서로 다른 독립적 동질 집단으로 생각되었던 B-1a 세포는 이질적이다. 우리는 단일세포 RNA 시퀀싱과 BCR 레퍼토리 프로파일링을 수행하여 복강(peritoneal cavity)의 B 세포에서 전사적 및 클론(계통) 이질성을 조사하였다. 초기 클러스터링은 B1a, B1b, B2의 세 가지 주요 집단이 있음을 확인하였다. 예상대로 B1a 세포 집단은 매우 반복적인 BCR을 보였으나, B1b 및 B2 세포의 대부분 BCR 클론형(clonotype)은 단 1회에서만 관찰되었다. 흥미롭게도 IgH V11 또는 V12에 치우친 두 가지 서로 다른 B1a 하위집단을 관찰할 수 있었으며, 이들 모두는 인지질인 포스파티딜콜린(phosphatidylcholine)에 결합하는 자가반응성(aut oreactive) 특이성과 연관되어 있었다. 두 B1a 세포 하위집단은 면역글로불린 중쇄의 기여도를 제거한 뒤 이들을 다시 재분류(regrouped)하였음에도 지속되었기 때문에, 유전자 발현 프로파일에서도 서로 달랐다. 또한 CD11b, B220, ICAM-1을 포함한 확인된 세포표면 마커를 사용하여 유세포분석(flow cytometry)으로 두 하위집단을 확인할 수 있었다. 두 하위집단은 입양이식(adoptive transfer) 실험에서 대체로 고유한 특성을 유지하였으나, 일부의 Fucosyl transferase 8(-) B1a 세포는 Fucosyl transferase 8(+) B1a 세포로 전환되었고, 그 반대 전환은 관찰되지 않았다. 요약하면, 우리는 BCR 레퍼토리의 사용과 유전자 발현 프로파일에 근거하여 두 가지 서로 다른 B1a 세포 하위집단을 규명하였다. 이들의 기능적 차이는 사람의 B-1a 세포를 정의하는 데 기여하고, 체액성 면역에서의 차등적 기여를 설명하는 데 도움이 될 수 있다. 재원 조달: RS-2024-00405650, 2023R1A2C2004510. 주제 범주: 면역 반응 조절: 세포 기전(IRC)

BCR 결합에 따른 CD69 반응과, 구별되는 BCR 레퍼토리.

γδ T 세포는 Vδ1, Vδ2 및 기타 덜 흔한 아형으로 분류된다. Vγ9Vδ2 T 세포는 주로 혈액에서 순환하며, butyrophilins를 통해 인산화 항원(phosphoantigens)에 반응하고 암을 포함한 염증성 조직으로 침윤한다. 대체로 조직에 상주하는 Vδ1 T 세포는 스트레스 관련 항원에 대한 반응으로 증식한다. 암에서는 Vδ1 및 Vδ2 T 세포 모두 종양으로 침윤한다. 본 연구에서는 50명의 환자로부터 혈액 및 암 침윤 γδ T 세포의 면역학적 표현형과 TCR 레퍼토리를 조사하였다. 암 침윤 Vδ1 및 Vδ2 γδ T 세포는 서로 간에 그리고 각각의 혈액 대조군과도 표현형이 상이하였다. 암 침윤 Vδ2 T 세포는 혈액의 Vδ2 T 세포와 유사한 수준으로 NKG2A, CD16 및 CCR5를 발현하였다. 반면, 암 침윤 Vδ1 T 세포는 혈액의 Vδ1 T 세포에 비해 더 높은 수준의 CD45RO와 CCR5를 발현하였다. 암 침윤 Vδ2 T 세포는 NKG2A 및 CD94를 발현하는 반면, 암 침윤 Vδ1 T 세포는 NKG2A가 아닌 서로 다른 KIR의 집합을 발현하였다. 단일세포 NGS 분석을 통해 서로 다른 γδ T 세포 하위 집단이 확인되었으며, 이들은 고유한 Vγ 사슬, 세포독성 마커, 사이토카인 수용체, KIR 및 전사인자로 특징지어졌다. 이러한 암 침윤 γδ T 세포의 다양성은 항암 및 친암( pro-cancer ) 특성 모두에 기여하며, 효과적인 γδ T 세포 기반 암 면역치료를 개발하기 위해 이들의 항원성 및 기능적 역할을 이해할 필요성을 강조한다. Funding Sources Supported by 2023R1A2C2004510; RS-2024-00405650 Topic Categories Tumor Immunology: Cellular Responses and Tumor Microevironment (TIME)

순진(naive) B 세포는 두 종류의 BCR—IgM과 IgD—를 공발현한다. IgD-BCR은 자가 항원에 대한 내성을 촉진하는 반면, IgM-BCR은 활성화 신호를 유발한다. 그러나 두 BCR 간의 신호 전달 차이는 충분히 이해되지 않았다. 본 연구에서는 항-IgM, 항-IgD 또는 둘 다로 여포(follicular) B 세포를 자극하여 칼슘 신호전달, Syk 및 BTK의 인산화, 그리고 세포 생존을 조사하였다. IgM 또는 IgD BCR의 결합은 서로 다른 세포 내 칼슘 신호전달 패턴을 나타냈다. 항-IgM 항체 자극은 세포 내 칼슘의 지속적인 증가를 유도한 반면, 항-IgD Ab는 빠른 증가 후 세포 내 칼슘의 급격한 감소를 유발하였다. 이러한 차이는 세포외 칼슘을 고갈시키는 조건에서도 관찰되었는데, 이는 IgM- 또는 IgD-BCR에 의해 ER 칼슘이 서로 다르게 조절됨을 시사한다. IgM- 및 IgD-BCR을 동시에 결합시키면 IgD-BCR 결합만 단독으로 유도했을 때와 유사한 패턴이 나타났으며, 이는 IgD-BCR 신호가 IgM-BCR 신호를 억제함을 의미한다. IgD-BCR 복합체는 IgM-BCR에 비해 CD19 및 CD23의 하향조절을 유발함으로써, IgM- 및 IgD-BCR 복합체가 서로 다르게 조절되는 것으로 보인다. IgD-BCR의 결합은 B 세포 생존을 지속시키지 못한 반면, IgM-BCR의 결합은 그러지 못하였다. 요약하면, IgM과 IgD-BCR은 공동수용체(co-receptor)와의 연관성 및 서로 다른 칼슘 신호전달 패턴과 각각 다르게 연결되어 있었다. 본 연구 결과는 IgM- 및 IgD-BCR의 상이한 기능에 대한 이해를 제공한다. 기금 출처: 2023R1A2C2004510; RS-2024-00405650. 주제 범주: 면역 반응 조절: 분자적 기전(IRM)

비장(marginal zone, MZ)에 존재하는 MZ B 세포는 혈류를 통해 유입되는 병원체에 대한 항체를 생성하는 데 중요한 선천성 특성을 지닌 림프구이다. MZ B 세포의 이질성에 대한 근거가 있음에도 불구하고, MZ B 세포의 전반적인 구성은 충분히 규명되어 있지 않다. 이들의 다양한 면역 기능을 고려할 때, MZ B 세포는 서로 다른 아집단으로 구성되어 있을 가능성이 크다. 선행 연구에서 우리는 MZ B 세포의 두 아형인 CD80high와 CD80low를 확인하였으며, 이들은 유전적 및 기능적으로 서로 다르다. 이러한 차이에는 B 세포 수용체 레퍼토리의 변이, 항체 및 사이토카인 분비, 방사선 저항성이 포함된다. 본 연구에서는 MZ B 세포의 이질성을 탐색하기 위해 단일세포 RNA 시퀀싱(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)을 사용하였다. 5,734개의 단일세포를 분석한 결과 다섯 개의 클러스터가 확인되었다. 유전자 온톨로지 분석에서는 Interferon Stimulated Gene (ISG)+, Cycling 및 조절(regulatory) B 세포와 같은 집단이 강조되었다. scRNA-seq에서의 핵심 과제 중 하나는 기준(reference) 마커 유전자 세트의 한계로 인해 희귀하거나 새로운 세포 유형을 식별하는 것이다. 이를 극복하기 위해 대량 RNA 시퀀싱(bulk RNA sequencing) 데이터를 통합하여 CD80high 및 CD80low MZ B 세포 클러스터의 분류를 정교화하였다. 궁극적으로 여섯 개의 서로 다른 MZ B 세포 클러스터가 확인되었는데, CD80high, CD80low, ISG+, regulatory, cycling, 그리고 알려지지 않은 하위 아집단(unknown subpopulation)이었다. 이러한 클러스터에 대한 추가 특성 규명은 MZ B 세포를 표적으로 하는 새로운 진단 및 치료 기회를 제시함으로써 면역 관련 질환의 예후를 개선할 수 있을 것으로 기대된다. 지원 연구비: RS-2024-00341200; 2023R1A2C2004510; RS-2024-00405650. 주제 범주: 면역학의 기술적 혁신(TECH)

목적: 자궁경부 편평세포암과 자궁경부 내막선암(endocervical adenocarcinoma, CESC)은 주요 부인과 악성종양이다. 정밀 의학은 종양 특이적 분자 프로파일을 표적으로 하여 치료를 맞춤화하고자 한다. 용질 운반체(solute carrier, SLC) 는 65개 계열에 속하는 400종 이상의 수송 단백질로 이루어진 초가족이며, 분자 수송을 조절하고 잠재적인 치료 표적을 대표한다.방법: The Cancer Genome Atlas 및 Human Protein Atlas의 전사체(transcriptomic)와 단백질체(proteomic) 데이터를 분석하여 CESC에서 SLC 수송체의 역할을 평가하였다.결과: 비교 프로파일링을 통해 종양 조직에서 정상 대조군에 비해 SLC64A1, SLC7A1, SLC25A24, SLC11A2가 유의하게 상향 조절됨을 확인하였다. 이러한 SLC 유전자들의 발현 증가는 전체 생존 및 질병 특이 생존의 감소와 상관되었다. 유전자 집합 농축 분석(Gene Set Enrichment Analysis)에서는 SLC 과발현과 연관된 종양유발 경로들이 농축됨을 보여주었으며, 그중에는 상피-중간엽 전이(epithelial-mesenchymal transition), 저산소증, 혈관신생, ATP 결합 카세트(ATP-binding cassette) 수송체 활성, 그리고 transforming growth factor-beta, Notch 및 Hedgehog 신호전달이 포함되었다. 이러한 결과는 SLC 수송체가 종양의 진행과 전이를 촉진함을 시사한다.결론: SLC 수송체는 예측 바이오마커 및 치료 표적으로 활용될 수 있다. 이들의 억제는 CESC 진행에 필수적인 대사 및 영양소 경로를 교란할 수 있으며, 이는 예후 개선을 위한 새로운 기회를 제공할 수 있다.

서로 다른 독립적 동질 집단으로 생각되었던 B-1a 세포는 이질적이다. 우리는 단일세포 RNA 시퀀싱과 BCR 레퍼토리 프로파일링을 수행하여 복강(peritoneal cavity)의 B 세포에서 전사적 및 클론(계통) 이질성을 조사하였다. 초기 클러스터링은 B1a, B1b, B2의 세 가지 주요 집단이 있음을 확인하였다. 예상대로 B1a 세포 집단은 매우 반복적인 BCR을 보였으나, B1b 및 B2 세포의 대부분 BCR 클론형(clonotype)은 단 1회에서만 관찰되었다. 흥미롭게도 IgH V11 또는 V12에 치우친 두 가지 서로 다른 B1a 하위집단을 관찰할 수 있었으며, 이들 모두는 인지질인 포스파티딜콜린(phosphatidylcholine)에 결합하는 자가반응성(aut oreactive) 특이성과 연관되어 있었다. 두 B1a 세포 하위집단은 면역글로불린 중쇄의 기여도를 제거한 뒤 이들을 다시 재분류(regrouped)하였음에도 지속되었기 때문에, 유전자 발현 프로파일에서도 서로 달랐다. 또한 CD11b, B220, ICAM-1을 포함한 확인된 세포표면 마커를 사용하여 유세포분석(flow cytometry)으로 두 하위집단을 확인할 수 있었다. 두 하위집단은 입양이식(adoptive transfer) 실험에서 대체로 고유한 특성을 유지하였으나, 일부의 Fucosyl transferase 8(-) B1a 세포는 Fucosyl transferase 8(+) B1a 세포로 전환되었고, 그 반대 전환은 관찰되지 않았다. 요약하면, 우리는 BCR 레퍼토리의 사용과 유전자 발현 프로파일에 근거하여 두 가지 서로 다른 B1a 세포 하위집단을 규명하였다. 이들의 기능적 차이는 사람의 B-1a 세포를 정의하는 데 기여하고, 체액성 면역에서의 차등적 기여를 설명하는 데 도움이 될 수 있다. 재원 조달: RS-2024-00405650, 2023R1A2C2004510. 주제 범주: 면역 반응 조절: 세포 기전(IRC)

BCR 결합에 따른 CD69 반응과, 구별되는 BCR 레퍼토리.