본 과제는 심근병증 환자에서 새로운 발병 유전변이를 찾아, exon island 기반 유전자 교정으로 맞춤형 유전자 치료 가능성을 확인하는 연구임.
연구 목표는 심근병증 환자 코호트(150명)와 이식심장조직(14례) 확보 후 NGS 및 long-read sequencing (LRS)로 병인 유전변이를 도출하고, 환자유도만능줄기세포 (Patient-specific iPSC-CM)에서 유전자 조작·평가(4례) 및 임상데이터 연계분석으로 변이 평가(1건)를 수행하는 데 있음. 기대효과는 근치적 맞춤 정밀의료 기반 구축, LRS 기반 코호트 대중화 선도, 조기 진단·예방 및 특허 창출로 사회경제적 비용 절감에 기여하는 효과임.
정량적 단백체학 플랫폼을 이용한 심근병증 유발 유전자 (TTN, MYBPC3, MYH7) 관련 심근 손상 기전 규명
*1차년도: 진행성 심부전 환자의 심근 조직 획득 및 유전자와 단백체 분석
인공 또는 생체 심장이식 시 적출된 심장조직의 샘플 획득
이식 환자의 혈액 또는 조직을 통한 유전자 변이 분석
심장조직의 부위별 총체적 단백체 분석 및 단백체 변화의 차이 검증
*2차년도: 원인 질환, 심근 손상 정도 및 유전자 변이에 따른 심근 조직 단백체 분석
원인 질환에 따른 심근 조직의 단백체 분석 및 차이 검증
심근 조직의 손상 정도에 따른 단백체 분석 및 차이 검증
유전자 변이에 따른 심근 조직의 단백체 발현 차이 분석
*3차년도: 심근 손상 원인 단백체와 관련된 유전자 변이 확인 및 임상적 연관성 규명
광범위한 심근 손상과 관련된 단백체 변화와 유전자 변이의 관계를 총체적 규명
유전자 변이와 단백체 변화에 따른 임상 양상의 차이 확인
광범위한 심근 손상 및 급사 등의 고위험 임상 양상과 연관된 유전자 변이 규명
· 1차년도
1) 확장성 심근병증 환자 등록 후 기초임상정보, 신체계측치, 혈액검사, 영상검사 결과, 및 심장조직검사 결과 수집
2) 한국인칩 검사를 위한 샘플 보관
· 2차년도
1) 새로운 환자 추가 등록 및 기존에 등록한 환자의 임상 예후 추적
2) 한국인칩을 이용하여 1차 분석 시행
3) 임상 예후와 유전자 변이와의 상관관계 분석
· 3차년도
1) 최종 환자 등록 (150명 목표) 및 기존에 등록한 환자의 임상 예후 추적
2) 기존에 알려진 유전자 변이와 확장성 심근증의 상관관계 분석
연구목표
○ 최종목표:
심근병증의 새로운 발병 유전변이를 규명하고 exon island를 이용한 새로운 유전자 치료방법의 적용 가능성을 확인
○ 세부목표:
상기 최종목표를 달성하기 위하여 아래와 같이 세부달성목표를 설정하겠음.
(1) 분석 기반이 될 심근병증 환자 코호트 구성 (150명) 및 이식심장조직 확보 (14례)
(2) NGS 및 long-read sequencing (LRS) 기반 심근병증 환자의 새로운 병인 유전변이 도출 (14례)
(3) 유전자 교정 치료를 위한 환자 맞춤형 전략 수립 및 설계 (10례)
(4) 환자유도만능줄기세포유래 심근세포 (Patient-specific iPSC-CM) 제작 및 치료효과 확인을 위한 유전자 조작 iPSC-CM 의 제작 및 평가 (4례)
(5) 임상데이터 연계분석을 통한 유전적 변이에 대한 평가 (데이터베이스 1건)
연구내용
○ (주관연구개발과제): 유전자 교정 치료 표적 변이 후보 탐색 및 유전자 교정 치료 효과 분석
• 연구개발 내용 1: 환자유래 iPSC의 심근세포 분화 및 표현형 확인
• 연구개발 내용 2: Long-read sequencing (LRS) 기반 심장이식환자에서 전사체 분석
• 연구개발 내용 3: In vitro splicing 판정 및 유전자 교정 후보 변이 선정
• 연구개발 내용 4: Exon island 기반 유전자 맞춤형 치료 전략수립
• 연구개발 내용 5: 유전자 교정 환자유래 iPSC의 확보를 위한 기반기술 구축 및 교정 완료된 iPSC 확보
• 연구개발 내용 6: 유전자 교정 전, 후 iPSC 유래 심근세포에서 유전자 교정 후 표현형 확인
○ (공동연구개발과제): 심근병증 혈액/조직 확보를 위한 코호트 구축
• 연구개발 내용 1: 심근병증 코호트 구성 및 환자 조직 및 임상데이터베이스 구성
• 연구개발 내용 2: NGS 기반 유전자 분석 진행
• 연구개발 내용 3: 유전변이 데이터와 임상데이터 연계분석
기대효과
○ 과학ㆍ기술적 기대효과
‑ 대증적 치료에 그치는 현재 심근병증 치료에서 벗어나 유전자 수준에서 근치적 치료를 도입하는 맞춤형 정밀의료 기반 구축
‑ 국내에서 대중화 되지 않은 LRS (Long-read sequencing) 기반의 심근병증 코호트를 구성하여 LRS 관련 기술의 대중화 선도
‑ 환자유래 유도만능줄기세포의 정밀의료적 활용 가능성 확대 및 타 질병에서의 적용 가능성 타진
○ 산업적, 사회적 기대효과
‑ 심근병증 조기 진단 및 예방을 통한 사회 경제적 비용 절감
‑ 심근병증 유전자 변이를 갖고 있는 가족 전체의 질병 예방 효과
‑ 새로운 기전의 유전자 치료기법과 관련 특허 획득을 통한 경제적 부가가치 창출
○ 효과적인 기초
- 임상연계 질환극복모델 제시
- 의과학 연구의 근본적인 목표라 할 수 있는 인류의 질환 극복을 위한 융합연구 제시
- 의과학 분야에서 효과적인 기초
- 임상연계 질환극복모델을 제시
정량적 단백체학 플랫폼을 이용한 심근병증 유발 유전자 (TTN, MYBPC3, MYH7) 관련 심근 손상 기전 규명
한국연구재단
연구목표:
심장이식을 시행하는 진행성 심부전 환자의 심근 조직에서 단백체 분석을 시행하고 TTN, MYBPC3, MYH7 등의 심근병증 원인 유전자 분석을 통하여‘심근병증 유전자 변이 – 단백체 변화 – 임상적 발현’의 기전을 규명하고, 좌심실의 기능 저하와 동반한 좌심방, 우심방, 그리고 우심실의 단백체 변화에 대한 총체적 분석을 통해 진행성 심부전으로 이행되는 데 결정적 역할을 하는 단백체 변화 및 그와 연관된 유전자 변이를 밝히며 이를 기반으로 유전자 치료에 대한 새로운 아이디어를 개발함
연구내용:
*1차년도: 진행성 심부전 환자의 심근 조직 획득 및 유전자와 단백체 분석
인공 또는 생체 심장이식 시 적출된 심장조직의 샘플 획득
이식 환자의 혈액 또는 조직을 통한 유전자 변이 분석
심장조직의 부위별 총체적 단백체 분석 및 단백체 변화의 차이 검증
*2차년도: 원인 질환, 심근 손상 정도 및 유전자 변이에 따른 심근 조직 단백체 분석
원인 질환에 따른 심근 조직의 단백체 분석 및 차이 검증
심근 조직의 손상 정도에 따른 단백체 분석 및 차이 검증
유전자 변이에 따른 심근 조직의 단백체 발현 차이 분석
*3차년도: 심근 손상 원인 단백체와 관련된 유전자 변이 확인 및 임상적 연관성 규명
광범위한 심근 손상과 관련된 단백체 변화와 유전자 변이의 관계를 총체적 규명
유전자 변이와 단백체 변화에 따른 임상 양상의 차이 확인
광범위한 심근 손상 및 급사 등의 고위험 임상 양상과 연관된 유전자 변이 규명
기대효과
○ 진행성 심부전의 원인인 허혈성 심근병증, 확장성 심근병증, 그리고 비후성 심근병증의 병태생리를 이해함에 있어, 심장의 해부학적 구조에 따른 단백체의 차이를 밝히게 되고, 심근 손상의 변화 과정에 따른 단백체 발현의 차이 및 추가적인 유전자 변이에 대한 연관성 분석을 통하여 임상 양상 및 예후와의 상관관계를 규명하고 차후 유전자 치료의 초석을 다질 수 있음
○ 진행성 심부전으로 이행되는 유전자변이-단백체변화-임상양상의 축을 밝혀낼 수 있으며 이는 특정 단백체 또는 유전자를 표적으로 하는 새로운 예측 모델 및 치료 기술 개발에 응용될 수 있고, 향후 혁신적인 경제, 산업적 부가가치를 창출 할 수 있을 것으로 기대함
연구목표:
- 최종 목표
불인성 협심증 환자에서 이동형 증진된 체외 역박동 장비 (MECP)의 안전성과 유효성을 증명하는 것을 목표로 함
- 세부 목표
불인성 협심증 환자에서 MECP의 안전성 (하지 통증 등)을 증명하는 것을 목표로 함.
불인성 협심증 환자에서 MECP의 유효성 (협심증 강도 감소 등)을 증명하는 것을 목표로 함.
- 성과활용목표
불인성 협심증 환자에서 MECP 장비의 안전성과 유효성을 증명하여, MECP의 임상 근거를 창출하고, 기존 해외 장비를 대체하고, 추후 국산의료기기인 MECP의 해외 시장 진출의 근거 확보를 목표로 함.
연구내용:
○ 1차 연도
① 개발 목표
- 주관기관(연세대학교 의과대학): 임상연구 준비 및 환자 등록 시작
- 참여기관 1(계명대학교 의과대학): 임상연구 준비 및 환자 등록 시작
② 개발 내용 및 범위
- 주관기관(연세대학교 의과대학)
◦ 임상연구 계획 수립 및 IRB 연구 계획서 제출
◦ IRB 연구 계획 승인 후, 연구에 참여한 환자들의 안전성을 보장하기 위해 보험에 가입할 예정임
◦ 등록된 IRB 계획서를 기반으로 CRIS 등록과 clinicaltrials.gov 등록을 시행
◦ CRIS 등록 등을 완료한 후 임상연구 환자 등록을 시작할 예정임.
◦ 임상연구 환자 등록 10% 완료
- 참여기관 1(계명대학교 의과대학):
◦ 주관기관에서 IRB 승인을 획득한 IRB 최종 계획서를 이용하여 IRB 연구 계획서 제출
◦ IRB 승인을 획득 후 보험 가입을 진행 후, 환자 등록을 시작할 예정임.
○ 2차 연도
① 개발 목표
- 주관기관(연세대학교 의과대학): 임상연구 환자 등록 50% 완료
- 참여기관 1(계명대학교 의과대학): 임상연구 환자 등록 50% 완료
○ 3차 연도
① 개발 목표
- 주관기관(연세대학교 의과대학): 임상연구 등록 완료 및 연구 결과 분석
- 참여기관 1(계명대학교 의과대학): 임상연구 등록 완료
연구목표:
임피던스 기반의 심부전 증상 측정에 대한 센서 요소기술연구 및 임상적용에 대한 모니터링 시스템 개발
-임피던스에 의한 심부전 측정을 위한 전임상 시나리오 및 센서 요소기술연구
- 이식형 생화학적/물리적 정보 센싱 핵심블록 개발
- 인체이식형 임피던스 진단 시스템 및 분석 연구
연구내용:
•전임상 시험기준 및 예상 시나리오
•이식 위치선정 및 형태 연구
•임피던스 연속 모니터링 연구
- 임상시험을 위한 IRB 기준 마련 및 신청
- 재료 및 재질별 독성실험
- 인체 임상 시나리오 및 최적의 시술법 개발
- 인체 이식형 시스템 플랫폼 프로토타입 개발
- 이식형 피하 임피던스 연속 모니터링 시스템 개발
- 질환타켓 센서시스템 전임상시험
기대효과:
- 전임상시험 결과를 바탕으로 임상 시험으로의 진입
• 본 과제를 통해 확인 되는 심부전 예측시스템에 대한 결과를 바탕으로 사람을 대상으로 하는 임상 시험 실시 예정
- 연구논문 발표 및 홍보
• 본 연구는 심부전 환자의 건강관리 능력을 한 단계 높여주는 시스템으로 만성심부전 환자의 위급상황에 대한 대처 및 생존율을 크게 높여줄 것으로 판단됨
• 본 연구 자료의 홍보는 새로운 다수의 만성 심부전 환자들에게 큰 도움을 줄 것으로 예상되며, 의료기기 관련 기업들에게 새로운 시장을 창출할 것임
- 원격진로 시대에 대한 대비
• ICT 기기와의 연동을 통해 만성심부전 환자에 대한 원격 데이터 전송을 지원하게 되면 병의원으로의 접근성이 어려운 환자들에 대한 다양한 서비스를 제공할 수 있을 것임
• 향후 다가오게 될 미래사회의 의료기술에 대한 효율적인 시스템을 제공할 것임
연구목표:
한국인 확장성 심근증 환자에서 임상 예후를 결정하는 유전자 변이를 확인하고자 함.
· 1차년도 : 확장성 심근병증 레지스트리 구축, 유전자 샘플 수집
· 2차년도 : 한국인칩을 이용하여 1차 분석 및 임상 예후와의 상관성 분석
· 3차년도 : 최종 환자 등록, 유전자 검사 결과 분석하여 표현형과 임상 예후를 결정짓는 유전자 변이 발견
연구내용:
· 1차년도
1) 확장성 심근병증 환자 등록 후 기초임상정보, 신체계측치, 혈액검사, 영상검사 결과, 및 심장조직검사 결과 수집
2) 한국인칩 검사를 위한 샘플 보관
· 2차년도
1) 새로운 환자 추가 등록 및 기존에 등록한 환자의 임상 예후 추적
2) 한국인칩을 이용하여 1차 분석 시행
3) 임상 예후와 유전자 변이와의 상관관계 분석
· 3차년도
1) 최종 환자 등록 (150명 목표) 및 기존에 등록한 환자의 임상 예후 추적
2) 기존에 알려진 유전자 변이와 확장성 심근증의 상관관계 분석
기대효과:
· 의학 생명과학 분야
- 확장성 심근증과 관련된 유전변이를 확인하여 조기 진단에 활용
- 불량한 예후와 관련된 유전변이를 밝혀, 적극적인 치료 방향 설정에 도움
· 기술적 측면
- 이 연구의 후속으로 한국인칩을 확장성 심근병증 뿐만 아니라 다양한 질환에 확대 적용할 수 있을 것으로 기대됨.
· 국가 사회적 측면
- 정밀의료에 발맞추어 환자마다 유전자 특성에 따른 치료가 가능해짐.
- 저렴한 비용으로 확장성 심근증의 고위험 유전자 확인이 가능함.