55,589개 좌위를 조사하기 위하여, DNA 칩을 이용한 마이크로어레이 분석을 수행하였다. 그 결과 처리하지 않은 대조군과 비교하여 초기(제1) 가뭄 스트레스 조건에서 전사 수준이 각각 4배 이상 증가 또는 감소한 유전자 2,162개와 2,385개를 확인하였다. 가뭄 반응 유전자의 전사 수준은 회복(물 공급) 상태 동안 기저 수준으로 되돌아갔으며, 이후(제2) 가뭄 스트레스 조건에서는 제1 가뭄 스트레스 조건에서 관찰된 결과와 비교하여 각각 4배 이상 증가 또는 감소한 전사체 392개와 613개가 나타났다. 유전자 온톨로지 및 MapMan 분석을 통해 전사체가 증가된 양상의 가뭄 유도 기억 유전자들을, 전사인자, 단백질 포스파타아제 2C, 그리고 지연 배 발생 풍부 단백질을 암호화하는 비생물적 스트레스에 대한 내성 반응과 관련된 범주를 포함하여 여러 기능 범주로 분류하였다. 전사체가 감소된 양상의 가뭄 억제 기억 유전자들은 광합성 및 1차 대사와 같은 범주로 분류되었다. 공발현 네트워크 분석 결과, 대두의 가뭄 유도 및 -억제 기억 유전자들은 각각 172개 및 311개의 애기장대 유전자와 상응하는 것으로 나타났다. 대두의 가뭄 스트레스 기억 유전자에는 애기장대의 탈수 기억 반응과 관련된 유전자들이 포함되어 있다.

벼(Rice)는 전 세계적으로 가장 중요한 작물 중 하나이며 외떡잎식물(monocots)의 유전체 연구를 위한 모델 식물이다. 완전한 유전체 서열의 공개 이후, 다음 과제는 유전자 기능 분석을 기반으로 한 다양한 자원을 개발하는 것이다. 본 연구에서는 조직배양 중 활성화되는 이동성(endogenous) 레트로트랜스포존인 Tos17의 삽입을 통해 변이체를 생성하였다. 국내 시장에서 각각 백미와 현미를 대표하는 벼 두 품종 Oryza sativa L. japonica ‘Ilmibyeo’(IM)와 ‘Baegjinju1ho’(BJJ1)를 본 연구에 선택하였다. 우리는 flanking adaptor-ligation polymerase chain reaction 방법을 이용하여 새롭게 전이된 Tos17 삽입의 7608개 flanking 서열을 분석하였고, 그 결과 IM과 BJJ1에서 각각 1672개와 843개의 변이체(M2 세대)를 확인하였다. 이러한 Tos17 삽입에 대한 분석 결과, Tos17은 벼 염색체의 유전자(genic) 영역에 우선적으로 삽입되는 것으로 나타났으며(약 70%), 이는 ‘Nipponbare’(NP) 변이체에서 National Institute of Agrobiological Sciences 데이터베이스에 등재된 3280개의 영향을 받은 유전자와 중복되지 않는, 2515개의 IM 및 BJJ1 변이체를 대표하는 1533개 유전자 중 830개 유전자에서 새로운 삽입성 변이체를 발견하였다. Tos17 삽입 변이체의 1000개 라인 중 생장기(vegetative stage)에서 반왜성 및 다양한 잎형(leaf-type) 변이체가 관찰되었으며, 그중에는 좁은 잎, 연녹색 잎, 줄무늬 잎을 보이는 변이체가 포함되었다. 생식기(reproductive stage)에는 10개 라인에서 야생형(wild type)과 비교하여 100립중(100-grain weight)이 17–56% 증가함을 확인하였다. 본 연구는 씨앗 무게를 포함한 농업형질의 개선을 위해, 다양한 벼 품종에서 효율적인 조직배양 방법을 통해 Tos17 변이체의 잠재적 활용 가능성을 보여준다.