B형간염 바이러스(hepatitis B virus, HBV) 감염은 간경변증 및 간세포암종과 같은 만성 간질환에 기여하는 주요 세계적 보건 문제이다. 항바이러스 치료의 발전과 예방 백신의 이용 가능성에도 불구하고, 현재의 치료는 특히 만성 HBV 보유자에서 바이러스를 완전히 근절하지 못하는 경우가 흔하며, 만성 HBV 감염으로 인한 간암의 발생률은 여전히 높다. HBV 연구의 주요 장애물은 HBV와 숙주 간의 복잡한 상호작용을 정확하게 재현할 수 있는 감염 모델의 부재이다. 간종양 세포주 및 동물 모델과 같은 기존 모델은 종 특이적 장벽과 완전한 바이러스 생활사에 대한 지지 체계의 부족으로 인해 한계가 있다. 이러한 제한은 HBV 병인 기전의 연구 및 HBV의 완전 근절을 목표로 하는 치료제 개발에 중대한 과제를 제기한다. 최근 수년간 3차원(3D) 간 오가노이드(organioid)는 HBV 감염 및 HBV 매개 간질환을 연구하기 위한 유망한 체외 모델 시스템으로 부상하였다. 이러한 오가노이드는 HBV가 간 종양형성을 촉진하는 능을 포함하여 HBV 병인 기전을 규명하는 데 적절한 생리학적 관련성을 갖춘 플랫폼을 제공한다. 또한 간 오가노이드는 유전적으로 조작될 수 있고, 환자 유래로 제작되며, 확장 및 생물은행(biobank)에 보관될 수 있어 HBV 병인 기전의 연구와 맞춤의학, 약물 발견 및 스크리닝에 강력한 도구가 된다. 본 종설에서는 HBV 감염 및 HBV 연관 간암을 연구하기 위한 연구 모델로서 3D 간 오가노이드의 활용을 탐색하고, 기존 모델에 비해 이들의 장점을 강조한다.