송진원 연구실
고려대학교 의과학과
송진원 교수
한타바이러스
바이러스 유전체
나노포어 시퀀싱
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송진원 연구실
고려대학교 의과학과 송진원 교수
송진원 연구실은 임상 및 야생동물 시료에서 바이러스 유전체 정보를 확보하여 분자진단과 유전형·계통 기반 감시를 수행합니다. 특히 multiplex PCR 기반 next-generation sequencing과 나노포어 시퀀싱을 이용해 표적 증폭-시퀀싱-계통분석 워크플로를 구축하고, 한탄바이러스의 현장 대응을 위한 고해상도 능동감시 체계를 개발합니다. 동시에 HFRS 환자 혈청에서 면역 관련 단백질을 정량 분석하여 조기 예후 예측에 활용 가능한 바이오마커를 도출합니다. 이를 통해 역학추적과 환자 중심 모니터링을 연계하는 연구를 수행합니다.
한타바이러스바이러스 유전체나노포어 시퀀싱Multiplex PCR앰플리콘 시퀀싱
대표 연구 분야
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한탄바이러스 대응 고해상도 능동 감시 및 현장 진단
High-Resolution Active Surveillance and Point-of-Care Diagnostics for Hantaviruses
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HFRS 임상 예후 예측을 위한 면역·임상 바이오마커 규명
Identification of Immunological and Clinical Predictors for HFRS Outcomes
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Multiplex PCR 기반 차세대 시퀀싱으로 유전체 진단과 유전형 추적 수행
Genomic Diagnosis and Genotype Tracking Using Multiplex PCR-Based Next-Generation Sequencing
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.
주요 논문
5
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1
Article
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인용수 3
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2025Molecular Evolution and Zoonotic Potential of Muju Virus (Orthohantavirus puumalaense) in Craseomys regulus, Republic of Korea
Kyungmin Park, Seong‐Gyu Kim, Jeong‐Ah Kim, Sara Puspareni Prayitno, Jongwoo Kim, Seung‐Ho Lee, Jaeyeon Lee, Y. W. Seo, Augustine Natasha, Hee Il Lee, Kisoon Kim, Won‐Keun Kim, Jin‐Won Song
IF 3.7 (2025)
Journal of Medical Virology
Orthohantavirus puumalaense는 유럽에서 신증후군을 동반한 출혈열을 유발하며, 이의 주요 대표 종으로 푸우말라 바이러스(Puumala virus, PUUV)가 있다. 무주 바이러스(Muju virus, MUJV)는 Craseomys regulus에 존재하는데, 이는 대한민국(ROK)에 고유한 Arvicolinae 설치류 종이며 O. puumalaense의 한 유전형(genotype)으로도 알려져 있다. 그러나 이들에 대한 유전체 다양성과 인수공통 가능성(zoonotic potential)은 전반적으로 아직 잘 알려져 있지 않다. 이들의 유병률을 조사하기 위해 2012년부터 2023년까지 대한민국의 23개 지역에서 185마리의 들쥐를 채집하였다. 혈청학적 검사에서는 5개 샘플(3.1%)에서 anti-PUUV 면역글로불린 G 항체가 검출된 반면, 역전사 중합효소 연쇄반응(reverse-transcription polymerase chain reaction)으로 동일한 표본에서 MUJV RNA가 2.7%로 확인되었다. 앰플리콘 기반 나노포어 시퀀싱은 거의 완전한 유전체 회수를 가능하게 하여 고해상도 비교 분석을 수행할 수 있게 한다. 계통학적 분석 결과 강원도와 전라북도에서 서로 구별되는 유전 계통이 확인되었다. 진화율 추정은 M 분절보다 S 및 L 분절에서 더 큰 서열 변이를 시사하였다. 인수공통 위험도 평가는 대부분의 MUJV 변이가 중간 내지 높은 범유입(spillover) 가능성을 보였음을 나타냈다. 강원도 철원(Cheorwon)에서 MUJV의 분자적 검출은 알려진 지리적 범위를 확장하며, 이 지역에서 MUJV의 순환에 대한 최초의 분자적 증거를 제공한다. 이러한 결과는 ROK에서 사람의 노출 가능성과 공중보건적 관련성을 평가하기 위해 MUJV에 대한 지속적인 감시 및 혈청유병률(seroprevalence) 연구의 필요성을 강조한다.
https://doi.org/10.1002/jmv.70503
Biology
Virology
Puumala virus
Genotype
Seroprevalence
Phylogenetic tree
Amplicon
Genetic diversity
Virus
Phylogenetics
2
Article
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인용수 8
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2025Novel human coronavirus in an infant patient with pneumonia, Republic of Korea
Kyungmin Park, Minsoo Shin, Augustine Natasha, Jongwoo Kim, Juyoung Noh, Seong-Gyu Kim, Bohyeon Kim, Jieun Park, Y. W. Seo, Hee-Kyung Cho, Kwan Soo Byun, Ji-Hoon Kim, Young‐Sun Lee, Jung Ok Shim, Won‐Keun Kim, Jin‐Won Song
IF 7 (2025)
Emerging Microbes & Infections
ROK와 중국에서의 spp. 이 사례는 새롭게 출현하는 병원체를 식별하는 데 mNGS의 잠재력을 보여주며, 새로운 HCoV와 연관될 수 있는 일과성 간 기능 이상과 같은 비호흡기 증상 가능성에 대한 인식을 제고한다. 이 사례에서의 간 손상은 새로운 HCoV에 의해 설명될 수 있으나, 그 임상적 의의, 역학적 유병률, 그리고 인수공통(동물-인간) 기원을 규명하기 위해서는 추가 연구가 필요하다.
https://doi.org/10.1080/22221751.2025.2466705
Pneumonia
Coronavirus
Virology
Coronavirus disease 2019 (COVID-19)
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
2019-20 coronavirus outbreak
Medicine
Betacoronavirus
Pandemic
Biology
3
Article
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인용수 6
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2024Etiological agent and clinical characteristics of haemorrhagic fever with renal syndrome in the southern Republic of Korea: a genomic surveillance study
Sara Puspareni Prayitno, Augustine Natasha, Seonghyeon Lee, Choon‐Mee Kim, You Mi Lee, Kyungmin Park, Jongwoo Kim, Seong-Gyu Kim, Jieun Park, Shivani Rajoriya, Gustavo Palacios, Yeonsu Oh, Jin‐Won Song, Dong‐Min Kim, Won‐Keun Kim
IF 8.5 (2024)
Clinical Microbiology and Infection
목적: 출혈열-신증후군(hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS)은 대한민국(ROK) 남부에서 높은 발생이 보고되었다. Jeju 도의 애집쥐(Apodemus agrarius chejuensis)에서 Orthohantavirus hantanense(HTNV)의 남부 고유 유전형이 확인되었다. 그러나 이 유전형이 ROK 남부의 HFRS 사례와 연관되는지 여부는 여전히 불명확하다. 본 연구는 남부 HTNV 유전형이 HFRS의 원인 병원체로 작용할 가능성을 평가하고자 하였다.
방법: ROK 남부에서 HFRS 환자 22명과 소형 포유류 193마자(표본)를 수집하였다. 남부 HTNV 유전형에 감염된 환자에서의 임상적 특성을 분석하였다. 환자와 설치류에서 남부 HTNV를 대상으로 앰플리콘 기반 MinION 시퀀싱을 수행하여 이후 계통분석 및 유전 재조합(assortment) 분석이 가능하도록 하였다.
결과: HTNV에 대한 고처리량 시퀀싱은 cycle of threshold 값이 32 미만인 경우 더 높은 커버리지를 보였으며, HFRS 환자 6명과 A. agrarius 시료 7개에서 거의 전장(genome) 서열을 확보하였다. 환자 유래 HTNV의 계통학적 양상은 Jeju 도 및 한국 남부 반도에서의 Apodemus 종 유래 HTNV와 유전적으로 군집함을 보여주었고, 단일 임상 시료에서 M 및 S 분절 간 유전 재조합이 관찰되었다.
고찰: 이러한 결과는 남부 HTNV 유전형이 사람에서 HFRS를 유발할 잠재력이 있음을 시사한다. 계통학적 추론은 남부 HTNV 3분절(tripartite) 유전체의 다양하고 역동적인 특성을 보여준다. 따라서 본 연구는 정형항바이러스(orthohantavirus) 감염을 검출하기 위한 능동적 감시와 앰플리콘 시퀀싱의 중요성을 강조한다. 또한 ROK에서 HFRS의 원인으로서 남부 HTNV 유전형의 출현 가능성에 대해 의료진의 인지와 주의를 환기한다.
https://doi.org/10.1016/j.cmi.2024.02.014
Genotype
Biology
Phylogenetic tree
Apodemus agrarius
Virology
Reassortment
Genetic diversity
Genetics
Medicine
Gene
최신 정부 과제
7
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1
2023년 3월-2026년 2월
|570,056,000원3세대염기서열분석법 기반 한타바이러스 대응 고해상도 능동감시 체계 구축
3세대염기서열분석법 기반 한타바이러스 대응 고해상도 추적감시 시스템(능동감시 체계) 구축 1) 한타바이러스 유전체 염기서열 확보를 위한 3세대염기서열분석법 확립 2) 신·변종 한타바이러스 유전체 정보 기반 고해상도(high-resolution) 추적감시 시스템(능동감시 체계) 구축
한타바이러스
3세대염기서열분석법
능동감시 체계
바이러스 유전체
생물학적 특징
추적감시 시스템
2
주관|
2017년 6월-2022년 6월
|2,000,000,000원통합 생물정보 기반의 설치류 매개 감염병 대응 국가방역체계 연계 원천기술 확보
○ 신·변종 한타바이러스의 유전체 big data에 기반한 정밀추적 시스템 구축
- 신증후출혈열 환자 및 자연 숙주 한타바이러스 전장 유전체 데이터베이스 구축
- 유전체 데이터베이스 기반 지리정보시스템 구축
- 유전체 데이터베이스 기반 계통지리학 분석, 역학 조사 및 능동적 생물시료 채집을 기반으로 한 정밀추적 시스템 구축
- 계통지리학적 전파 특성 및 위해도 분석 결과에 기반하여 유전자 재조합/재편성 한타바이러스의 고해상도 정밀추적 시스템 구축
○ Big data 기반 신?변종 한타바이러스 예측모델 개발
- 한타바이러스 고빈도 감염 위험 지역/시기(계절) 주의 알림 시스템 개발
- 메타지놈 분석을 이용한 신?변종 감염병 바이러스 진단 시스템 개발
○ 신?변종 한타바이러스 예측모델 및 big data 활용을 위한 웹사이트 구축
- 신·변종 한타바이러스 예측모델 관련 big data 유전체 정보, 유전자 재편성/재조합 양상, 생물학적 특성 정보 등 big data 기반 활용 웹사이트 구축
○ 신?변종 한타바이러스 대비 백신/진단항원 뱅크 구축 및 효용성 검증을 위한 비임상 연구
- 구축된 백신/진단항원 뱅크에 대한 환자 항체 역가 비교 및 검체에서의 진단/백신 효능 평가
- 구축된 백신/진단항원 뱅크 기능 검증을 위한 세포주/동물 모델에서의 비임상 연구
한타바이러스
바이러스 유전체
차세대염기서열분석법
백신
진단항원
신증후출혈열
역학 감시
감염 위험 지역
3
주관|
2016년 5월-2016년 9월
|68,200,000원미래대응 국가 미생물 안전관리 기반구축 전략 기획 연구
본 과제는 신종 병원체와 항생제 내성 등 미생물 위험에 대비하기 위해 국가 미생물 안전관리 기반을 강화하는 중·장기계획을 수립하는 연구임.
연구목표는 추진전략과 핵심 신규추진과제 도출 및 미생물 관리체계 개선전략(조직·인력·예산) 세부추진방안 마련에 있음. 핵심연구내용은 국내·외 미생물 안전관리 체계 및 동향 분석, 제외국 이슈 미생물 연구 현황 조사·비교, 미생물 안전관리 우선순위 및 중장기 투자로드맵, 체계(조직·인력·예산)·연구개발 방향(자체·용역·출연)·운영방법(외부기관 활용한 시험검사네트워크 구축) 전략수립, 세부 추진방안 기획과 비용-편익 분석 및 과제별 예산·성과지표 도출, RFP 작성으로 구성됨. 기대효과는 미래대응 국가 미생물 안전관리 전략 기획보고서 및 중장기 발전방안 제공과 세부과제별 조직·예산 확보 및 체계적 연구사업 추진에 활용됨.
식품안전
미생물
미래대응
기획
전략
최신 특허
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바이러스 감시분석 시스템 및 그 방법
상태
공개출원연도
2025출원번호
1020250068875알파코로나바이러스 검출용 프라이머 세트 및 이의 용도
상태
공개출원연도
2024출원번호
1020240074978수청바이러스 검출용 프라이머 세트 및 이의 용도
상태
공개출원연도
2024출원번호
1020240074979