주요 논문
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Letter
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인용수 1
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2024Guardian of the rice: Unveiling OsSSP1 for broad-spectrum disease resistance
You‐Jin Lim, Yong‐Hwan Lee
IF 24.1 (2024)
Molecular Plant
https://doi.org/10.1016/j.molp.2024.06.002
Biology
Guardian
Broad spectrum
Plant disease resistance
Resistance (ecology)
Disease
Ecology
Genetics
Law
Political science
2
Article
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인용수 10
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2024Nuclear localization sequence of MoHTR1, a Magnaporthe oryzae effector, for transcriptional reprogramming of immunity genes in rice
You‐Jin Lim, Yoon‐Ju Yoon, Hyunjun Lee, Gobong Choi, Seongbeom Kim, Jae–Ho Ko, Jea Hyeoung Kim, Ki‐Tae Kim, Yong‐Hwan Lee
IF 15.7 (2024)
Nature Communications
식물 병원체는 핵 국소로 핵 표적 효과기(nuclear effectors)를 분비하여 숙주의 면역계를 조절한다. 최근 여러 진균 병원체의 핵 표적 효과기가 보고되었음에도 불구하고, 핵 표적 효과기의 NLS(핵 위치 신호)와 관련된 수송 소체의 분자적 기전과, 숙주 면역 유전자들의 전사적 재프로그래밍에서 NLS가 수행하는 역할은 여전히 수수께끼로 남아 있다. 우리는 이전에 벼 도열병균(rice blast fungus) Magnaporthe oryzae의 핵 표적 효과기 MoHTR1을 보고한 바 있다. MoHTR1은 벼의 핵으로는 이동하지만 진균의 핵으로는 이동하지 않는다. 여기서는 MoHTR1의 핵 국소화에 관여하는 핵심 NLS(RxKK)를 규명하였다. MoHTR1은 벼 importin α와의 상호작용을 통해 숙주 핵으로 이동한다. MoHTR1의 NLS는 M. oryzae의 세포질 효과기들이 벼 핵으로 전이(translocation)되도록 하는 기능을 부여한다. 또한 도열병 병원체의 다른 핵 표적 효과기 후보들과 RxKK를 보유한 벼 단백질들도 핵 국소화를 나타내어, 이 과정에서 RxKK의 결정적 역할을 강조한다. 더불어 MoHTR1의 안정성과 숙주 핵으로의 MoHTR1 전이에 SUMOylation의 중요성을 밝혀냈다. 아울러 MoHTR1의 NLS는 숙주에서 면역 관련 유전자들을 재프로그래밍함으로써 M. oryzae의 병원성에 필수적이다. 본 연구 결과는 진균 핵 표적 효과기에서 식물 특이적 NLS의 중요성과 식물-병원체 상호작용에서의 역할에 대한 통찰을 제공한다.
https://doi.org/10.1038/s41467-024-54272-4
Reprogramming
Effector
Gene
Biology
Immunity
Genetics
Sequence (biology)
Magnaporthe
Computational biology
Cell biology
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Review
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인용수 54
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2022Cross-kingdom co-occurrence networks in the plant microbiome: Importance and ecological interpretations
Kiseok Keith Lee, Hyun Kim, Yong‐Hwan Lee
IF 5.2 (2022)
Frontiers in Microbiology
미생물 공존(co-occurrence) 네트워크 분석은 식물 미생물군집 연구에서 자료 탐색을 위해 널리 사용되고 있다. 그러나 이러한 미생물 네트워크가 자연 미생물군집을 얼마나 잘 대표하는지, 그리고 네트워크로부터 생태-진화적 통찰을 얼마나 잘 해석하고 추출할 수 있는지에 대해서는 여전히 과제가 남아 있다. 많은 기술적 해결책이 제안되어 왔음에도 불구하고, 본 관점에서는 네트워크 표현 및 해석에서의 ‘왕국(kingdom) 수준 편향’이라는 중대한 문제에 주목한다. 자연 군집을 더 잘 대표하도록 하기 위해, 교차-왕국(세균-진균) 공존 네트워크를 사용하는 것의 생태-진화적 중요성을 강조한다. 이를 위해, 다중 왕국 분석을 수행하는 경우와 수행하지 않는 경우에 따라 식물 미생물군집 진화에 대한 생태계 수준의 해석이 어떻게 달라지는지를 시연한다. 또한 세균과 진균 사이의 전형적 이분법에서 비롯되는 네트워크의 지나치게 단순화된 해석을 극복하기 위해, 생태학적 해석을 위한 세 가지 접근을 권고한다. (1) 일반화된 로트카-볼테라(Lotka-Volterra) 및 포식자-자원(consumer-resource) 모델을 통해 공존 네트워크의 역학과 기제를 이해하는 것, (2) 개별 음성 및 양성 세균-진균 엣지에 대해 대안적인 생태학적 설명을 찾는 것, (3) 교차-왕국 네트워크를 비생물적(abiotic) 및 생물적(생체, host) 환경과 연결하는 것.
https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.953300
Microbiome
Interpretation (philosophy)
Ecology
Abiotic component
Ecosystem
Ecological network
Biology
Representation (politics)
Evolutionary biology
Computer science
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Article
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인용수 24
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2022Dysbiotic but nonpathogenic shift in the fecal mycobiota of patients with rheumatoid arthritis
Eun Ha Lee, Hyun Kim, Jung Hee Koh, Kwang Hyun Cha, Kiseok Keith Lee, Wan‐Uk Kim, Cheol‐Ho Pan, Yong‐Hwan Lee
IF 12.2 (2022)
Gut Microbes
spp.는 일반적으로 서구 코호트에서 우점한다. 또한 세균-진균 연관 분석 결과, RA 환자에서는 허브 노드가 진균에서 세균으로 이동한 것으로 나타났다. RA 환자에서의 진균성 이질균형(fungal dysbiosis)의 발견은 진균이 RA의 병인 및 분변 미생물 군집에서 핵심적인 역할을 한다는 점을 시사한다.
https://doi.org/10.1080/19490976.2022.2149020
Biology
Candida albicans
Microbiome
Microbiology
Dysbiosis
Aspergillus
Feces
Pathogenesis
Mycobiota
Relative species abundance
5
Article
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인용수 31
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2022ROS homeostasis mediated by MPK4 and SUMM2 determines synergid cell death
Ronny Völz, William Harris, Heribert Hirt, Yong‐Hwan Lee
IF 16.6 (2022)
Nature Communications
성적 식물 생식은 Arabidopsis에서 두 개의 시너지드(synergids)가 정자-세포를 전달하는 화분관(pollen tube, PT)을 끌어들이는 것에 의존하며, 이어서 이들 시너지드가 프로그램된 세포사멸(programmed cell death, PCD)을 겪는다. 병원성 조절인자들이 미토겐 활성화 단백질 키나아제 4(mitogen-activated protein kinase 4, MPK4)를 교란하면, 저항 단백질(R) SUMM2 매개 면역과 세포사멸이 활성화된다. 본 연구에서는 시너지드의 보존과 활성산소종(reactive oxygen species, ROS) 항상성이 MPK4에 의해 밀접하게 연관되고 유지됨을 보여준다. mpk4에서는 ROS 수준이 증가하며, 시너지드가 PT 수용(reception) 이전에 조기에 PCD를 겪는다. 그러나 ROS 소거제와 SUMM2의 교란이 mpk4에서 ROS 항상성, 시너지드 유지 및 PT 인식을 회복시켜, MPK4의 수호자(guardian)인 SUMM2가 시너지드-PCD를 유발함을 입증한다. mpk4/summ2에서는 PT가 feronia-like 과증식( overgrowth ) 표현형을 보인다. 본 결과는 식물 생식 과정에서 면역과 연관된 PCD와 시너지드 세포사멸이 MPK4에 의해 조절됨을 보여주며, 전신적 R 매개 면역(systemic R-mediated immunity) 동안 식물 생식이 억제되는 데 대한 기저 분자 메커니즘을 강조한다.
https://doi.org/10.1038/s41467-022-29373-7
Arabidopsis
Biology
Programmed cell death
Cell biology
Arabidopsis thaliana
Genetics
Apoptosis
Mutant
Gene