주요 논문
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Article
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인용수 2
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2025Lipidomic Network Analysis Reveals Amyloid-β-Induced Lysosomal Lipid Accumulation in the Cortex and Hippocampus of 5xFAD Mice
Yun Jae, Young-Kwang Kim, Yun Ji Lim, Chan Ho Kim, Se Eun Park, Yun Pyo Kang, Min-Kyoo Shin
IF 3.6 (2025)
Journal of Proteome Research
5xFAD 마우스 모델은 알츠하이머병(AD), 특히 아밀로이드-베타(Aβ) 유도 AD 병리 현상을 연구하기 위한 유용한 실험 시스템이다. 본 연구에서는 5xFAD 마우스의 대뇌피질과 해마에서 지질체(lipidome)의 시간적, 부위별, 성별 특이적 변화 양상을 규명하고자 하였다. 그 결과, 지질 변화는 대뇌피질과 해마에서 Aβ 병리의 진행에 따라 더욱 뚜렷해지는 것으로 나타났다. 또한 이러한 지질 변화는 남성 마우스보다 Aβ 병리가 더 심했던 암컷에서 더 크게 관찰되었다. 지질 네트워크 분석을 통해 두 뇌 영역 모두에서 AD 특이적인 지질 공발현(coexpression) 네트워크 모듈을 확인했으며, 이는 BMP와 GM3와 같은 풍부한 리소좀 지질(lysosomal lipids)로 특징지어졌다. 특히, 이러한 지질 프로파일은 스웨덴 변이(Swedish)형 Aβ 전구단백질(amyloid precursor protein; APPswe)을 과발현하는 미세아교세포(microglia)에서도 관찰되었다. 리소좀 지질 및 막 분해 과정에서 BMP의 핵심적 역할과, APPswe 형질감염 미세아교세포에서 리소좀 억제(lysosomal inhibition) 하에 GM3 축적이 증가하는 현상을 고려할 때, 본 연구 결과는 Aβ 매개 미세아교세포의 리소좀 기능 이상이 AD 진행에 기여할 수 있음을 시사한다. 종합하면, 우리는 Aβ가 리소좀 지질 대사를 조절 이상(dysregulation)시키는 데에 이전에 인식되지 않았던 역할을 발견하였으며, 질병 기전을 규명하기 위한 보완적 접근으로서 지질체학(lipidomics)과 네트워크 분석의 유용성을 강조한다.
https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.4c01133
Hippocampus
Neuroscience
Entorhinal cortex
Amyloid (mycology)
Amyloid β
Cortex (anatomy)
β amyloid
Lipidomics
Chemistry
Biology
2
Review
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인용수 14
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2025Regulation of Ferroptosis in Cancer and Immune Cells
Naeyoon Jang, Il‐Kyu Kim, Dawoon Jung, Yeonseok Chung, Yun Pyo Kang
IF 4.1 (2025)
Immune Network
페롭토시스(Ferroptosis)는 철 의존적인 조절성 세포사멸의 한 형태로, 지질 과산화에 의해 유도되며 대사 경로와 항산화 경로에 의해 형성된다. 면역세포에서는 페롭토시스에 대한 감수성이 세포 유형, 지질 구성, 대사 요구량에 따라 달라지며, 이는 암, 감염, 자가면역 질환에서의 면역 반응에 영향을 미친다. 치료적으로는 페롭토시스를 표적화하는 전략이 항종양 면역을 강화하거나 면역억제성 세포를 억제함으로써 암 면역치료에 대한 가능성을 지닌다. 본 리뷰는 페롭토시스의 기저 대사 경로, 면역세포에서의 조절, 종양 진행과 항종양 면역에서의 이중적 역할, 그리고 암 치료 최적화를 위한 맥락 의존적 치료적 함의를 강조한다.
https://doi.org/10.4110/in.2025.25.e6
Immune system
Cancer
Cancer cell
Medicine
Cancer research
Environmental science
Immunology
Internal medicine
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Preprint
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인용수 1
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2024Robust Determination of Coenzyme Q10 Redox Status Using Two Isotope-Labeled Internal Standards
Yun Pyo Kang, Tae Ha Kim, Chi Thi Ngoc Nguyen, Seon Min Kim, Sung Won Kwon
SSRN Electronic Journal
https://doi.org/10.2139/ssrn.4982487
Coenzyme Q10
Redox
Isotope
Chemistry
Cofactor
Environmental chemistry
Biochemistry
Inorganic chemistry
Physics
Nuclear physics
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Article
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인용수 2
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2024Selective Elimination of Genetic Variants of Human Embryonic Stem Cells from High Vulnerability to Ferroptosis
Yun-Jeong Kim, Seon Min Kim, Young-Hyun Go, Han Sun Kim, Sunghyouk Park, Yun Pyo Kang, Hyuk‐Jin Cha
IF 9.6 (2024)
Biomaterials Research
인간 만능성 줄기세포(hPSC) 기반 세포치료가 지닌 큰 가능성에도 불구하고, 시험관 내 배양 과정에서 발생하는 유전적 이상으로 인해 안전성 우려가 제기되며, 그 결과는 불확실하다. 특히, 이러한 유전적 이상은 ‘배양 적응(culture-adaptation)’이라 불리는 생존 특성을 부여하여, 비정상 hPSCs가 아폽토시스를 회피하고 정상 세포보다 우위를 점할 수 있게 한다. 따라서 치료 적용의 안전성을 확보하기 위해 비정상 hPSCs를 선택적으로 제거하는 전략을 개발하는 것이 필수적이다. 본 연구에서 우리는 유전적 변이를 지닌 hPSC가 해당과정(glycolysis)의 증가 및 활성 지방산 생합성의 활성화를 보임을 확인하였다. 놀랍게도, 이러한 변이체는 스트레스 유발 아폽토시스에 대한 저항성을 나타내는 한편, 글루타티온 퍼옥시데이즈 4 억제제(glutathione peroxide 4 inhibitor)인 RAS-선택적 치명타 3(RAS-selective lethal 3, RSL3) 처리에는 역설적으로 페롭토시스(ferroptosis)에 취약하였다. RSL3에 대한 선택적 민감성은 Yes1-associated protein 1의 활성에 의해 acyl-coenzyme A synthetase long-chain family member 4가 상향 조절되면서, 인지질을 포함하는 다불포화 지방산(polyunsaturated fatty acids)의 수준이 상승한 데서 기인하였다. 중요하게도, 정상 hPSC와 대사 변이체가 페롭토시스에 보이는 서로 다른 민감성은 RSL3 처리를 통해 유전적으로 이상이 있는 hPSCs를 표적으로 제거할 수 있게 하였고, RSL3에 일시적으로 노출된 정상 hPSC는 만능성(pluripotency)과 정상적인 분화 능력을 유지하였다. 이러한 결과는 장기간의 시험관 내 배양 동안 유전적으로 정상인 hPSC를 유지함으로써 hPSC 기반 세포치료의 안전성과 유효성을 보장할 수 있다는 점에서 중요한 의미를 지닌다.
https://doi.org/10.34133/bmr.0093
Embryonic stem cell
Stem cell
Vulnerability (computing)
Biology
Genetics
Cell biology
Gene
Computer security
Computer science
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Review
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인용수 8
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2022Mass spectrometry-based approaches to explore metabolism regulating ferroptosis
Chi Thi Ngoc Nguyen, Seon Min Kim, Yun Pyo Kang
IF 3.8 (2022)
BMB Reports
페롭토시스(ferroptosis)는 아폽토시스(apoptosis)나 괴사성 아폽토시스(necroptosis)와는 구별되는 프로그램된 세포사멸의 한 유형이다. 페롭토시스는 철(iron)에 의존하는 지질 과산화물(lipid peroxides)의 축적과 세포막 무결성의 붕괴로 잘 특징지어진다. 여러 대사 변화는 페롭토시스 유도를 억제하거나 촉진할 수 있다. 최근 질량분석(mass spectrometry) 분석 기법의 발전은 페롭토시스 조절 대사 이해에 중요하다고 알려진 대사산물(metabolites)을 고처리량으로 분석할 수 있게 해주었다. 본 총설에서는 시스테인(cysteine) 대사, 항산화(antioxidant) 대사, 다가 불포화 지방산(poly-unsaturated fatty acid) 대사에 초점을 맞추어, 페롭토시스를 조절하는 다양한 대사 경로의 최근 발견에 기여하는 질량분석 기반 분석 방법들을 소개한다. [BMB Reports 2022; 55(9): 413-416].
https://doi.org/10.5483/bmbrep.2022.55.9.109
Mass spectrometry
Metabolism
Computational biology
Chemistry
Cell biology
Biochemistry
Biology
Chromatography