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김근필 연구실
중앙대학교 생명과학과 김근필 교수
Cohesin
REC8
Meiotic recombination
연구 영역
기본 정보
논문·특허
과제
구성원

김근필 연구실

중앙대학교 생명과학과 김근필 교수

김근필 연구실은 배아줄기세포에서 cohesin 및 condensin 복합체가 염색체 토폴로지, sister chromatid cohesion, 유전체 안정성과 분화 운명에 미치는 영향을 연구합니다. REC8·STAG3·RAD21 같은 cohesin 소단위의 로딩과 결합 파트너를 ChIP-seq 및 고해상도 이미징으로 분석하고, siRNA 기반 기능 저하 및 분화 관련 전사 변화를 통해 기전을 정리합니다. 또한 meiotic DSB 수선에서 Rad52-RPA 상호작용과 Pol δ 기반 recombination-coupled DNA synthesis를 물리적 재조합 분석으로 규명합니다. 더불어 HR 경로 조절을 통해 CRISPR/Cas9 편집 효율을 향상시키고, DNA 손상 치료 맥락에서 RAD51 동원 변화가 약물 감수성에 미치는 영향을 평가합니다.

CohesinREC8Meiotic recombinationRad52RPA
대표 연구 분야
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배아줄기세포에서의 meiosis-specific cohesin에 의한 염색체 토폴로지와 운명 결정 연구 thumbnail
배아줄기세포에서의 meiosis-specific cohesin에 의한 염색체 토폴로지와 운명 결정 연구
Chromosome topology and fate determination driven by meiosis-specific cohesin in embryonic stem cell
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.

5개년 연도별 논문 게재 수

24총합

5개년 연도별 피인용 수

250총합
주요 논문
5
논문 전체보기
1
Article
|
인용수 2
·
2025
Precision gene editing: The power of CRISPR-Cas in modern genetics
Jeong H. Joo, S. Lee, Keun Pil Kim
IF 6.1 (2025)
Molecular Therapy — Nucleic Acids
유전자 편집은 다양한 종류의 생물체에서 게놈 DNA에 대해 정밀한 수정을 가능하게 하여 분자생물학을 획기적으로 변화시켰다. 유전자 편집 기술은 특정 DNA 서열을 추가, 제거, 또는 변형할 수 있게 하며, 유전자 녹아웃, 치료 목적의 유전자 교정, 표적 유전 형질의 설계 등 다양한 응용 분야를 포함한다. 이러한 기술은 주로 두 가지 DNA 복구 기전에 의존한다. 즉, 정밀한 게놈 변화를 가능하게 하는 상동성 유도 복구(homology-directed repair, HDR)와, 종종 결실이나 프레임시프트 오류와 같은 돌연변이를 초래하는 비상동 말단 결합(non-homologous end joining, NHEJ)이 그것이다. 다양한 유전자 편집 플랫폼 가운데 CRISPR-Cas 시스템은 단순성, 저비용, 효율성에 기인하여 가장 널리 사용되는 체계로 부상해 왔다. 본 총설에서는 CRISPR-Cas 시스템에 특히 중점을 두면서 유전자 편집 기술의 발전 과정을 제시하고, 유전학, 생명공학, 농업, 의학에서의 확장되는 응용을 다룬다. 또한, 새롭게 부상하는 경향을 개괄하는 고도화된 유전자 편집 접근법에 대해서도 논의한다.
https://doi.org/10.1016/j.omtn.2025.102733
Genome editing
Frameshift mutation
Gene
DNA
Genetic engineering
CRISPR
Variety (cybernetics)
Mutation
2
Article
|
인용수 1
·
2025
Recombination-coupled DNA synthesis facilitates post-invasion steps in meiotic crossover and noncrossover formations
Hyung-Seok Choi, Junseo Lee, Jeong Hwan Joo, S. Lee, Keun Pil Kim
IF 13.1 (2025)
Nucleic Acids Research
정상적인 감수분열기 이중가닥 절단(double-strand break, DSB) 수복 과정에서 대부분의 DSB는 엄격하게 조절된 5' 말단 절단(5' end resection)을 거치며, 그 결과 3' 단일가닥(single-stranded, ss) DNA 꼬리가 생성된다. 이러한 꼬리는 Rad51과 Dmc1 필라멘트로 조립되어 상동성 탐색과 가닥 교환을 촉진함으로써 재조합을 가능하게 한다. 그러나 대부분의 교차(crossover) 및 비교차(noncrossover) 과정과 관련하여, DSB에서 ssDNA의 3' 말단에서 국소적 DNA 합성이 발생하는지, 그리고 재조합 부위에서 DNA 중합효소가 관여하는지는 DNA 수준에서 명확하지 않았다. 이에 우리는 재조합 사건의 물리적 분석, 티미딘 유사체의 시간적 주입, 초해상도 현미경 영상화를 통해 Saccharomyces cerevisiae에서 재조합-연동 DNA 합성(meiotic recombination-coupled DNA synthesis, MRDS)을 조사하였다. 그 결과 DNA 중합효소 δ(DNA polymerase δ, Pol δ)가 end-primed 합성(end-primed synthesis) 활성에 의해 초기 D-loop를 연장하는 데 필요함을 확인하였다. 특히 Pol δ에 의해 매개되는 MRDS는 이중 홀리데이 접합(double Holliday junction) 및 비교차 형성 모두에 대해 침윤(invasion) 이후 단계들을 촉진한다. 우리는 MRDS가 end-primed 합성을 통해 displacement-loop/single-end 침윤 연장을 위해 요구되며, 선도 가닥(leading strand)과 상보 가닥(complementary strand) 사이의 정확한 염기 짝맞춤을 보장한다는 점을 추정하였다. 본 연구는 MRDS에서 Pol δ의 결정적 역할을 강조하며, 침윤 이후 단계에서 재조합의 강건한 조절 양상을 보여준다.
https://doi.org/10.1093/nar/gkaf704
Biology
Homologous recombination
RAD51
DNA
D-loop
DNA polymerase
Holliday junction
Branch migration
Genetics
Recombination
3
Article
|
인용수 9
·
2024
RPA interacts with Rad52 to promote meiotic crossover and noncrossover recombination
Jeong Hwan Joo, Soogil Hong, Mika Higashide, Eui-Hwan Choi, Seobin Yoon, Minsu Lee, Hyun Ah Kang, Akira Shinohara, Nancy Kleckner, Keun Pil Kim
IF 13.1 (2024)
Nucleic Acids Research
감수분열 재조합은 프로그램된 이중가닥 절단(DSB)에 의해 개시된다. Saccharomyces cerevisiae에서의 연구들은, 3' 단일가닥 DNA(ssDNA) 꼬리를 생성하도록 급속한 절제가 일어난 뒤에는 하나의 DSB 말단이 상동 파트너 염색분체에 결합하여 DNA 합성에 의해 신장되는 반면, 다른 말단은 자신의 자매 염색분체와 연관된 채로 남아 있음을 보여주었다. 그 다음에는 교차(crossover) 및 비교차(noncrossover)로 운명이 정해진 유형들로의 조절된 분화 이후, 두 번째 DSB 말단이 신장된 첫 번째 말단과의 가닥 상동(annealing)을 통해, 두 경로 모두에서 반응에 참여한다. 이러한 두 번째 말단의 포획(capture)은 Rad52에 의존하며, 이는 알려진 두 개의 ssDNA를 상동결합(anneal)할 수 있는 능력을 통해 이루어지는 것으로 추정된다. 여기서는 DNA 재조합에 대한 물리적 분석을 이용하여, 이 과정이 ssDNA 결합 단백질인 복제 단백질 A(RPA)와의 Rad52의 직접적 상호작용에 의존함을 입증한다. 또한 이러한 Rad52–RPA 공동 활성(joint activity)의 부재는, 감수분열 전기(전기 prophase)의 파키텐(pachytene) 단계 동안 교차 부위에서 상동 축(homolog axes)으로부터 생성되는 세포학적으로 두드러진 RPA 스파이크(spike)를 초래한다. 우리의 결과는 이 스파이크가, 전도(leading) DSB 말단의 치환으로 인한 것 또는 두 번째 DSB 말단의 어느 쪽이든, 파트너 상동체에 결합된 ssDNA와 결합하지 못해 생긴 파열된 염색분체의 DSB 말단을 나타낸다는 점을 시사한다. 이러한 결과들과 그 밖의 관찰들은, 감수분열 재조합에서의 Rad52–RPA의 역할과, 분열기(mitotic) DSB 수복 사이의 밀접한 대응성을 의미한다.
https://doi.org/10.1093/nar/gkae083
RAD52
Biology
Homologous recombination
DNA
Genetics
Replication protein A
Chromosomal crossover
FLP-FRT recombination
Genetic recombination
DNA repair
최신 정부 과제
17
과제 전체보기
1
2023년 2월-2026년 2월
|174,497,000
효모의 복제 단백질 A와 Rad52의 상호작용에 의한 유전자 재조합 조절 연구
효모에서 유전자 교차와 재배열을 조절하는 복제 단백질 A(RPA)와 Rad52의 상호 협력적-독립적 기능 현상 연구를 통해 보편적인 생명의 유전적 다양성 원리와 함께 유전자 재조합 기술의 향상을 유도할 수 있는 기초생명과학 기술을 확립하고자 함.
복제 단백질 A
라드 52
유전자 교차
멘델의 유전
포자형성
2
2023년 2월-2026년 2월
|193,885,000
효모의 복제 단백질 A와 Rad52의 상호작용에 의한 유전자 재조합 조절 연구
효모에서 유전자 교차와 재배열을 조절하는 복제 단백질 A(RPA)와 Rad52의 상호 협력적-독립적 기능 현상 연구를 통해 보편적인 생명의 유전적 다양성 원리와 함께 유전자 재조합 기술의 향상을 유도할 수 있는 기초생명과학 기술을 확립하고자 함.
복제 단백질 A
라드 52
유전자 교차
멘델의 유전
포자형성
3
2022년 3월-2027년 12월
|3,671,500,000
합성신약개발 산학연계 지원사업
대학·출연(연),기업의 혁신적인 초기 연구성과의 신약개발 및 사업화 연계지원을 위해 신약개발지원센터의 연구인프라를 활용하여1. 혁신적인 합성신약 개발 지원을 위한 선도, 후보물질 최적화 지원2. 공동연구를 통한 차세대 혁신신약개발 플랫폼 기술 구축
신약개발
최적화 지원
플랫폼기술구축
분자설계
단백질구조분석
최신 특허
특허 전체보기
상태출원연도과제명출원번호상세정보
공개2022동물세포의 유전자 교정을 위한 CRISPR-Cas9 벡터 개발1020220034313
등록2022REC8 유전자의 과발현을 통한 배아줄기세포 분화 효율 증진 기술1020220013460
등록2017줄기세포 분화 효율 촉진 방법1020170108472
전체 특허

동물세포의 유전자 교정을 위한 CRISPR-Cas9 벡터 개발

상태
공개
출원연도
2022
출원번호
1020220034313

REC8 유전자의 과발현을 통한 배아줄기세포 분화 효율 증진 기술

상태
등록
출원연도
2022
출원번호
1020220013460

줄기세포 분화 효율 촉진 방법

상태
등록
출원연도
2017
출원번호
1020170108472