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질산염 환원 및 오염물질 분해와 연관된 , 가 간췌장에서 두드러지게 나타났다. 전반적으로, 본 연구는 태평양 흰다리새우의 소화관(GI)에서의 미생물 생태에 대한 통찰을 제공하며, 이를 통해 지속가능한 양식업 관행을 지원한다는 목표 하에 새우의 건강에 대한 이해를 제고한다.

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질산염 환원 및 오염물질 분해와 연관된 , 가 간췌장에서 두드러지게 나타났다. 전반적으로, 본 연구는 태평양 흰다리새우의 소화관(GI)에서의 미생물 생태에 대한 통찰을 제공하며, 이를 통해 지속가능한 양식업 관행을 지원한다는 목표 하에 새우의 건강에 대한 이해를 제고한다.

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그람염색 음성, 장대(長短) 간균(long rod)이며 산화효소(oxidase)와 카탈라아제(catalase) 양성인 균주 WSW3-B12 T 는 한국 서해의 조간대(tidal flats)에서 채집한 홍조류(red algae)로부터 분리되었다. 16S rRNA 유전자 서열을 기반으로 한 계통학적 분석 결과, 균주 WSW3-B12 T 는 Bacteroidota 문(phylum)에 속한 Flammeovirgaceae 과(family)에서 Flexithrix dorotheae DSM 6795 T 에 대해 서열 상동성 92.7%로 가장 높았으며, 그 다음으로는 Rapidithrix thailandica TISTR 1750 T 가 90.8%로 나타났다. Nanopore 및 Illumina 플랫폼을 모두 사용하여 결정된 전장(全長) 유전체 서열 분석 결과, 전체 유전체는 29개의 컨티그(contigs)로 구성되어 있었고, 그중 컨티그 1은 원형 염색체(circular chromosome)였으며 나머지 28개 컨티그는 플라스미드(plasmids)였다. 유전체 크기는 10.1 Mbp였고, G+C 함량은 34.1%였다. 평균 뉴클레오타이드 동일성(ANI), 디지털 DNA–DNA 혼성화(dDDH), 평균 아미노산 동일성(AAI), 그리고 보존 단백질의 비율(POCP) 및 균주 WSW3-B12 T 와 가장 가까운 균주인 Flexithrix dorotheae DSM 6795 T 간의 계통유전체학(phylogenomics) 관련 지표는 각각 76.6%, 19.9%, 57.2%, 55.6%로, 모두 새로운 속(genus) 생성의 타당성을 뒷받침하기 위한 역치(threshold) 값보다 낮았다. 포괄적 유전체 분석 결과, 균주 WSW3-B12 T 는 주 염색체(main chromosome)에서 중심 대사(central metabolism)와 관련된 핵심 유전자들을 다수 보유하고 있었으며, 또한 플라스미드에서는 비타민(vitamins), 퀴논(quinone), 항균제 내성(antimicrobial resistance) 생성에 중요한 유전자들을 지니고 있었다. 아울러 균주는 염색체와 플라스미드 모두에서 비소(arsenic), 코발트(cobalt), 구리(copper), 철(iron)과 같은 중금속의 대사에 관여하는 유전자도 보유하고 있었다. 또한 해당 균주의 유전체는 당 활성 효소(carbohydrate-active enzymes; CAZymes)로 매우 풍부하여 총 241개의 CAZymes를 보유하고 있었다. 더불어 플라스미드 20에서 완전한 CRISPR/Cas 시스템이 검출되었다. 균주의 주요 지방산(fatty acids)은 iso-C 15:0과 C 16:1 ω5였다. 극성 지질(polar lipids)은 포스파티딜에탄올아민(phosphatidylethanolamine), 미동정(unidentified) 지질 4종, 그리고 글리코지질(glycolipids) 4종을 포함하였다. 호흡(respiration) 계통의 퀴논은 메나퀴논 7(menaquinone 7)이었다. 표현형(phenotypic), 화학분류학적(chemotaxonomic), 유전체(genomic) 분석을 근거로, 균주 WSW3-B12 T 는 Flammeovirgaceae 과 내에서 새로운 종(species) 및 새로운 속(genus)에 해당하는 것으로 분류될 수 있었으며, 이에 대해 Chondrinema litorale gen. nov., sp. nov.(모식균주(type strain) WSW3-B12 T = KCTC 82707 T = GDMCC 1.3198 T )라는 이름을 제안한다.

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