주요 논문
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Article
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인용수 3
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2025Molecular Evolution and Zoonotic Potential of Muju Virus (Orthohantavirus puumalaense) in Craseomys regulus, Republic of Korea
Kyungmin Park, Seong‐Gyu Kim, Jeong‐Ah Kim, Sara Puspareni Prayitno, Jongwoo Kim, Seung‐Ho Lee, Jaeyeon Lee, Y. W. Seo, Augustine Natasha, Hee Il Lee, Kisoon Kim, Won‐Keun Kim, Jin‐Won Song
IF 3.7 (2025)
Journal of Medical Virology
Orthohantavirus puumalaense는 유럽에서 신증후군을 동반한 출혈열을 유발하며, 이의 주요 대표 종으로 푸우말라 바이러스(Puumala virus, PUUV)가 있다. 무주 바이러스(Muju virus, MUJV)는 Craseomys regulus에 존재하는데, 이는 대한민국(ROK)에 고유한 Arvicolinae 설치류 종이며 O. puumalaense의 한 유전형(genotype)으로도 알려져 있다. 그러나 이들에 대한 유전체 다양성과 인수공통 가능성(zoonotic potential)은 전반적으로 아직 잘 알려져 있지 않다. 이들의 유병률을 조사하기 위해 2012년부터 2023년까지 대한민국의 23개 지역에서 185마리의 들쥐를 채집하였다. 혈청학적 검사에서는 5개 샘플(3.1%)에서 anti-PUUV 면역글로불린 G 항체가 검출된 반면, 역전사 중합효소 연쇄반응(reverse-transcription polymerase chain reaction)으로 동일한 표본에서 MUJV RNA가 2.7%로 확인되었다. 앰플리콘 기반 나노포어 시퀀싱은 거의 완전한 유전체 회수를 가능하게 하여 고해상도 비교 분석을 수행할 수 있게 한다. 계통학적 분석 결과 강원도와 전라북도에서 서로 구별되는 유전 계통이 확인되었다. 진화율 추정은 M 분절보다 S 및 L 분절에서 더 큰 서열 변이를 시사하였다. 인수공통 위험도 평가는 대부분의 MUJV 변이가 중간 내지 높은 범유입(spillover) 가능성을 보였음을 나타냈다. 강원도 철원(Cheorwon)에서 MUJV의 분자적 검출은 알려진 지리적 범위를 확장하며, 이 지역에서 MUJV의 순환에 대한 최초의 분자적 증거를 제공한다. 이러한 결과는 ROK에서 사람의 노출 가능성과 공중보건적 관련성을 평가하기 위해 MUJV에 대한 지속적인 감시 및 혈청유병률(seroprevalence) 연구의 필요성을 강조한다.
https://doi.org/10.1002/jmv.70503
Biology
Virology
Puumala virus
Genotype
Seroprevalence
Phylogenetic tree
Amplicon
Genetic diversity
Virus
Phylogenetics
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인용수 8
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2025Novel human coronavirus in an infant patient with pneumonia, Republic of Korea
Kyungmin Park, Minsoo Shin, Augustine Natasha, Jongwoo Kim, Juyoung Noh, Seong-Gyu Kim, Bohyeon Kim, Jieun Park, Y. W. Seo, Hee-Kyung Cho, Kwan Soo Byun, Ji-Hoon Kim, Young‐Sun Lee, Jung Ok Shim, Won‐Keun Kim, Jin‐Won Song
IF 7 (2025)
Emerging Microbes & Infections
ROK와 중국에서의 spp. 이 사례는 새롭게 출현하는 병원체를 식별하는 데 mNGS의 잠재력을 보여주며, 새로운 HCoV와 연관될 수 있는 일과성 간 기능 이상과 같은 비호흡기 증상 가능성에 대한 인식을 제고한다. 이 사례에서의 간 손상은 새로운 HCoV에 의해 설명될 수 있으나, 그 임상적 의의, 역학적 유병률, 그리고 인수공통(동물-인간) 기원을 규명하기 위해서는 추가 연구가 필요하다.
https://doi.org/10.1080/22221751.2025.2466705
Pneumonia
Coronavirus
Virology
Coronavirus disease 2019 (COVID-19)
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
2019-20 coronavirus outbreak
Medicine
Betacoronavirus
Pandemic
Biology
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인용수 6
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2024Etiological agent and clinical characteristics of haemorrhagic fever with renal syndrome in the southern Republic of Korea: a genomic surveillance study
Sara Puspareni Prayitno, Augustine Natasha, Seonghyeon Lee, Choon‐Mee Kim, You Mi Lee, Kyungmin Park, Jongwoo Kim, Seong-Gyu Kim, Jieun Park, Shivani Rajoriya, Gustavo Palacios, Yeonsu Oh, Jin‐Won Song, Dong‐Min Kim, Won‐Keun Kim
IF 8.5 (2024)
Clinical Microbiology and Infection
목적: 출혈열-신증후군(hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS)은 대한민국(ROK) 남부에서 높은 발생이 보고되었다. Jeju 도의 애집쥐(Apodemus agrarius chejuensis)에서 Orthohantavirus hantanense(HTNV)의 남부 고유 유전형이 확인되었다. 그러나 이 유전형이 ROK 남부의 HFRS 사례와 연관되는지 여부는 여전히 불명확하다. 본 연구는 남부 HTNV 유전형이 HFRS의 원인 병원체로 작용할 가능성을 평가하고자 하였다.
방법: ROK 남부에서 HFRS 환자 22명과 소형 포유류 193마자(표본)를 수집하였다. 남부 HTNV 유전형에 감염된 환자에서의 임상적 특성을 분석하였다. 환자와 설치류에서 남부 HTNV를 대상으로 앰플리콘 기반 MinION 시퀀싱을 수행하여 이후 계통분석 및 유전 재조합(assortment) 분석이 가능하도록 하였다.
결과: HTNV에 대한 고처리량 시퀀싱은 cycle of threshold 값이 32 미만인 경우 더 높은 커버리지를 보였으며, HFRS 환자 6명과 A. agrarius 시료 7개에서 거의 전장(genome) 서열을 확보하였다. 환자 유래 HTNV의 계통학적 양상은 Jeju 도 및 한국 남부 반도에서의 Apodemus 종 유래 HTNV와 유전적으로 군집함을 보여주었고, 단일 임상 시료에서 M 및 S 분절 간 유전 재조합이 관찰되었다.
고찰: 이러한 결과는 남부 HTNV 유전형이 사람에서 HFRS를 유발할 잠재력이 있음을 시사한다. 계통학적 추론은 남부 HTNV 3분절(tripartite) 유전체의 다양하고 역동적인 특성을 보여준다. 따라서 본 연구는 정형항바이러스(orthohantavirus) 감염을 검출하기 위한 능동적 감시와 앰플리콘 시퀀싱의 중요성을 강조한다. 또한 ROK에서 HFRS의 원인으로서 남부 HTNV 유전형의 출현 가능성에 대해 의료진의 인지와 주의를 환기한다.
https://doi.org/10.1016/j.cmi.2024.02.014
Genotype
Biology
Phylogenetic tree
Apodemus agrarius
Virology
Reassortment
Genetic diversity
Genetics
Medicine
Gene
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Article
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인용수 8
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2024High‐resolution phylogeographical surveillance of Hantaan orthohantavirus using rapid amplicon‐based Flongle sequencing, Republic of Korea
Jongwoo Kim, Kyungmin Park, Kijin Kim, Juyoung Noh, Seong‐Gyu Kim, Eun-Young Yang, Hee‐Kyung Cho, Seung‐Ho Lee, Jin Sun No, Geum‐Young Lee, Dae-Sang Lee, Dong‐Hyun Song, Se Hun Gu, Man‐Seong Park, Nam‐Hyuk Cho, Seong Tae Jeong, Won‐Keun Kim, Jin‐Won Song
IF 4.6 (2024)
Journal of Medical Virology
절열열신증후군(hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS) 및 한타바이러스 심폐증후군(hantavirus cardiopulmonary syndrome)의 병인성 병원체인 정오한타바이러스(Orthohantaviruses)는 전 세계적으로 중대한 공중보건 위협을 초래한다. 한타안 정오한타바이러스(Hantaan orthohantavirus, HTNV) 유행은 대한민국(ROK) 북부 지역의 경기도에서 특히 풍토적으로 발생한다. 2017년과 2018년 동안 경기도의 세 지역에서 소형 포유류를 채집하였다. 혈청학적 및 분자적 HTNV 유병률은 각각 25/201(12.4%)과 10/25(40%)이었다. 비용 효율적인 Flongle 칩을 사용한 새로운 나노포어 기반 진단 검사법을 개발하여 설치류 검체에서 3시간 이내에 HTNV 감염을 신속하고 민감하게 검출할 수 있게 하였다. 증폭산물(amplicon) 기반 Flongle 염기서열 분석을 이용하여 고해상도 계통발생(phylogeny) 수준에서 HTNV의 신속한 계통지리학적 감시(phylogeographical surveillance)를 확립하였다. 총 7개의 HTNV 전장유전체 서열이 경기도 파주시(개현리)와 연천군(혜왕아리 및 왕넘리)에서 채집한 야생 설치류로부터 새롭게 확보되었다. 계통발생 분석 결과, 잘 뒷받침되는 진화적 분화와 유전적 다양성이 확인되어, 대한민국 내 정오한타바이러스의 계통지리학적 지도에 대한 해상도를 향상시켰다. HTNV의 삼분절(tripartite) 유전체에서 계통발생 양상의 불일치가 확인되었으며, 이는 각 분절에 대한 서로 다른 진화가 진행되었음을 시사한다. 이러한 결과는 대한민국의 HFRS 풍토 지역에서 한타바이러스 유행을 완화하기 위한 현장 진단, 유전체 기반 감시, 정오한타바이러스의 진화 역학에 관한 핵심적 통찰을 제공한다.
https://doi.org/10.1002/jmv.29346
Outbreak
Virology
Amplicon
Phylogenetic tree
Hantaan virus
Biology
Evolutionary biology
Genome
Zoology
Hantavirus
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Article
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인용수 13
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2022Clinical and Immunological Predictors of Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome Outcome during the Early Phase
Geum‐Young Lee, Won‐Keun Kim, Jin Sun No, Yongjin Yi, Hayne Cho Park, Jaehun Jung, Seungchan Cho, Jingyeong Lee, Seung‐Ho Lee, Kyungmin Park, Jongwoo Kim, Jin‐Won Song
IF 4.7 (2022)
Viruses
출혈열-신증후군(hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS)의 조기 진행을 정확하게 예측하는 능력은 중증 환자에서 이환율과 사망률을 감소시키는 데 결정적으로 중요하다. 그러나 HFRS에서 임상적 예후를 예측하기 위한 바이오마커의 유용성은 여전히 불명확하다. 본 연구의 목적은 면역 기능 관련 단백질의 혈청 수준을 분석하고, HFRS의 임상적 예후를 판단하는 데 도움이 될 수 있는 새로운 바이오마커를 규명하는 것이었다. 효소면역흡착측정법(Enzyme-linked immunosorbent assay), Luminex 및 bioanalyzer 분석을 이용하여 HFRS 환자 26명의 혈청 49개 표본에서 15개의 바이오마커를 정량적으로 검출하였다. 높은 헤모글로빈(Hemoglobin, HGB)과 낮은 요배출량(urine output, UO)은 급성 HFRS와 관련된 잠재적 바이오마커로 확인되었다. 혈청 soluble urokinase plasminogen activator receptor(suPAR)와 C-X-C motif chemokine ligand 10(CXCL10) 값은 질병의 초기 단계에서 증가하였다. suPAR, 인터루킨-10(interleukin-10, IL-10), CXCL10의 상승 및 transforming growth factor-beta 3(transforming growth factor-beta 3, TGF-β3)의 감소는 질병 중증도의 대표적인 예측인자였다. HGB의 상향 조절은 suPAR 및 CXCL10의 높은 수준과 유의한 상관관계를 보였다. 감소된 UO는 suPAR, CXCL10의 증가 및 TGF-β2의 증가와 양의 상관관계를 보였고, vascular endothelial growth factor(혈관내피성장인자) 및 TGF-β3의 감소와도 연관되었다. HFRS에서의 HGB 및 UO 변화 기준, 높은 suPAR, IL-10, CXCL10, 낮은 TGF-β3는 HFRS의 조기 경고 신호를 모니터링하기 위한 전향적 바이오마커에 대해 임상의들의 상당한 주의를 환기한다. 본 연구는 치명적 예후의 조기 예측을 식별하기 위해 HFRS 환자에서 질병의 중증도 및 진행과 관련된 임상적·면역학적 바이오마커에 대한 핵심적인 통찰을 제공한다.
https://doi.org/10.3390/v14030595
SuPAR
Medicine
CXCL10
Biomarker
Internal medicine
Immunology
Gastroenterology
Immune system
Chemokine
Plasminogen activator