노화와 RNA 생합성 및 수송 간의 관계는 점차 커지는 관심을 받고 있으나, 정확한 기전은 아직 알려져 있지 않다. THO 복합체는 mRNA의 동시전사적 성숙 및 수출에 필수적이다. 본 연구에서 우리는 THO 복합체가 수명 조절과 밀접하게 연관되어 있음을 보고한다. THO 복합체의 구성요소인 Hpr1 및 Tho2의 결핍은 복제수명(RLS)을 감소시켰으며, 이는 Sir2 비의존적 RLS 조절 경로와 연관되어 있다. hpr1Δ 또는 tho2Δ 돌연변이에서 전사체의 격리가 Rrp6를 포함하는 엑소좀 성분에 의해 상쇄되었음에도 불구하고, hpr1Δ에서의 RLS 결함을 완화하지는 못했다. 그러나 hpr1Δ 또는 tho2Δ에서의 RLS 손상은 Rrp6와 상호작용하는 Nrd1 특이 돌연변이의 추가 발현에 의해 상쇄되었다. 이러한 효과는 노화 관련 유전자를 조절하는 전사 조절자인 Nrd1이, 리보솜 생합성 또는 RNA 대사 유전자를 포함하는 노화 관련 유전자들의 전사에 관여하며, RNA 중합효소 II와의 상호작용에 의존하였다. Nrd1의 과발현은 Tho2-의존적 경로를 통해 RLS를 감소시켰다. 흥미롭게도 Tho2의 결실은 임의적인 Nrd1 염색질 결합을 유도함으로써 Nrd1 과발현의 효과를 그대로 모사하였다. 더 나아가 전 게놈 ChIP-seq 분석 결과, Tho2 상실 시 노화와 관련된 것으로 알려진 번역 연관 유전자들로의 Nrd1 모집이 증가함이 확인되었다. 종합하면, 본 연구 결과는 노화 관련 유전자의 전사 조절을 통해 수명 조절 경로에서 Tho2 매개 Nrd1 동반(escort)이 중요함을 강조한다.

대체 스플라이싱(AS) 사건은 특정 경로와 암에서의 표현형 가소성을 조절한다. 선행 연구에서 스플라이싱 사건을 계산적으로 분석한 바 있음에도 불구하고, 수많은 후보로부터 신뢰할 수 있는 AS 사건이 유도하는 생물학적 기능을 밝히는 일은 여전히 도전적이다. 경로 조절을 평가하기 위한 필수 스플라이싱 사건 시그니처를 제공하기 위하여, 우리는 두 가지 데이터셋을 수집하여 데이터베이스를 개발하였다: (i) 보고된 문헌 및 (ii) 암 전사체 프로파일. 전자는 자연어 처리 기법을 사용하여 63,229개의 PubMed 초록에서 수집된 지식 기반 스플라이싱 시그니처를 포함하며, 202개 경로에 대해 추출되었다. 후자는 16개 암 유형 및 42개 경로에 대한 팬-암 전사체에서 기계 학습 기반으로 식별된 스플라이싱 시그니처이다. 우리는 스플라이싱 프로파일로부터 경로의 활동성을 분류하기 위한 학습 데이터셋으로서 여섯 가지 서로 다른 학습 모델을 구축하였다. 각 경로에 대한 시그니처는 학습 모델의 특징 중요도(feature importance)로 상위에 랭크된 AS 사건을 사용하여 결정하였다. 학습 결과를 검증하기 위해 (i) 성능 지표, (ii) 외부 데이터셋으로부터 획득한 차등 AS 세트, (iii) 우리의 지식 기반 시그니처의 세 가지 방식으로 평가를 수행하였다. 학습 모델의 수신자 조작 특성(receiver operating characteristic) 곡선 아래 면적 값은 뚜렷한 급격한 차이를 보이지 않았다. 그러나 랜덤 포레스트는 외부 데이터셋에서 확인된 AS 세트 및 지식 기반 시그니처와 비교했을 때 현저하게 최고의 성능을 나타냈다. 따라서 우리는 랜덤 포레스트 모델로부터 얻은 시그니처를 사용하였다. 우리의 데이터베이스는 생존 분석, 분자 아형, 종양 미세환경을 포함하여 AS 시그니처의 임상적 특성을 제공하였다. 또한 스플라이싱 인자에 의한 조절을 추가로 조사하였다. 개발된 시그니처에 대한 우리의 데이터베이스는 검색 및 시각화 시스템을 지원한다.

초록 배경 오믹스 연구에서 분자 시그니처를 식별하는 방법은 독성학 연구에서 널리 적용되고 있으며, 잠재적 독성 효과의 평가는 분자 수준의 새로운 통찰을 제공한다. 목적 독성 효과와 약물 내성의 예측은 표적 화합물의 작용 양식을 이해하는 데 중요한 단서를 제공한다. 그러나 시료 내 이질성은 시료에서 표적 세포의 순도가 실제 이용 전까지는 알려지지 않기 때문에 독성학 연구를 어렵게 만든다. 결과 단일세포 분해능 연구는 독성유전체학에서 제안되어 왔으며, 여러 연구에서 생체 내(in vivo) 및 시험관 내(in vitro) 조건 모두에서 이질적인 세포를 사용하여 독성 효과와 약물 내성을 설명한 바 있다. 본 종설에서는 단일세포 전사체에 대한 이해와 독성유전체학에서의 적용을 제시하였다. 결론 생명체에서 가장 독성적인 기전은 분자 내 조합을 통해 발생하며, 이질성 문제는 극복 가능한 수준에 도달하였다. 본 종설이 독성학에 관한 향후 연구를 성공적으로 수행하는 데 도움이 되는 통찰을 제공하기를 기대한다. 목적(종설의 목적) 독성유전체학은 독성학과 유전체학 사이의 학제 간 분야로서, 광범위한 독성학 분야에서 분자 프로파일을 구성하는 데 성공적으로 적용되었다. 그러나 시료 내 이질성은 시료에서 표적 세포의 순도가 실제 이용 전까지는 알려지지 않기 때문에 독성학 연구를 어렵게 만든다. 본 종설에서는 단일세포 전사체에 대한 이해와 독성유전체학에서의 적용을 제시하였다. 최근 یافته 고처리량 기법은 독성유전체학에서 세포 이질성과 분자 기전을 이해하는 데 사용되어 왔다. 단일세포 분해능 분석은 독성 효과를 설명하는 바이오마커를 식별하고 약물 내성을 이해하기 위해 필요하다.

단일세포 전사체(trascriptomic) 프로파일 분석은 사람의 위암(GC) 행동을 이해하는 데 새로운 통찰을 제안해 왔다. 위암(GC)은 종양 내 이질성(intratumoral heterogeneity)을 연구하기 위한 독특한 모델을 제공한다. 그러나 발암 과정에서 관여하는 세포의 특정 계통 및 기질성 세포의 종양 미세환경은 잘 알려져 있지 않았다. 우리는 RNA 염기서열분석을 통해 단일세포 해상도에서 전암성 병변과 위암의 이질적인 세포 집단을 특성화하였다. 그 결과 10개의 위(胃) 세포 아형(subtype)을 확인하였고, 장형 및 미만형 암이 서로 다른 세포 집단으로 특징지어짐을 보였다. 우리는 장형 및 미만형 암 세포가 서로 다른 화생(metaplastic) 세포 계통을 가진다는 것을 발견하였다. 즉, 장형 암 세포는 장 화생 라인지를 따라 분화한 반면, 미만형 암 세포는 de novo 경로를 닮았다. 또한 전암성 질환 상태에서 CCND1 변이가 풍부하게 나타나는 것을 관찰하였고, pro-stemness 특성을 보유한 암 관련 섬유아세포(cancer-associated fibroblast) 세포를 확인하였다. 특히 종양 세포는 이전에 제안되었던 분자 아형(molecular subtypes)으로 분류될 수 있었으며, 상피-근섬유아세포 전이(epithelial-myofibroblast transition)와 관련된 발현이 높은 특정 악성 세포 아형을 보유하고 있었고, 이는 불량한 임상 예후와 연관되었다. 종양 내 이질성뿐 아니라, 분석을 통해 서로 다른 세포 계통이 잠재적인 발암 경로에 기여함이 드러났다. 위의 전암성 병변과 암에 대한 단일세포 전사체 분석은 위암(GC) 세포의 행동을 이해하는 데 통찰을 제공할 수 있으며, 위암(GC)의 진단 및 치료를 위한 잠재적 표적을 시사한다.

췌장암은 가장 치명적인 악성종양 중 하나로, 5년 생존율이 단 13%에 불과할 정도로 예후가 매우 불량하다. 다중 오믹스 연구를 통해 운전자 유전자 및 종양유전자에서의 중요한 변이와 조절 기전이 밝혀졌음에도 불구하고, 효과적인 치료 옵션은 여전히 제한적이다. 이러한 긴급한 임상적 미충족 수요에 대응하기 위해, 우리는 장독-읽기(large long-read) 시퀀싱(LR-seq)을 활용하여 단독-읽기(short-read) 시퀀싱 방법으로는 검출이 어려운 복잡한 구조 변이와 대체 스플라이싱(alternative splicing) 사건을 규명하고자 하였다. 총 150,904개의 아이소폼(isoforms)을 확인하였으며, 그중 62,111개는 새로운 변이(novel variants)를 포함하였다. 이들 새로운 아이소폼 중 51.5%는 종양 특이적 발현을 보였다. 새로운 아이소폼은 CD74, B2M, DAXX와 같은 종양유전자에서 빈번히 검출되었으며, 이는 췌장암에서의 구별되는 운전자(driver) 사건이 있음을 시사한다. 특히, 새로운 대체 전사 개시 부위(alternative transcription start sites)는 H3K4me3 및 H3K27ac로 표지된 염색질 접근성(chromatin-accessible) 영역에서 종양 세포 특이적으로 농축되어 있었고, 이러한 아이소폼은 CALR, PTK6, TAPBP를 포함하는 MHC 관련 기능을 교란하는 것으로 나타났다. 새로운 아이소폼의 발현 양상은 고전적(classical) 및 준-간엽성(quasi-mesenchymal, QM) 아형을 명확히 구분하였으며(P = 0.001), 분자 아형 전반에서 대체 스플라이싱(alternative splicing)과 switch-like 아이소폼의 전역 분석을 통해 스플라이싱 사건이 Rho GTPase 신호전달, GPCR 신호전달, 세포외기질 조직화 등을 통해 고전적 아형과 QM 아형 사이의 전이성 특성을 조절함이 확인되었다. 결론적으로, 본 연구는 장독-읽기 시퀀싱이 췌장암의 분자적 이질성을 규정하는 새로운 아이소폼과 대체 스플라이싱 사건을 밝히는 데 결정적 역할을 한다는 점을 강조한다. 이러한 결과는 주요 종양유전자의 조절에 대한 새로운 통찰을 제공하며, 이 치명적인 악성종양의 진단 및 치료 개선에 대한 함의를 갖는 잠재적 치료 표적을 제시한다. 인용 형식: Charny Park, Hyeyeong Hwang, Daejin Hyung, Namhee Yu, Sehwa Hong, Soo Young Cho, Sang Myung Woo. 췌장 선암 transcriptome의 장독-읽기 시퀀싱이 비정상 아이소폼과 종양 진행을 밝혀냄 [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2026; Part 1 (Regular Abstracts); 2026 Apr 17-22; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2026;86(7 Suppl):Abstract nr 1505.

소세포폐암(Small cell lung cancer, SCLC)은 매우 공격적인 폐암으로 예후가 극도로 불량하다. 종양 진행의 기저 기전과 치료 전략은 아직 충분히 이해되지 않았다. 이러한 임상적 과제를 해결하기 위해 단일세포 ATAC-RNA 다중오믹스 프로파일링을 활용하여 클론 진행과 그 조절 기전을 규명하고자 하였다. 환자 유래 세포(n=73,546)를 흉수(pleural effusions, n=22)에서 수집하고 종양, 기질, 림프구성, 골수성(myeloid) 집단으로 분류하였다. 종양 세포는 ASCL1+ 및 NEUROD1+ 아형으로 특징지어지는 두 가지 클론 궤적(clonal trajectories)을 따라 진행하는 양상을 보였다. KEAP1 변이가 있는 환자에서 유래한 ASCL1+ 세포는 NRF2-KEAP1 경로를 활성화하고 ferroptosis를 유도하였다. 특히 KEAP1 변이가 있는 환자에서는 대세포 신경내분비암(large-cell neuroendocrine carcinoma)과 SCLC가 모두 진단되었다. 반면 NEUROD1+ 세포의 진화는 G 단백질 신호전달 및 Rho GTPase 경로의 상향조절과 더불어 신경 발달(neuronal development)과 연관되어 있었다. 종양 진행 조절인자들은 ASCL1+ 아형(FOXA1, KLF2, NR2C1, NRF1)과 NEUROD1+ 아형(PITX1, RORB) 모두에서 확인되었다. 이들 전사인자가 표적 유전자를 조절하는 기전은 서로 다른 궤적을 따라 종양 세포의 진행을 일관되게 반영하였다. 종양 미세환경(TME) 세포 중에서는 장기 생존 및 치료 후(post-treatment) 환자에서 소진(exhausted)된 T 세포와 TREM2+ 대식세포가 더 많이 관찰되었다. 세포주기(cell-cycle)와 연관된 암 섬유화(cancer fibrosis)는 진행 및 더 짧은 생존을 보인 환자에서 풍부하였다. 세포-세포 상호작용을 조사한 결과, ASCL1+ 종양 클러스터는 주로 GAS6 및 SPP1 신호전달 네트워크를 통해 골수성(myeloid) 및 기질(stromal) 세포와 상호작용하는 양상이 두드러졌으며, 한편 NCAM 및 NEGF 경로는 신경내분비 종양 세포(neuroendocrine tumor cells) 내에서의 소통을 촉진함으로써 NEUROD1+ 종양 세포의 기능을 강화하였다. 본 연구는 ASCL1+ 및 NEUROD1+ 아형이 특정 조절 경로를 통해 종양 진행을 주도하는 SCLC의 뚜렷한 클론 궤적을 규명한다. 핵심 전사인자들은 종양 진화의 주요 동인(pivotal drivers)으로 확인되었다. 면역 및 기질 프로파일은 면역 소진과 섬유화가 환자 생존에 유의미하게 영향을 미친다는 점을 시사하며, 이는 치료 전략 및 치료 후 중재에 대한 잠재적 표적을 강조한다. 인용 형식: Charny Park, Namhee Yu, Jung-Hyun Kim, Sehwa Hong, Mihwa Hwang, Bo Ram Song, Sunshin Kim, Soo Young Cho, Beung-Chul Ahn, Ji-Youn Han. Single-cell multi-omics profiling unveils the regulatory mechanisms of small cell lung cancer [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2026; Part 1 (Regular Abstracts); 2026 Apr 17-22; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2026;86(7 Suppl):Abstract nr 5964.

펩타이드- HLA class I 결합의 정확한 예측은 면역치료 및 백신 개발에 필수적이지만, 기존 방법들은 펩타이드와 다양한 HLA 대립유전자 사이의 복잡한 생물학적 관계를 포착하는 데 종종 어려움을 겪는다. 여기서는 언어 모델 기반 임베딩(ELMo)과 이중 어텐션 메커니즘-자기 정렬 교차 어텐션 및 자기 어텐션을 결합하여 풍부한 문맥적 특징과 쌍별 상호작용을 포착하는 범특이(pan-specific) 예측 모델 SeqDA-HLA를 제시한다. 여러 벤치마크 데이터셋에서 14개의 최신(state-of-the-art) 방법들과의 평가를 수행한 결과, SeqDA-HLA는 경쟁 접근법을 일관되게 능가하며 AUC 값은 최대 0.9856, 정확도는 최대 0.9408에 이르렀다. 특히 SeqDA-HLA는 펩타이드 길이(8–14)와 HLA 대립유전자 전반에 걸쳐 견고한 성능을 유지하여 일반화 가능성을 보여준다. 예측 정확도뿐 아니라, SeqDA-HLA는 필수 앵커 잔기를 부각하고 핵심 결합 모티프를 드러냄으로써 해석가능성을 제공하며, 이는 실험적으로 검증된 생물학적 통찰과 부합한다. 더 나아가 실제 적용 가능성을 보여주기 위해, SeqDA-HLA를 인플루엔자 바이러스 데이터셋에서 미세조정하여 단일 아미노산 변이로 인해 유도된 결합 변화들을 성공적으로 예측한다. 종합하면, SeqDA-HLA는 펩타이드-HLA 결합 예측을 위한 강력하고 해석가능한 도구로서, 에피토프 기반 백신 설계 및 정밀 면역치료에 잠재적 응용이 있다.

목적: 각막 이형성(corneal dysmorphologies, CDs)은 일반적으로 퇴행성 퇴화 각막 이영양증(regressive degenerative corneal dystrophies, CDtrs) 또는 결함 있는 성장 및 분화에 의해 유도되는 각막 이형성(corneal dysplasias, CDyps)으로 분류된다. 두 안과 질환 모두 다인성 원인을 가진다. 기존 연구에서는 각막 이형성의 증상, 역학, 병태생리와 같은 여러 측면을 규명해 왔으나, 유전적 기전은 아직 불완전하게 이해되고 있다. 본 연구의 목적은 8,707개의 노크아웃 마우스 라인에서 표현형 데이터(phenotype data)를 분석하여 사람에서 각막 이형성의 발달과 관련된 새로운 유전자를 확인하는 데 있다. 방법: International Mouse Phenotyping Consortium에서 표현형 평가된 8,707개의 노크아웃 마우스 라인을 대상으로, 통계적으로 유의한(P < 0.0001) 비정상 각막 형태와 연관된 유전자를 질의하여 후보 CD 유전자를 식별하였다. 각막 이상은 조직병리(histopathology)로 조사하였다. 문헌 검색을 통해 후보 유전자가 마우스와 사람의 CD와 각각 연관되었던 비율을 확인하였다. 마우스 후보 유전자의 사람 정위유전자(human orthologues) 표현형을, 알려진 사람 CD 유전자와 비교하여 단백질-단백질 상호작용 및 분자 경로를 Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins (STRING), Protein Analysis Through Evolutionary Relationships (PANTHER), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)에서 규명하였다. 결과: 8,707개의 노크아웃 마우스 라인 데이터 분석을 통해 213개의 후보 CD 유전자가 확인되었다. 이들 중 37개(17%) 유전자는 CD와 관련이 기존에 알려져 있었으며, 마우스 14개, 사람 16개, 그리고 양쪽 모두 7개가 포함되었다. 나머지 176개(83%) 유전자는 이전에 CD와 관련된 것으로 보고된 바가 없었다. 또한 공개된 RNAseq 데이터에서 총 213개 중 131개(61.5%)가 성인 사람 각막 조직에서 발현됨을 확인하였다. STRING 분석에서는 후보 및 확립된 CD 단백질들 사이에서 여러 상호작용이 나타났다. PANTHER 분석에서는 후보 유전자에 대해 확립된 유전자들의 모든 세포 경로가 확인되었다. 후보 유전자 중 일부는 TGF-ß 신호전달과 같은 각막 질환에 연관되는 것으로 제시되었다. 아울러 사람 각막과 관련된, 상대적으로 덜 주목받은 다른 가능한 기전들도 확인하였다. 결론: 본 연구는 노크아웃 마우스에서 통계적으로 유의한 비정상 각막 표현형을 유발하는 213개의 마우스 유전자를 확인했으며, 그중 다수는 이전에 각막 병태와 관련이 보고되지 않았다. 생물정보학적 분석 결과, 후보 유전자들이 여러 신호전달 경로에 관여하는 것으로 나타났고, 이는 잠재적인 치료 표적이 될 수 있다.

노화와 RNA 생합성 및 수송 간의 관계는 점차 커지는 관심을 받고 있으나, 정확한 기전은 아직 알려져 있지 않다. THO 복합체는 mRNA의 동시전사적 성숙 및 수출에 필수적이다. 본 연구에서 우리는 THO 복합체가 수명 조절과 밀접하게 연관되어 있음을 보고한다. THO 복합체의 구성요소인 Hpr1 및 Tho2의 결핍은 복제수명(RLS)을 감소시켰으며, 이는 Sir2 비의존적 RLS 조절 경로와 연관되어 있다. hpr1Δ 또는 tho2Δ 돌연변이에서 전사체의 격리가 Rrp6를 포함하는 엑소좀 성분에 의해 상쇄되었음에도 불구하고, hpr1Δ에서의 RLS 결함을 완화하지는 못했다. 그러나 hpr1Δ 또는 tho2Δ에서의 RLS 손상은 Rrp6와 상호작용하는 Nrd1 특이 돌연변이의 추가 발현에 의해 상쇄되었다. 이러한 효과는 노화 관련 유전자를 조절하는 전사 조절자인 Nrd1이, 리보솜 생합성 또는 RNA 대사 유전자를 포함하는 노화 관련 유전자들의 전사에 관여하며, RNA 중합효소 II와의 상호작용에 의존하였다. Nrd1의 과발현은 Tho2-의존적 경로를 통해 RLS를 감소시켰다. 흥미롭게도 Tho2의 결실은 임의적인 Nrd1 염색질 결합을 유도함으로써 Nrd1 과발현의 효과를 그대로 모사하였다. 더 나아가 전 게놈 ChIP-seq 분석 결과, Tho2 상실 시 노화와 관련된 것으로 알려진 번역 연관 유전자들로의 Nrd1 모집이 증가함이 확인되었다. 종합하면, 본 연구 결과는 노화 관련 유전자의 전사 조절을 통해 수명 조절 경로에서 Tho2 매개 Nrd1 동반(escort)이 중요함을 강조한다.

대체 스플라이싱(AS) 사건은 특정 경로와 암에서의 표현형 가소성을 조절한다. 선행 연구에서 스플라이싱 사건을 계산적으로 분석한 바 있음에도 불구하고, 수많은 후보로부터 신뢰할 수 있는 AS 사건이 유도하는 생물학적 기능을 밝히는 일은 여전히 도전적이다. 경로 조절을 평가하기 위한 필수 스플라이싱 사건 시그니처를 제공하기 위하여, 우리는 두 가지 데이터셋을 수집하여 데이터베이스를 개발하였다: (i) 보고된 문헌 및 (ii) 암 전사체 프로파일. 전자는 자연어 처리 기법을 사용하여 63,229개의 PubMed 초록에서 수집된 지식 기반 스플라이싱 시그니처를 포함하며, 202개 경로에 대해 추출되었다. 후자는 16개 암 유형 및 42개 경로에 대한 팬-암 전사체에서 기계 학습 기반으로 식별된 스플라이싱 시그니처이다. 우리는 스플라이싱 프로파일로부터 경로의 활동성을 분류하기 위한 학습 데이터셋으로서 여섯 가지 서로 다른 학습 모델을 구축하였다. 각 경로에 대한 시그니처는 학습 모델의 특징 중요도(feature importance)로 상위에 랭크된 AS 사건을 사용하여 결정하였다. 학습 결과를 검증하기 위해 (i) 성능 지표, (ii) 외부 데이터셋으로부터 획득한 차등 AS 세트, (iii) 우리의 지식 기반 시그니처의 세 가지 방식으로 평가를 수행하였다. 학습 모델의 수신자 조작 특성(receiver operating characteristic) 곡선 아래 면적 값은 뚜렷한 급격한 차이를 보이지 않았다. 그러나 랜덤 포레스트는 외부 데이터셋에서 확인된 AS 세트 및 지식 기반 시그니처와 비교했을 때 현저하게 최고의 성능을 나타냈다. 따라서 우리는 랜덤 포레스트 모델로부터 얻은 시그니처를 사용하였다. 우리의 데이터베이스는 생존 분석, 분자 아형, 종양 미세환경을 포함하여 AS 시그니처의 임상적 특성을 제공하였다. 또한 스플라이싱 인자에 의한 조절을 추가로 조사하였다. 개발된 시그니처에 대한 우리의 데이터베이스는 검색 및 시각화 시스템을 지원한다.

초록 배경 오믹스 연구에서 분자 시그니처를 식별하는 방법은 독성학 연구에서 널리 적용되고 있으며, 잠재적 독성 효과의 평가는 분자 수준의 새로운 통찰을 제공한다. 목적 독성 효과와 약물 내성의 예측은 표적 화합물의 작용 양식을 이해하는 데 중요한 단서를 제공한다. 그러나 시료 내 이질성은 시료에서 표적 세포의 순도가 실제 이용 전까지는 알려지지 않기 때문에 독성학 연구를 어렵게 만든다. 결과 단일세포 분해능 연구는 독성유전체학에서 제안되어 왔으며, 여러 연구에서 생체 내(in vivo) 및 시험관 내(in vitro) 조건 모두에서 이질적인 세포를 사용하여 독성 효과와 약물 내성을 설명한 바 있다. 본 종설에서는 단일세포 전사체에 대한 이해와 독성유전체학에서의 적용을 제시하였다. 결론 생명체에서 가장 독성적인 기전은 분자 내 조합을 통해 발생하며, 이질성 문제는 극복 가능한 수준에 도달하였다. 본 종설이 독성학에 관한 향후 연구를 성공적으로 수행하는 데 도움이 되는 통찰을 제공하기를 기대한다. 목적(종설의 목적) 독성유전체학은 독성학과 유전체학 사이의 학제 간 분야로서, 광범위한 독성학 분야에서 분자 프로파일을 구성하는 데 성공적으로 적용되었다. 그러나 시료 내 이질성은 시료에서 표적 세포의 순도가 실제 이용 전까지는 알려지지 않기 때문에 독성학 연구를 어렵게 만든다. 본 종설에서는 단일세포 전사체에 대한 이해와 독성유전체학에서의 적용을 제시하였다. 최근 یافته 고처리량 기법은 독성유전체학에서 세포 이질성과 분자 기전을 이해하는 데 사용되어 왔다. 단일세포 분해능 분석은 독성 효과를 설명하는 바이오마커를 식별하고 약물 내성을 이해하기 위해 필요하다.