 CRC 세포에서 콜레스테롤 생성 조절에 관여함도 확인하였다. 결론: 본 연구 결과는 MIR133A가 대장암의 중요한 치료 표적임을 시사한다.
https://doi.org/10.3390/gastroent16010005
Squalene monooxygenase
microRNA
Squalene
Colorectal cancer
Cholesterol
Cancer
Cell biology
Cancer research
Cell growth
Downregulation and upregulation
2
Article
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인용수 1
·
2024MicroRNA 429 regulates MMPs expression by modulating TIMP2 expression in colon cancer cells and inflammatory colitis
Seol‐Hee Han, Ji‐Su Mo, Ki‐Jung Yun, Soo‐Cheon Chae
IF 1.7 (2024)
Genes & Genomics
https://doi.org/10.1007/s13258-024-01520-y
Downregulation and upregulation
Matrix metalloproteinase
Cancer research
microRNA
Extracellular matrix
Colitis
Biology
Colorectal cancer
Ulcerative colitis
Cancer
3
Article
|
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인용수 3
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2023MicroRNA 452 regulates SHC1 expression in human colorectal cancer and colitis
Ji‐Su Mo, Santosh Lamichhane, Ki‐Jung Yun, Soo‐Cheon Chae
IF 1.6 (2023)
Genes & Genomics
http://dx.doi.org/10.1007/s13258-023-01432-3
Biology
microRNA
Colitis
Colorectal cancer
Western blot
Carcinogenesis
Cancer research
Signal transduction
Transfection
Molecular biology
최신 정부 과제
7
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1
주관|
2020년 2월-2023년 2월
|200,000,000원대장암 연관 온코마이크로바이오타의 항체를 발굴하여 대장암 조기진단 칩 개발 및 치료기술
▶ 대장암 환자혈장 vs 정상인혈장에 반응하는 장내 마이크로바이오타 발굴
- 건강한 사람(20명)의 혈장 및 대장암 환자(발생 부위별 및 병기별 30명)의 혈장
- 장내미생물 library (629 종)를 이용하여 제작한 장내미생물 microarray chip을 이용하여 cell microbiota microarray 실시
- Gut micribiota microarray 분석을 통하여 대장암 발생에 특이적인 oncomicrobiota의 IgM 및 IgG와 발굴
▶ 대장암 환자 암 조직 vs 정상조직 연관 장내 마이크로바이오타 발굴
- 대변에서는 확보할 수 없는 대장암 환자의 암 발생 부위별 암 조직 및 정상 장 조직에서 장내 미생물 확보
- 메타지놈(meta genome) 분석으로 암 부위에 많거나 적은 빈도로 존재하는 장내 미생물군집 발굴.
- Whole genome sequencing으로 마이크로바이옴(microbiome) 분석
▶ 장내미생물 array 결과 vs 암 조직에 연관된 온코마이크로바이오타 결과 비교분석
- 대장암 조직 특이 장내미생물과 대장암 환자 혈장을 이용하여 대장암 발생에 관여하는 oncomicrobiota 발굴
- 대장암 발생 시기(TNM)별 및 부위별 특이적 oncomicrobiota 분류 및 클론된 장내미생물 확보
▶ 대장암 연관 oncomicrobiota 항체 분석
- 대장암 특이적인 oncomicrobiota의 IgM 및 IgG에 대한 아미노산 서열을 Mass spectrometry (MALDI-TOF MS) 등 을 이용하여 분석
- oncomicrobiota에 대한 항체의 isotype을 확인 및 Immunoprecipitation (IP) 또는 co-immunoprecipitation (co-IP) 기법 등을 이용하여 항원을 발굴
▶ 대장암 연관 oncomicrobiota 항원을 이용한 진단 칩 개발
- 확보한 oncomicrobiota의 항체에 대한 다양한 항원 정보를 이용하여 대장암 조기진단 칩을 제작하여 대장암 환자의 혈장을 이용한 검증
- 기존 출시된 다양한 대장암 진단시약 및 키트와 성능을 비교분석하여 우월성 증명
▶ 대장암 연관 장내미생물의 단독 및 군집 배양
- 클론된 장내미생물 정보를 이용하여 확보한 대장암 특이 장내 미생물 배양기술 확립
- 대장암 발생 시기별 연관 oncomicrobiota의 분포비율 정보를 응용하여 단독 및 군집배양을 통한 대사체(metabolomics) 분석
▶ 대장암 연관 장내 미생물의 단독 및 군집을 이용한 마우스 실험
- 정상 마우스 및 염증성대장암 마우스모델을 대상으로 대장암 특이 oncomicrobiota의 상호작용 연구
- oncomicrobiota에 의한 마우스 장을 이용한 유전체 발현 비교분석
▶ 대장암 연관 oncomicrobiota에 대한 치료 정보
- 대장암 연관 oncomicrobiota들의 공생배양(co-culture)을 통한 상호작용 연구
- 대장암 치료를 위한 oncomicrobiotic 적용으로 다양한 발암조절 기전연구
대장암
장내미생물
온코마이크로바이오타
세포 마이크로어레이
진단항원
장내미생물 항체
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주관|
2020년 2월-2023년 2월
|200,000,000원대장암 연관 온코마이크로바이오타의 항체를 발굴하여 대장암 조기진단 칩 개발 및 치료기술
▶ 대장암 환자혈장 vs 정상인혈장에 반응하는 장내 마이크로바이오타 발굴
- 건강한 사람(20명)의 혈장 및 대장암 환자(발생 부위별 및 병기별 30명)의 혈장
- 장내미생물 library (629 종)를 이용하여 제작한 장내미생물 microarray chip을 이용하여 cell microbiota microarray 실시
- Gut micribiota microarray 분석을 통하여 대장암 발생에 특이적인 oncomicrobiota의 IgM 및 IgG와 발굴
▶ 대장암 환자 암 조직 vs 정상조직 연관 장내 마이크로바이오타 발굴
- 대변에서는 확보할 수 없는 대장암 환자의 암 발생 부위별 암 조직 및 정상 장 조직에서 장내 미생물 확보
- 메타지놈(meta genome) 분석으로 암 부위에 많거나 적은 빈도로 존재하는 장내 미생물군집 발굴.
- Whole genome sequencing으로 마이크로바이옴(microbiome) 분석
▶ 장내미생물 array 결과 vs 암 조직에 연관된 온코마이크로바이오타 결과 비교분석
- 대장암 조직 특이 장내미생물과 대장암 환자 혈장을 이용하여 대장암 발생에 관여하는 oncomicrobiota 발굴
- 대장암 발생 시기(TNM)별 및 부위별 특이적 oncomicrobiota 분류 및 클론된 장내미생물 확보
▶ 대장암 연관 oncomicrobiota 항체 분석
- 대장암 특이적인 oncomicrobiota의 IgM 및 IgG에 대한 아미노산 서열을 Mass spectrometry (MALDI-TOF MS) 등 을 이용하여 분석
- oncomicrobiota에 대한 항체의 isotype을 확인 및 Immunoprecipitation (IP) 또는 co-immunoprecipitation (co-IP) 기법 등을 이용하여 항원을 발굴
▶ 대장암 연관 oncomicrobiota 항원을 이용한 진단 칩 개발
- 확보한 oncomicrobiota의 항체에 대한 다양한 항원 정보를 이용하여 대장암 조기진단 칩을 제작하여 대장암 환자의 혈장을 이용한 검증
- 기존 출시된 다양한 대장암 진단시약 및 키트와 성능을 비교분석하여 우월성 증명
▶ 대장암 연관 장내미생물의 단독 및 군집 배양
- 클론된 장내미생물 정보를 이용하여 확보한 대장암 특이 장내 미생물 배양기술 확립
- 대장암 발생 시기별 연관 oncomicrobiota의 분포비율 정보를 응용하여 단독 및 군집배양을 통한 대사체(metabolomics) 분석
▶ 대장암 연관 장내 미생물의 단독 및 군집을 이용한 마우스 실험
- 정상 마우스 및 염증성대장암 마우스모델을 대상으로 대장암 특이 oncomicrobiota의 상호작용 연구
- oncomicrobiota에 의한 마우스 장을 이용한 유전체 발현 비교분석
▶ 대장암 연관 oncomicrobiota에 대한 치료 정보
- 대장암 연관 oncomicrobiota들의 공생배양(co-culture)을 통한 상호작용 연구
- 대장암 치료를 위한 oncomicrobiotic 적용으로 다양한 발암조절 기전연구
대장암
장내미생물
온코마이크로바이오타
세포 마이크로어레이
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주관|
2017년 2월-2020년 2월
|100,000,000원대장염 및 대장암에서 MIR375 기능과 그 표적유전자와 상호작용 규명
본 과제는 MIR375가 대장암 및 마우스 대장염 조직에서 감소되는 현상을 바탕으로, MIR375와 표적유전자 CTGF의 관계를 밝혀 대장암 조기진단·치료용 분자마커 가능성을 탐색하는 연구임.
연구목표는 MIR375-CTGF 상호기능을 대장암 조직·대장암 세포주·마우스 이종이식에서 규명하고, CRISPR/CAS9로 MIR375 녹아웃 세포주 및 마우스를 제작해 대장염→대장암 발생·진행 기작을 이해하는 데 있음. 연구내용은 pre-MIR375/anti-MIR375 및 CTGF siRNA로 EGFR 신호전달(PI3K/AKT, RAS/RAF/ERK) 조절 여부를 Caco2, HT29, HCT116, SW480에서 분석하고, MTT, cell cycle 및 apoptosis, cell migration, xenograft, 면역염색, cetuximab과의 시너지 평가 수행함. 또한 MIR375 녹아웃에 대한 RNA-seq 및 장기별 mRNA 발현 비교를 통해 발병 기작 규명함. 기대효과는 miRNA·mRNA marker 기반 조기진단·치료 정보 확보, 녹아웃 기반 기전연구 경쟁력 및 염증-암 전환 이해·인력양성 기여임.
대장염
대장암
마이크로알엔에이
표적유전자
녹아웃세포주
녹아웃마우스
유전자가위
분자마커
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신규 급성백혈병의 진단용 마커
상태
소멸출원연도
2014출원번호
1020140195946