여기에서는 이러한 품종들 중 하나인 Yein-early를 기술한다. Yein-early는 야생형(WT)에 비해 더 붉은 과피, 더 높은 경도, 그리고 더 높은 당 함량을 보인다. 또한 Yein-early 잎은 WT와 비교하여 독특한 표현형을 나타냈는데, 이는 더 긴 종축 길이, 더 짧은 횡축 길이, 더 강한 말림(curling), 그리고 더 긴 엽병 길이로 특징지어진다. Yein-early와 WT에 대한 전장 유전체 재시퀀싱(genome resequencing) 결과, 유의미한 단일염기다형성(single-nucleotide polymorphisms, SNPs)과 삽입/결실(insertions/deletions, InDels)이 확인되었다. 이러한 변이는 Yein-early에 특이적인 분자 마커를 규명하는 데 결정적이었다. 더 나아가, Yein-early에서의 동형접합 SNP(homozygous SNP)를 특이적으로 표적하는 대립유전자 특이적 PCR(allele-specific PCR) 마커를 개발하여, Yein-early를 WT 및 다른 감귤류(citrus) 품종과 구별할 수 있게 하였다. 본 연구는 과실의 색소 합성에 대한 이해에 기여하며, 감귤 육종 프로그램에서 새로운 Yein-early 품종을 선발하는 데 유용한 도구를 제공한다.

품종들 중에서, 이러한 돌연변이들 가운데 Gwonje-early는 타원형의 형태, 과실 상부의 돌출, 그리고 야생형(WT) 과실에 비해 큰 과실 크기를 보였다. 우리는 Gwonje-early의 외부/내부 형태학적 특성과 과실의 당/산 함량을 조사하였다. 또한, 전장(whole-genome) 재시퀀싱을 이용하여 Gwonje-early에서 전 게놈 단일염기다형성(single-nucleotide polymorphism, SNP)과 삽입/결실(insertion/deletion, InDel) 변이를 조사하였다. Gene Ontology 분석을 통한 기능 주석은 InDel이 SNP보다 더 흔하게 주석 처리됨을 확인하였다. Gwonje-early에 대한 특정 분자 표지자를 확인하기 위해, Gwonje-early 게놈 재시퀀싱에서 탐지된 동형접합(homozygous) SNP를 사용하여 대립유전자 특이적 PCR을 수행하였다. GJ-SNP1 및 GJ-SNP4 프라이머 세트는 Gwonje-early를 WT 및 기타 상업적 감귤 품종들과 효과적으로 구별할 수 있었으며, 이는 Gwonje-early의 특이적 분자 표지자로서의 활용 가능성을 보여주었다. 이러한 결과는 또한 지적재산권 및 Gwonje-early의 품종 보호 측면에서 중요한 함의를 갖는다. 본 연구 결과는 감귤 종의 형태학적 형질과 분자 육종 메커니즘을 이해하는 데 통찰을 제공할 수 있을 것으로 기대된다.