목적: 출혈열-신증후군(hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS)은 대한민국(ROK) 남부에서 높은 발생이 보고되었다. Jeju 도의 애집쥐(Apodemus agrarius chejuensis)에서 Orthohantavirus hantanense(HTNV)의 남부 고유 유전형이 확인되었다. 그러나 이 유전형이 ROK 남부의 HFRS 사례와 연관되는지 여부는 여전히 불명확하다. 본 연구는 남부 HTNV 유전형이 HFRS의 원인 병원체로 작용할 가능성을 평가하고자 하였다. 방법: ROK 남부에서 HFRS 환자 22명과 소형 포유류 193마자(표본)를 수집하였다. 남부 HTNV 유전형에 감염된 환자에서의 임상적 특성을 분석하였다. 환자와 설치류에서 남부 HTNV를 대상으로 앰플리콘 기반 MinION 시퀀싱을 수행하여 이후 계통분석 및 유전 재조합(assortment) 분석이 가능하도록 하였다. 결과: HTNV에 대한 고처리량 시퀀싱은 cycle of threshold 값이 32 미만인 경우 더 높은 커버리지를 보였으며, HFRS 환자 6명과 A. agrarius 시료 7개에서 거의 전장(genome) 서열을 확보하였다. 환자 유래 HTNV의 계통학적 양상은 Jeju 도 및 한국 남부 반도에서의 Apodemus 종 유래 HTNV와 유전적으로 군집함을 보여주었고, 단일 임상 시료에서 M 및 S 분절 간 유전 재조합이 관찰되었다. 고찰: 이러한 결과는 남부 HTNV 유전형이 사람에서 HFRS를 유발할 잠재력이 있음을 시사한다. 계통학적 추론은 남부 HTNV 3분절(tripartite) 유전체의 다양하고 역동적인 특성을 보여준다. 따라서 본 연구는 정형항바이러스(orthohantavirus) 감염을 검출하기 위한 능동적 감시와 앰플리콘 시퀀싱의 중요성을 강조한다. 또한 ROK에서 HFRS의 원인으로서 남부 HTNV 유전형의 출현 가능성에 대해 의료진의 인지와 주의를 환기한다.
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