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채필석 연구실
한양대학교 바이오신약융합학부 채필석 교수
양친매성 분자
막단백질 안정화
계면활성제 설계
연구 영역
기본 정보
논문·특허
과제
구성원

채필석 연구실

한양대학교 바이오신약융합학부 채필석 교수

채필석 연구실은 생유기화학 기반의 분자 설계와 생체 적용을 결합한 연구를 수행합니다. 막단백질 구조 분석을 위한 양친매성 분자와 덕테르전트를 합성하고, 미셀 특성 및 단백질 추출·안정화 결과를 연계하여 X-선 결정법 및 초저온전자현미경 분석이 가능한 조건을 도출합니다. 동시에 Rhodamine 또는 naphthoquinolinedione 등 유기 형광 골격을 기반으로 Cu(I), CN−, Au3+/Ag+/Hg2+와 같은 금속 이온을 선택적으로 인지하는 형광·색도 프로브를 개발하며, 세포 수준 분별과 신호 판독 가능성을 검증합니다.

양친매성 분자막단백질 안정화계면활성제 설계미셀 구조막단백질 구조분석
대표 연구 분야
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막단백질 구조 해석을 위한 양친매성 분자 및 덕테르전트 설계 연구 thumbnail
막단백질 구조 해석을 위한 양친매성 분자 및 덕테르전트 설계 연구
Amphiphile and Detergent Design for Membrane Protein Structural Studies
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.

5개년 연도별 논문 게재 수

33총합

5개년 연도별 피인용 수

503총합
주요 논문
5
논문 전체보기
1
Article
|
인용수 1
·
2025
Pendant-bearing detergents: strategies and membrane protein stabilization
Ye-Won Lee, Hong Sik Yun, Muhammad Ehsan, Bernadette Byrne, Pil Seok Chae
IF 13.6 (2025)
Trends in Chemistry
https://doi.org/10.1016/j.trechm.2025.08.010
Micelle
Rational design
Membrane
Membrane protein
Alkyl
Biological membrane
2
Article
|
·
인용수 14
·
2024
Chromo-Fluorogenic Rhodamine-Based Amphiphilic Probe as a Selective and Sensitive Sensor for Intracellular Cu(I) in Living Cells
Eunhye Jeong, Chang Hyeon Ha, Ashwani Kumar, Won Hur, Gi Hun Seong, Pil Seok Chae
IF 9.1 (2024)
ACS Sensors
H NMR, 동적 광산란, 및 투과 전자현미경 연구를 수행하였다. 또한, 이 프로브는 암세포의 Cu(I) 수준을 정상세포의 그것과 성공적으로 구별하였다. 따라서, 이 프로브는 생물학적 시료에서 Cu(I) 수준을 실시간으로 모니터링하고 암세포를 생체영상화하는 데 잠재력을 지닌다.
https://doi.org/10.1021/acssensors.3c02496
Naked eye
Chemistry
Fluorescence
Detection limit
Metal ions in aqueous solution
Rhodamine
Photochemistry
Fluorophore
Selectivity
Aptamer
3
Article
|
인용수 7
·
2023
Melamine-cored glucosides for membrane protein solubilization and stabilization: importance of water-mediated intermolecular hydrogen bonding in detergent performance
Lubna Ghani, Seonghoon Kim, Muhammad Ehsan, Baoliang Lan, Ida H. Poulsen, Chandra Dev, Satoshi Katsube, Bernadette Byrne, Lan Guan, Claus J. Løland, Xiangyu Liu, Wonpil Im, Pil Seok Chae
IF 7.6 (2023)
Chemical Science
수소결합 네트워크는 막 단백질 구조 연구에 유용한 고효율 막-모사(membrane-mimetic) 시스템의 차세대 모델을 대표할 수 있다.
https://doi.org/10.1039/d3sc03543c
Hydrogen bond
Amphiphile
Membrane
Chemistry
Micelle
Membrane protein
Intermolecular force
Molecule
Biophysics
Combinatorial chemistry
최신 정부 과제
13
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1
주관|
2021년 2월-2026년 2월
|183,654,000
X-선 결정법 또는 초저온전자현미경법 기반 막단백질 구조 연구에 우수한 양친매성 분자의 개발
◆ 단백질의 구조 연구에 가장 널리 사용되고 있는 X-선 결정법과 초저온전자현미경법 (Cryo-EM) 각각에 탁월한 양친매성 분자를 그 설계 원리에 의해 설계 및 개발하여 이들을 구조적으로 다양한 다수의 막단백질에 대해 평가함. 이를 통해 막단백질 구조분석에 최적의 분자를 발굴하고 이를 활용하여 약물 개발의 핵심 생체고분자인 막단백질의 구조분석을 가속화함. X-선 결정법과 저온전자현미경법(Cryo-EM)은 각각 독특한 방식으로 단백질의 구조를 분석하므로 이들 구조분석 방법에 따른 차별화된 양친매성 분자의 특성을 요구함을 주목할 필요 있음. ◆ 본 분야에서의 수년간의 연구경험을 통해 도출한 양친매성 분자 설계원리를 바탕으로 X-선 결정법 기반 막단백질 구조분석을 위해 기존 분자들과 차별되는 구조와 특성을 지닌 양친매성 분자들을 설계 및 개발함. 대표적인 예로써 분자의 형태 (conformation)를 활용해 양친매성 분자를 개발할 수 있는데 tartaric acid의 입체화학과 분자내 수소결합을 이용하여 친수성기와 소수성기가 반대방향으로 향하고 소수성 pendant가 분자축의 양쪽 또는 한쪽으로 놓인 양친매성 분자를 개발할 수 있다. ◆ 또한 분자 간 수소결합/π-π 결합을 지닌 양친매성 분자를 설계 개발할 수 있는데 수소결합/π-π 결합성을 지닌 작용기를 소수성기 내에 도입하여 이를 실현할 수 있고 또는 이와 같은 작용기를 소수성기와 친수성기 경계면에 분자축의 양쪽으로 도입하여 개발할 수 있음. 이를 통해 X-선 기반 막단백질 구조연구에 유용한 화학적 툴을 개발함. ◆ 또한 최근 각광을 받고 있는 초저온전자현미경 (CryoEM)법을 통한 막단백질 구조분석에 적합한 차별화된 양친매성 분자를 개발하고자 함. 이를 위해 크기가 작은 친수성기 (glucose/glycerol)를 병렬로 연결한 분자와 분자 간 이온결합을 이용한 양친매성 분자를 개발하여 막단백질 안정화를 확보하면서도 작은 [막단백질-양친매성 분자 복합체] (PDC)를 형성할 수 있는 차별화된 특성과 구조를 지닌 양친매성 분자를 개발함. ◆ 또한 분자의 친수성기 양쪽으로 click 반응을 할 수 있는 작용기를 도입한 양친매성 분자를 사용하여 막단백질 추출한 후 click반응을 진행하면 분자들간의 공유결합이 결형되어 표적 막단백질의 모양과 크기에 딱 들어맞는 맞춤형 나노구조체를 형성할 수 있음. ◆ 개발된 다수의 양친매성 분자들은 엄정한 평가과정을 거쳐 막단백질 구조연구에 최적의 분자를 발굴하고 이를 활용하여 본 연구자와 네트워크 관계에 있는 막단백질 전문가들과의 공동연구를 통해 핵공단백질 (NPC), rhodopsin-transducin complex, β2AR: β-arrestin 1 complex, GPCR-GRK complex등과 같은 도전적인 막단백질 및 그 복합체의 구조 뿐 아니라 수용액에서의 그 형태변화를 원자수준에서 파악하고자 함. 이를 통해 생체신호전달 메커니즘을 포괄적이고 정확하게 규명하여 부작용 없이 다양한 질병을 치료할 수 있는 신약개발에 밑바탕을 제공함.
막단백질 구조
역동적 단백질 형태 변화
양친매성 분자
X-선 결정법
초저온전자현미경법
설계원리
분자형태
분자
2
주관|
2021년 2월-2026년 2월
|210,643,000
X-선 결정법 또는 초저온전자현미경법 기반 막단백질 구조 연구에 우수한 양친매성 분자의 개발
◆ 단백질의 구조 연구에 가장 널리 사용되고 있는 X-선 결정법과 초저온전자현미경법 (Cryo-EM) 각각에 탁월한 양친매성 분자를 그 설계 원리에 의해 설계 및 개발하여 이들을 구조적으로 다양한 다수의 막단백질에 대해 평가함. 이를 통해 막단백질 구조분석에 최적의 분자를 발굴하고 이를 활용하여 약물 개발의 핵심 생체고분자인 막단백질의 구조분석을 가속화함. X-선 결정법과 저온전자현미경법(Cryo-EM)은 각각 독특한 방식으로 단백질의 구조를 분석하므로 이들 구조분석 방법에 따른 차별화된 양친매성 분자의 특성을 요구함을 주목할 필요 있음. ◆ 본 분야에서의 수년간의 연구경험을 통해 도출한 양친매성 분자 설계원리를 바탕으로 X-선 결정법 기반 막단백질 구조분석을 위해 기존 분자들과 차별되는 구조와 특성을 지닌 양친매성 분자들을 설계 및 개발함. 대표적인 예로써 분자의 형태 (conformation)를 활용해 양친매성 분자를 개발할 수 있는데 tartaric acid의 입체화학과 분자내 수소결합을 이용하여 친수성기와 소수성기가 반대방향으로 향하고 소수성 pendant가 분자축의 양쪽 또는 한쪽으로 놓인 양친매성 분자를 개발할 수 있다. ◆ 또한 분자 간 수소결합/π-π 결합을 지닌 양친매성 분자를 설계 개발할 수 있는데 수소결합/π-π 결합성을 지닌 작용기를 소수성기 내에 도입하여 이를 실현할 수 있고 또는 이와 같은 작용기를 소수성기와 친수성기 경계면에 분자축의 양쪽으로 도입하여 개발할 수 있음. 이를 통해 X-선 기반 막단백질 구조연구에 유용한 화학적 툴을 개발함. ◆ 또한 최근 각광을 받고 있는 초저온전자현미경 (CryoEM)법을 통한 막단백질 구조분석에 적합한 차별화된 양친매성 분자를 개발하고자 함. 이를 위해 크기가 작은 친수성기 (glucose/glycerol)를 병렬로 연결한 분자와 분자 간 이온결합을 이용한 양친매성 분자를 개발하여 막단백질 안정화를 확보하면서도 작은 [막단백질-양친매성 분자 복합체] (PDC)를 형성할 수 있는 차별화된 특성과 구조를 지닌 양친매성 분자를 개발함. ◆ 또한 분자의 친수성기 양쪽으로 click 반응을 할 수 있는 작용기를 도입한 양친매성 분자를 사용하여 막단백질 추출한 후 click반응을 진행하면 분자들간의 공유결합이 결형되어 표적 막단백질의 모양과 크기에 딱 들어맞는 맞춤형 나노구조체를 형성할 수 있음. ◆ 개발된 다수의 양친매성 분자들은 엄정한 평가과정을 거쳐 막단백질 구조연구에 최적의 분자를 발굴하고 이를 활용하여 본 연구자와 네트워크 관계에 있는 막단백질 전문가들과의 공동연구를 통해 핵공단백질 (NPC), rhodopsin-transducin complex, β2AR: β-arrestin 1 complex, GPCR-GRK complex등과 같은 도전적인 막단백질 및 그 복합체의 구조 뿐 아니라 수용액에서의 그 형태변화를 원자수준에서 파악하고자 함. 이를 통해 생체신호전달 메커니즘을 포괄적이고 정확하게 규명하여 부작용 없이 다양한 질병을 치료할 수 있는 신약개발에 밑바탕을 제공함.
막단백질 구조
역동적 단백질 형태 변화
양친매성 분자
X-선 결정법
초저온전자현미경법
설계원리
분자형태
분자
3
2021년 2월-2026년 2월
|146,628,000
X-선 결정법 또는 초저온전자현미경법 기반 막단백질 구조 연구에 우수한 양친매성 분자의 개발
본 분야에서의 다년간의 연구경험을 통해 도출한 분자 설계원리를 바탕으로 X-선 결정법 기반 막단백질 구조분석을 위해 기존분자들과 차별된 특성을 지닌 독창적인 양친매성 분자들을 개발하고자 함. 또한 최근 각광을 받고 있는 초저온전자현미경(CryoEM)법을 통한 막단백질 구조분석에 우수한 양친매성 분자를 개발하기 위해 크기가 작은 친수성기 (glucose/gl...
막단백질 구조
역동적 단백질 형태 변화
양친매성 분자
X-선 결정법
초저온전자현미경법
최신 특허
특허 전체보기
상태출원연도과제명출원번호상세정보
등록2021새로운 트리스(하이드록시메틸)메테인 중심 구조를 갖는 양친매성 화합물 및 이의 활용1020210179875
등록2021새로운 트라이아진 다이머 기반 양친매성 화합물 및 이의 활용1020210099866
전체 특허

새로운 트리스(하이드록시메틸)메테인 중심 구조를 갖는 양친매성 화합물 및 이의 활용

상태
등록
출원연도
2021
출원번호
1020210179875

새로운 트라이아진 다이머 기반 양친매성 화합물 및 이의 활용

상태
등록
출원연도
2021
출원번호
1020210099866