종양 내 이질성(ITH)은 다양한 요인에서 비롯되며 여러 암에서 중요한 역할을 하나, ITH에 대한 연구는 아직 초기 단계에 머물러 있다. 이 현상을 더 탐구하기 위해, 우리는 위암 환자 유래 오가노이드(PDO)에서 조직학적으로 순수한 두 아형의 단일핵 전사체(single-nuclei transcriptome) 프로파일링을 수행하였다. 장형(intestinal-type) 샘플들 사이에서 암 줄기세포 마커 발현의 차이를 확인하였고, 이는 1탄소(1C) 대사와의 상관관계를 보였다. 특히, 일부 위암 샘플은 조직학적으로 장형으로 분류되었음에도 불구하고 확산형(diffuse-like) 유전적 특성을 나타냈다. 이러한 결과는 이러한 유전적으로 확산형에 가까운 위암에 대해 치료 전략으로 1C 대사 억제(1C metabolism inhibition) 방식을 적용할 가능성을 시사한다. 본 연구는 PDO 기반 전임상 모델에서 ITH를 다룰 필요성을 강조하며, 위암 정밀의학 치료의 발전을 위한 의미 있는 통찰을 제공한다.

, p = 0.036), 또한 TC 인근에서 두드러진 IC 클러스터링이 관찰되었다. 두 종양 아형 모두 PD-L1 상태에 따라 IC 조성이 다양하게 나타났다. 결론적으로, 고-TIL TNBC 및 HR + HER2-BC에서 IC의 조성과 공간적 분포는 PD-L1 상태의 영향을 받아 유의미하게 다르다.

초록 목적: 삼중음성 유방암(triple-negative breast cancer, TNBC)과 호르몬 수용체 양성 HER2 음성 유방암(hormone receptor-positive HER2-negative breast cancer, HR+HER2-BC) 사이에서 면역 세포(IC) 구성과 그 공간적 분포의 차이를 규명하고, 이러한 지표에 대한 PD-L1 상태의 영향을 평가하고자 하였다. 방법: 종양 침윤 림프구(Tumor-infiltrating lymphocytes, TIL)가 ≥60%인 환자 32명을 선정하였다(TNBC, n=18; HR+HER2- BC, n=14). 절제된 종양 조직에 대해 다중 면역형광(multiplex immunofluorescence)을 사용하였다. CK, CD20, CD8, CD4, FOXP3와 같은 표지자를 이용하여 종양 기질과 종양 영역에서 면역 세포 유형과 종양 세포(Tumor cells, TC)를 동정하였다. 종양 아형 및 PD-L1 상태에 따라 면역 세포의 세포 밀도와 비율 분포를 분석 및 비교하고, 공간적 상호작용(면역세포-종양세포(IC-TC) 및 면역세포-면역세포(IC-IC))을 평가하였다. 결과: TNBC는 HR+HER2-BC에 비해 CD8+IC의 비율이 더 높았으며(기질: 27% 대 17%, p<0.001; 종양: 54% 대 31%, p<0.001), CD4+FOXP3+IC(기질: 3.9% 대 3.0%, p=0.036) 또한 더 높게 나타났다. PD-L1 양성 증례에서는 TNBC가 CD4+FOXP3+IC의 더 조밀한 기질 집단을 보였다(146.4±67.1/mm2 대 114.3±146.9/mm2, p=0.036). 두 종양 아형 모두 PD-L1 상태에 따라 다양한 면역 세포 구성을 보였다. 밀도 플롯은 TNBC에서 특히 PD-L1 양성 증례에서 종양 세포(TC) 근처로의 면역세포 클러스터링이 뚜렷함을 보여주었다. 세포-세포 상호작용 분석에서는 종양세포(TC)와 다양한 면역세포 조합 간 인접 패턴이 종양 아형 및 PD-L1 상태에 따라 빈도가 달리 나타나는 등 다양함을 확인하였다. 결론: 면역 경관은 면역세포 구성과 공간적 분포로 특징지어지며 TNBC와 HR+HER2- BC 사이에서 차이를 보이고, PD-L1 상태가 이러한 양상을 추가로 조절한다. 인용 양식: Yoon Jin Cha, Inho Park, Su-Jin Shin. Differential immune microenvironments in triple-negative breast cancer and hormone receptor-positive HER2-negative breast cancer: A spatial analysis via multiplex immunofluorescence [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 1 (Regular Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(6_Suppl):Abstract nr 1535.

종양 내 이질성(ITH)은 다양한 요인에서 비롯되며 여러 암에서 중요한 역할을 하나, ITH에 대한 연구는 아직 초기 단계에 머물러 있다. 이 현상을 더 탐구하기 위해, 우리는 위암 환자 유래 오가노이드(PDO)에서 조직학적으로 순수한 두 아형의 단일핵 전사체(single-nuclei transcriptome) 프로파일링을 수행하였다. 장형(intestinal-type) 샘플들 사이에서 암 줄기세포 마커 발현의 차이를 확인하였고, 이는 1탄소(1C) 대사와의 상관관계를 보였다. 특히, 일부 위암 샘플은 조직학적으로 장형으로 분류되었음에도 불구하고 확산형(diffuse-like) 유전적 특성을 나타냈다. 이러한 결과는 이러한 유전적으로 확산형에 가까운 위암에 대해 치료 전략으로 1C 대사 억제(1C metabolism inhibition) 방식을 적용할 가능성을 시사한다. 본 연구는 PDO 기반 전임상 모델에서 ITH를 다룰 필요성을 강조하며, 위암 정밀의학 치료의 발전을 위한 의미 있는 통찰을 제공한다.

, p = 0.036), 또한 TC 인근에서 두드러진 IC 클러스터링이 관찰되었다. 두 종양 아형 모두 PD-L1 상태에 따라 IC 조성이 다양하게 나타났다. 결론적으로, 고-TIL TNBC 및 HR + HER2-BC에서 IC의 조성과 공간적 분포는 PD-L1 상태의 영향을 받아 유의미하게 다르다.

초록 목적: 삼중음성 유방암(triple-negative breast cancer, TNBC)과 호르몬 수용체 양성 HER2 음성 유방암(hormone receptor-positive HER2-negative breast cancer, HR+HER2-BC) 사이에서 면역 세포(IC) 구성과 그 공간적 분포의 차이를 규명하고, 이러한 지표에 대한 PD-L1 상태의 영향을 평가하고자 하였다. 방법: 종양 침윤 림프구(Tumor-infiltrating lymphocytes, TIL)가 ≥60%인 환자 32명을 선정하였다(TNBC, n=18; HR+HER2- BC, n=14). 절제된 종양 조직에 대해 다중 면역형광(multiplex immunofluorescence)을 사용하였다. CK, CD20, CD8, CD4, FOXP3와 같은 표지자를 이용하여 종양 기질과 종양 영역에서 면역 세포 유형과 종양 세포(Tumor cells, TC)를 동정하였다. 종양 아형 및 PD-L1 상태에 따라 면역 세포의 세포 밀도와 비율 분포를 분석 및 비교하고, 공간적 상호작용(면역세포-종양세포(IC-TC) 및 면역세포-면역세포(IC-IC))을 평가하였다. 결과: TNBC는 HR+HER2-BC에 비해 CD8+IC의 비율이 더 높았으며(기질: 27% 대 17%, p<0.001; 종양: 54% 대 31%, p<0.001), CD4+FOXP3+IC(기질: 3.9% 대 3.0%, p=0.036) 또한 더 높게 나타났다. PD-L1 양성 증례에서는 TNBC가 CD4+FOXP3+IC의 더 조밀한 기질 집단을 보였다(146.4±67.1/mm2 대 114.3±146.9/mm2, p=0.036). 두 종양 아형 모두 PD-L1 상태에 따라 다양한 면역 세포 구성을 보였다. 밀도 플롯은 TNBC에서 특히 PD-L1 양성 증례에서 종양 세포(TC) 근처로의 면역세포 클러스터링이 뚜렷함을 보여주었다. 세포-세포 상호작용 분석에서는 종양세포(TC)와 다양한 면역세포 조합 간 인접 패턴이 종양 아형 및 PD-L1 상태에 따라 빈도가 달리 나타나는 등 다양함을 확인하였다. 결론: 면역 경관은 면역세포 구성과 공간적 분포로 특징지어지며 TNBC와 HR+HER2- BC 사이에서 차이를 보이고, PD-L1 상태가 이러한 양상을 추가로 조절한다. 인용 양식: Yoon Jin Cha, Inho Park, Su-Jin Shin. Differential immune microenvironments in triple-negative breast cancer and hormone receptor-positive HER2-negative breast cancer: A spatial analysis via multiplex immunofluorescence [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 1 (Regular Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(6_Suppl):Abstract nr 1535.

배경: 담도암(BTCs)은 치명적이고 드문 악성종양의 이질적인 집합으로서, 기존의 화학요법 치료 옵션이 제한적이다. 수용체 티로신 키나아제(RTK)는 세포 주기 조절을 통해 사람 악성종양의 진행과 밀접하게 연관되어 있다. RTK의 과발현 또는 증폭은 BTC에서 잠재적 바이오마커 및 치료 표적이 될 수 있는지에 대해 조사되어 왔으며, 본 연구에서는 이러한 중재의 가치를 평가하고자 한다. 재료 및 방법: RTK 단백질의 과발현은 193개의 BTC 검체에서 면역조직화학법을 통해 확인하였고, 그중 137개는 담낭암, 29개는 간문부 주위 담관암, 27개는 간내 담관암이었다. 유전자 증폭을 평가하기 위해 MET 및 HER2에 대한 은 in situ hybridization을 시행하였다. 결과: 전체 암 집단에서 담낭, 간문부, 간내의 MET 증폭률은 각각 15.7%, 19.0%, 3.4%, 14.8%였고, HER2 증폭률은 각각 22.4%, 27.2%, 17.2%, 3.7%였다. MET 및 HER2 단백질 발현은 해당 유전자 증폭 상태와 유의하게 상관되었다. RTK는 진행된 pT 범주 및 림프절 전이와 같은 불량한 임상병리학적 특징과 유의하게 연관되었다. 전체 생존기간은 MET 증폭(P = .024) 및 EGFR 과발현(P = .045) 사례에서 유의하게 더 짧았다. 재발-자유 생존기간은 모든 환자군에서 HER2 증폭(P = .038) 및 EGFR 과발현(P = .046)과 유의하게 상관되었다. 전체 및 재발-자유 생존기간은 HER2와 EGFR에 대해 동시 양성을 보인 환자에서 유의하게 더 짧았다. 결론: 본 자료는 MET, HER2 및 EGFR이 잠재적 치료 표적일 수 있으며, 이들의 동시 발현이 BTC의 강력한 예후 인자임을 시사한다.

목적: 대장암(CRC) 환자에서 숙주의 체성분, 영양 상태 및 전신 염증 상태가 예후에 영향을 미칠 수 있다고 제시되어 왔으나, 병기 IV CRC 환자에서 이들 요인의 영향은 아직 불명확하다. 본 연구는 수술을 받은 최초 진단 병기 IV CRC 환자에서 이러한 지표들의 예후 효과를 조사하였다. 방법: 수술을 시행한 병기 IV CRC 환자를 선정하였다. 수술 전 컴퓨터단층촬영(CT) 영상을 이용하여 골격근 지수, 골격근 밀도(SMD), 내장지방 면적(VFA), 피하지방 면적(SFA)을 평가하였다. 영양 상태와 전신 염증에 대해서는 예후 영양 지표(PNI), 호중구/림프구 비율(NLR), 림프구/단핵구 비율(LMR), 혈소판/림프구 비율(PLR)을 사용하였다. Cox 비례위험 모형을 이용하여, 모형 내 다른 공변량에 대한 보정을 한 후 진행 없는 생존기간(PFS)의 예후적 의의를 평가하였다. 결과: 2005년 1월부터 2014년 2월까지 수술을 받은 병기 IV CRC 환자 134명의 자료가 포함되었다. 단변량 분석에서 SMD, VFA, SFA, PNI, NLR, LMR 및 PLR은 PFS와 연관이 있었다. 다변량 분석에서는 SFA(위험비[HR], 0.612; 95% 신뢰구간[CI], 0.389-0.961; P = 0.033)와 PNI(HR, 0.536; 95% CI, 0.345-0.832; P = 0.005)가 PFS의 독립적 예후 인자로 확인되었다. 결론: SFA와 PNI는 모두 병기 IV CRC 환자에서 예후적 의의를 보였다. 이에 따라, 이들 요인을 병기 IV CRC 환자의 수술적 의사결정에 반영하는 것이 도움이 되는지 판단하기 위해 추가 연구가 필요하다고 생각한다.

목적: 환자유래 세포(Patient-derived cells, PDCs)와 환자유래 오르가노이드(Patient-derived organoids, PDOs)는 중개의(translation) 암 연구에서 널리 사용되는 상호보완적인 전임상 모델이다. 그러나 이들의 분자적 및 기능적 차이는 체계적으로 특성화되지 않았다. 본 연구는 동일한 위암 복수에서 유래한 쌍(pair) PDC 및 PDO 모델을 확립하고 분석하여, 플랫폼 의존적 분자 및 기능 프로파일을 구분하고자 하였다. 재료 및 방법: 진행성 위암 환자 6명으로부터 획득한 악성 복수 또는 흉수로 쌍을 이루는 PDC 및 PDO 모델을 확립하였다. 모든 쌍은 유전체(genomic), 전사체(transcriptomic), 단백질체(proteomic) 데이터를 통합하는 포괄적 다중오믹스(multi-omics) 프로파일링을 수행하였다. 표현형 특성화에는 형태학적, 조직학적, 증식(proliferative), 세포주기(cell cycle) 분석이 포함되었다. 약물 감수성 검사는 위암 치료에 흔히 사용되는 4종의 항암 화학요법제를 이용하여 수행하였다. 결과: 6개의 쌍 PDC 및 PDO 모델은 서로 다른 형태학적 특징을 보였다. 전장유전체(whole-genome) 분석에서는 원발 종양, PDC, PDO 간 높은 일치도를 확인하여, 플랫폼 전반에 걸친 종양 대표성을 입증하였다. 다중오믹스 프로파일링은 플랫폼 의존적 분자 시그니처를 규명하였는데, PDO는 세포외기질(extracellular matrix) 재형성과 줄기성(stemness)에 풍부한 반면, PDC는 증식 및 면역 관련 시그니처를 나타내었다. HER2 및 MET 변이와 같은 임상적으로 관련 있는 바이오마커는 원발 종양과의 일치성이 확인되었다. 특히 약물 반응은 플랫폼과 환자 간에 서로 달랐으며, 이는 플랫폼 의존적이고 환자 특이적인 화학요법 감수성을 시사한다. 결론: 동일 환자에서 유래한 쌍 PDC 및 PDO 모델은 핵심적인 환자 특이적 종양 특성을 보존하면서도 서로 다른 분자적 및 기능적 프로파일을 나타내었다. 이러한 결과는 배양 플랫폼이 실험 결과와 치료 반응을 좌우하는 중요한 결정 요인임을 강조한다. 따라서 생물학적 질문을 정확히 다루고 정밀 의료 정 oncology(precision oncology) 전략을 최적화하기 위해서는 적절한 전임상 모델의 신중한 선택이 필수적이다.

보충 그림 4