이소잔존질환(MRD)의 검출은 암 치료 후 재발을 예방하고 환자 예후를 개선하는 데 매우 중요하다. 그러나 기존의 MRD 검출 방법은 정밀한 모니터링에 필요한 충분한 감도를 갖추지 못하는 경우가 많다. 우리는 개인별 특성을 반영한 무세포 DNA(cfDNA)의 전장유전체서열분석(WGS) 기반 분석을 통해 MRD를 검출하는 고감도 방법을 개발하였다. 본 접근은 환자의 종양 WGS에서 여러 변이 콜러가 일관되게 검출하는 합의(consensus) 단일염기변이(SNV)와 융합을 식별하는 것에서 시작한다. 새로운 알고리즘을 사용하여 합의 SNV 위치에서 지지(read)되는 양을 정량화하고, 환자 혈장 WGS에서의 오류 분포에 기반하여 그 통계적 유의성을 평가한다. 또한 혈장 WGS에서 합의 융합 위치에 해당하는 고유 서열을 검출함으로써 MRD를 진단한다. 암 세포주 혼합 실험을 통한 검증에서는 1:12, 800 미만의 감도를 입증하였다. 더 나아가 본 방법은 폐, 흑색종, 유방, 간을 포함한 다양한 암 유형의 임상 시료에서 MRD를 효과적으로 검출하였다. SNV 정량 방법의 검출한계는 개별 BAM 파일의 오류율에 의해 결정되었으며, 융합 서열 검출 방법은 공백 한계(limit of blank)가 0이어서 검출한계가 관찰되지 않았다. 이 알고리즘은 클라우드 플랫폼에 구현되어, 각 사용자가 데이터를 업로드하여 자신의 데이터를 분석할 수 있다. MRD를 검출하는 이러한 고감도 접근은 암 환자의 예후를 유의미하게 개선할 잠재력을 제공한다. 또한 이 기술은 cfDNA 기반 모니터링이 임상적 이점을 제공할 수 있는 다양한 암 유형 전반에 걸쳐 넓게 적용될 가능성이 크다. 인용 형식: Jun Hyeok Lim, Jeong-Seon Ryu, Ji Won Byun, Jongsuk Chung, Hyun-Tae Shin. Whole genome sequencing-based detection of minimal residual disease using individual-specific features [초록]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 7138.

배경: 건선의 유병률은 인구집단에 따라 다르며, 동아시아인보다 유럽인에서 더 흔한 것으로 보인다. 최근의 전장유전체 연관분석(genome-wide association studies, GWAS)은 건선의 위험을 증가시키는 대립유전자들을 확인하였고, 이러한 대립유전자는 서로 다른 지리적 지역에서 서로 다른 빈도로 나타날 수 있다. 목적: 우리는 인구집단에 따른 질병 빈도의 차이 원인과 유병률 및 양상 차이에 영향을 미치는 요인들에 대한 통찰을 얻고자 하였다. 방법: GWAS catalog에서 건선과 연관된 총 147개의 단일염기다형성(single-nucleotide polymorphisms, SNPs)을 수집하고, 1000 Genomes Project 3단계(public population frequency, n=2,504) 및 Korean Reference Genome Database(n=1,722)를 이용하여 27개 인구집단 간의 대립유전자 빈도 차이를 비교하였다. 또한 인구집단 전반에 걸쳐 합성 유전적 위험 점수(composited genetic risk scores)를 계산하였다. 결과: 인구집단마다 대립유전자 빈도의 뚜렷한 양상이 관찰되었다. 많은 경우에서 동아시아인은 유럽인과 반대되는 대립유전자 빈도를 보였다. 유전적 위험 점수는 동아시아인(평균: 0.471)보다 유럽인(평균: 0.487)과 미국인(평균: 0.492)에서 더 높았다. 건선의 유병률은 해당 인구집단의 평균 유전적 위험 점수와 상관관계를 보였다. 결론: 본 연구에서 분석된 인구집단 간에 건선 관련 SNP의 대립유전자 빈도 차이가 존재함을 관찰하였다. 이러한 결과는 인구집단 간 건선 유병률 차이가 유전자형에 의해 어느 정도 해석될 수 있음을 시사한다.

ctDNA 검출이 없는 경우보다 0.019) 더 높다. NSCLC의 자연 경과는 ctDNA 수준을 측정함으로써 모니터링할 수 있다. 진단 시점에 ctDNA를 검출하는 것은 새로운 전이가 발생하는지, 종양이 빠르게 성장하는지, 그리고 NSCLC 환자의 예후가 불량한지를 예측할 수 있다.

배경: 개방각 녹내장(OAG)의 유병률은 다양한 조상의 집단에서 0.5%~7.0%로 다양하게 나타나며, 이는 유전적 차이의 존재를 시사한다. 본 연구의 목적은 OAG의 유전적 원인에 대한 통찰을 제공하여 다양한 조상의 집단 간에 OAG의 유병률 및 표현형의 차이를 초래할 수 있는 요인을 파악하고, 한국인과 다른 인종 집단 간에 OAG에서 안압(IOP) 상승 관련 SNP의 대립유전자 빈도를 비교하는 데 있다. 방법: 우리는 GWAS(Genome-Wide Association Studies) 카탈로그에서 OAG와 연관된 총 135개의 단일염기다형성(SNP) 자료를 수집하였다. 이들 SNP의 집단 수준 대립유전자 빈도는 1000 Genomes Project 및 Korean Reference Genome Database를 기반으로 도출하였다. 특정 SNP에서 효과 대립유전자가 유의하게 농축되었거나 결핍되었는지 평가하기 위해 피셔의 정확 검정(Fisher's exact test)을 사용하였다. 결과: 유럽, 미국 및 남아시아 집단에서는 유사한 히트맵 양상이 나타난 반면, 아프리카, 동아시아 및 한국 집단에서는 서로 다른 양상이 관찰되었다. 한국 집단은 다른 집단과 비교하여 서로 다른 프로파일을 보였으며, IOP 변이와 관련된 것으로 알려진 rs1579050(FMNL2 유전자), rs2024211(CAV2;CAV1), rs8141433(GNB1L;TXNRD2 유전자)는 미국인, 유럽인 및 아프리카인에서 농축되어 있었고, 한국인에서는 결핍되어 있었다. 이는 인종에 따른 OAG에서 IOP 변이의 유병률 차이를 설명하는 인과적 유전자의 후보가 될 수 있다. 결론: 한국인과 다른 인종 간에 IOP 관련 SNP의 대립유전자 빈도 차이가 관찰되었으며, 이는 주로 한국인과 동아시아인에서 정상 안압(normal IOP) 하의 OAG 유병률이 높은 현상을 설명할 수 있을 가능성이 있다.

이소잔존질환(MRD)의 검출은 암 치료 후 재발을 예방하고 환자 예후를 개선하는 데 매우 중요하다. 그러나 기존의 MRD 검출 방법은 정밀한 모니터링에 필요한 충분한 감도를 갖추지 못하는 경우가 많다. 우리는 개인별 특성을 반영한 무세포 DNA(cfDNA)의 전장유전체서열분석(WGS) 기반 분석을 통해 MRD를 검출하는 고감도 방법을 개발하였다. 본 접근은 환자의 종양 WGS에서 여러 변이 콜러가 일관되게 검출하는 합의(consensus) 단일염기변이(SNV)와 융합을 식별하는 것에서 시작한다. 새로운 알고리즘을 사용하여 합의 SNV 위치에서 지지(read)되는 양을 정량화하고, 환자 혈장 WGS에서의 오류 분포에 기반하여 그 통계적 유의성을 평가한다. 또한 혈장 WGS에서 합의 융합 위치에 해당하는 고유 서열을 검출함으로써 MRD를 진단한다. 암 세포주 혼합 실험을 통한 검증에서는 1:12, 800 미만의 감도를 입증하였다. 더 나아가 본 방법은 폐, 흑색종, 유방, 간을 포함한 다양한 암 유형의 임상 시료에서 MRD를 효과적으로 검출하였다. SNV 정량 방법의 검출한계는 개별 BAM 파일의 오류율에 의해 결정되었으며, 융합 서열 검출 방법은 공백 한계(limit of blank)가 0이어서 검출한계가 관찰되지 않았다. 이 알고리즘은 클라우드 플랫폼에 구현되어, 각 사용자가 데이터를 업로드하여 자신의 데이터를 분석할 수 있다. MRD를 검출하는 이러한 고감도 접근은 암 환자의 예후를 유의미하게 개선할 잠재력을 제공한다. 또한 이 기술은 cfDNA 기반 모니터링이 임상적 이점을 제공할 수 있는 다양한 암 유형 전반에 걸쳐 넓게 적용될 가능성이 크다. 인용 형식: Jun Hyeok Lim, Jeong-Seon Ryu, Ji Won Byun, Jongsuk Chung, Hyun-Tae Shin. Whole genome sequencing-based detection of minimal residual disease using individual-specific features [초록]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 7138.

배경: 건선의 유병률은 인구집단에 따라 다르며, 동아시아인보다 유럽인에서 더 흔한 것으로 보인다. 최근의 전장유전체 연관분석(genome-wide association studies, GWAS)은 건선의 위험을 증가시키는 대립유전자들을 확인하였고, 이러한 대립유전자는 서로 다른 지리적 지역에서 서로 다른 빈도로 나타날 수 있다. 목적: 우리는 인구집단에 따른 질병 빈도의 차이 원인과 유병률 및 양상 차이에 영향을 미치는 요인들에 대한 통찰을 얻고자 하였다. 방법: GWAS catalog에서 건선과 연관된 총 147개의 단일염기다형성(single-nucleotide polymorphisms, SNPs)을 수집하고, 1000 Genomes Project 3단계(public population frequency, n=2,504) 및 Korean Reference Genome Database(n=1,722)를 이용하여 27개 인구집단 간의 대립유전자 빈도 차이를 비교하였다. 또한 인구집단 전반에 걸쳐 합성 유전적 위험 점수(composited genetic risk scores)를 계산하였다. 결과: 인구집단마다 대립유전자 빈도의 뚜렷한 양상이 관찰되었다. 많은 경우에서 동아시아인은 유럽인과 반대되는 대립유전자 빈도를 보였다. 유전적 위험 점수는 동아시아인(평균: 0.471)보다 유럽인(평균: 0.487)과 미국인(평균: 0.492)에서 더 높았다. 건선의 유병률은 해당 인구집단의 평균 유전적 위험 점수와 상관관계를 보였다. 결론: 본 연구에서 분석된 인구집단 간에 건선 관련 SNP의 대립유전자 빈도 차이가 존재함을 관찰하였다. 이러한 결과는 인구집단 간 건선 유병률 차이가 유전자형에 의해 어느 정도 해석될 수 있음을 시사한다.

ctDNA 검출이 없는 경우보다 0.019) 더 높다. NSCLC의 자연 경과는 ctDNA 수준을 측정함으로써 모니터링할 수 있다. 진단 시점에 ctDNA를 검출하는 것은 새로운 전이가 발생하는지, 종양이 빠르게 성장하는지, 그리고 NSCLC 환자의 예후가 불량한지를 예측할 수 있다.

배경: 개방각 녹내장(OAG)의 유병률은 다양한 조상의 집단에서 0.5%~7.0%로 다양하게 나타나며, 이는 유전적 차이의 존재를 시사한다. 본 연구의 목적은 OAG의 유전적 원인에 대한 통찰을 제공하여 다양한 조상의 집단 간에 OAG의 유병률 및 표현형의 차이를 초래할 수 있는 요인을 파악하고, 한국인과 다른 인종 집단 간에 OAG에서 안압(IOP) 상승 관련 SNP의 대립유전자 빈도를 비교하는 데 있다. 방법: 우리는 GWAS(Genome-Wide Association Studies) 카탈로그에서 OAG와 연관된 총 135개의 단일염기다형성(SNP) 자료를 수집하였다. 이들 SNP의 집단 수준 대립유전자 빈도는 1000 Genomes Project 및 Korean Reference Genome Database를 기반으로 도출하였다. 특정 SNP에서 효과 대립유전자가 유의하게 농축되었거나 결핍되었는지 평가하기 위해 피셔의 정확 검정(Fisher's exact test)을 사용하였다. 결과: 유럽, 미국 및 남아시아 집단에서는 유사한 히트맵 양상이 나타난 반면, 아프리카, 동아시아 및 한국 집단에서는 서로 다른 양상이 관찰되었다. 한국 집단은 다른 집단과 비교하여 서로 다른 프로파일을 보였으며, IOP 변이와 관련된 것으로 알려진 rs1579050(FMNL2 유전자), rs2024211(CAV2;CAV1), rs8141433(GNB1L;TXNRD2 유전자)는 미국인, 유럽인 및 아프리카인에서 농축되어 있었고, 한국인에서는 결핍되어 있었다. 이는 인종에 따른 OAG에서 IOP 변이의 유병률 차이를 설명하는 인과적 유전자의 후보가 될 수 있다. 결론: 한국인과 다른 인종 간에 IOP 관련 SNP의 대립유전자 빈도 차이가 관찰되었으며, 이는 주로 한국인과 동아시아인에서 정상 안압(normal IOP) 하의 OAG 유병률이 높은 현상을 설명할 수 있을 가능성이 있다.

아토피 피부염은 재발이 잦은 만성 염증성 피부 질환으로, 면역억제제로 치료한다. 그러나 면역억제제를 장기간 사용하면 독성 및 심각한 부작용이 발생할 수 있다. 클론성 중간엽 줄기세포(clonal mesenchymal stem cell) 치료의 장기적 유효성과 안전성을 확인하기 위해, 기존 치료에 불응하는 중등도~중증 아토피 피부염을 가진 성인 5명에서 치료자 주도(investigator-initiated) 임상시험과 장기 관찰을 수행하였다. 습진 면적 및 중증도 지수(Eczema Area and Severity Index, EASI)와 같은 임상 반응 평가 지표는 16주에 유의하게 개선되었으며, 1~2회의 치료 주기 후 80%(4/5)의 환자가 EASI-50에 도달하였다. 환자들은 평균 38주(범위, 16–86) 동안 장기 유효성과 안전성을 관찰하였고 중대한 부작용은 나타나지 않았다. 시험한 사이토카인 중 CCL-17, 인터루킨(interleukin, IL)-13, IL-22는 5명의 참여자에서 평가 종점 시 유의하게 감소하였다. 임상적 반응을 84주 이상 양호하게 유지한 2명의 환자에서는 혈중 IL-17 사이토카인 수준이 증가하였다.

배경: 원형탈모증(AA)은 모든 연령, 성별, 인종에 영향을 미친다. AA는 환자의 삶의 질에 중대한 영향을 준다. AA에 대해 적응증이 있는 치료는 2022/2023년부터서만 승인되었다. 일부 아시아 태평양(APAC) 국가/지역에서는 국가 또는 지역 지침이 있으나, 많은 곳에서 AA 특이적 지침이 없거나 기존 지침을 최근 승인된 치료를 반영하도록 업데이트하지 못한 실정이다. 방법: 치료 의사결정을 더 잘 뒷받침하기 위해 호주, 중국, 인도, 한국, 말레이시아, 싱가포르, 대만, 태국의 피부과 전문의 18명이 설문 작성, 공개 토론, 진술 투표를 포함하는 3라운드 델파이(Delphi) 기반 합의 과정에 참여하였다. 리커트(Likert)형 및 다지선다 진술에 대한 합의는 ≥ 70%의 동의 또는 반대로 정의하였다. 결과: 총 140개 진술에 대해 합의가 도출되었다. 패널은 AA가 임상적으로 이질적이며 환자와 가족에게 상당한 부담을 초래한다는 점을 인식하였다. 트리코스코피(trichoscopy)는 AA의 진단 및 모니터링에 필수로 간주되며, 피부 생검은 모발 소실의 원인이 불명확한 경우에 한해 시행하도록 한다. 질병 중증도와 관련하여 중등도 AA는 21%-49%의 모발 소실로 정의하고, 중증 AA는 ≥ 50%의 모발 소실로 정의하였다. 치료와 관련해서는 12세 미만 아동에서는 국소 코르티코스테로이드가 권장된다. 12세 이상 환자에서는 경증-중등도 AA에 국소 및 병소 내(intralesional) 코르티코스테로이드를 사용할 수 있으며, 얀누스 키나제 억제제와 전신 코르티코스테로이드는 중등도-중증 AA에서 역할이 있다. 또한 만성 AA에는 보조적으로 미녹시딜(minoxidil)을 사용할 수 있다. 결론: 본 수정 델파이(Delphi) 기반 합의는 환자 예후 개선을 기대하며, 다양한 APAC 의료 환경 전반에서 AA의 진단과 관리의 표준화를 위한 실용적인 지역 중심 프레임워크를 제공한다.

목적.: 인두편도 편평세포암(OPSCC)은 사람 유두종바이러스(HPV) 상태에 따라 서로 다른 임상적 양상을 보인다. HPV 연관 OPSCC는 비-HPV 연관 OPSCC에 비해 일반적으로 예후가 더 좋고 치료에 대한 반응도 더 양호하지만, 종양 미세환경(TME)에서의 차이는 아직 명확하지 않다. 방법.: HPV 연관 OPSCC에서 더 나은 예후와 연관된 세포 및 분자 요인을 규명하기 위해, HPV 비연관 OPSCC 2예, HPV 연관 OPSCC 5예, 그리고 정상 편도 3예의 시료에 대해 단일세포 RNA 시퀀싱과 고해상도 공간전사체학을 수행하였으며, 섬유망상세포(fibroreticular cells, FRCs)에 초점을 맞췄다. 결과.: FRC의 4가지 서로 다른 아형을 확인했으며, FBLN1+ FRC는 HPV 연관 OPSCC에서 유의하게 더 풍부하게 나타났다. 이 FRC들은 면역세포 모집에 관여하는 분자인 SLIT2를 발현했다. 공간 매핑 결과, FBLN1+ FRC는 종양 세포와 면역 세포 모두와 매우 밀접하게 연관되어 있어, 더 면역원성인 TME를 조성하는 역할을 시사했다. 또한 HPV 연관 OPSCC는 비-HPV 연관 종양에 비해 증식하는 상피세포의 수준과 항원제시 관련 유전자 발현이 더 높았다. 결론.: 본 연구는 HPV 연관 OPSCC의 TME에서 면역 활성화를 촉진하는 데 FBLN1+ FRC가 중요한 역할을 한다는 점을 보여준다. 향상된 항원제시와 상피세포 증식은 종양-면역 상호작용을 촉진하여 더 나은 임상적 예후에 기여할 가능성이 있다. 본 연구는 OPSCC에서 TME 역학에 대한 이해를 발전시키며 향후 치료 전략 수립에 기여할 수 있다.

배경/목적: 허친슨-길퍼드 조로증후군(Hutchinson-Gilford progeria syndrome, HGPS)은 LMNA 돌연변이와 프로제린(progerin) 축적으로 인해 조기 노화를 유발하는 드문 유전 질환이다. FDA 승인 파르네실전이효소 억제제인 로나파닙(lonafarnib)은 생존 기간을 다소 연장하는 것으로 보고되었으나, 질환은 계속 진행한다. 조로증은 줄기세포 고갈과 연관되어 있으며, 중간엽 줄기세포(mesenchymal stem cell, MSC) 치료가 동맥경화증 치료에 효능을 보였기 때문에, 본 연구는 HGPS에서 MSC 치료의 효능과 안전성을 평가하고자 하였다. 방법: 고전적 HGPS를 가진 7세 남아로, 선행된 중증 뇌혈관 질환이 있었다. 해당 환자는 8개월에 걸쳐 4회에 걸쳐 골수유래 MSC를 정맥 주입(2.5 × 10⁵ cells/kg)받았다. 연구 전 기간 동안 성장, 대사, 심혈관, 근골격, 청각 및 염증성 사이토카인을 모니터링하였다. 혈관 합병증을 예방하기 위해 예방적 에녹사파린(enoxaparin)을 투여하였다. 결과: MSC 치료는 제지방 체중(11.5%)의 개선, 골밀도(L-spine z-score: 0.55 → 2.03) 증가, 동맥 경직도의 감소(맥파전달속도에서 9.98% 감소), 관절 운동범위, 치열의 개선 및 sICAM-1 수준의 감소와 연관되었다. 그러나 심혈관 기능의 악화는 계속되었고, 환자는 네 번째 투여 후 10개월이 지나 사망하였으며, 이는 근본적인 혈관 질환의 진행 때문이었을 가능성이 있다. MSC 치료와 연관된 중증의 이상반응은 보고되지 않았다. 결론: MSC 치료는 HGPS에서 동맥 경직, 골 건강 및 염증과 관련하여 단기적 이점을 제공할 수 있으며, 주목할 만한 안전성 우려는 없었다. 이러한 결과를 검증하고, 더 이른 시기의 개입을 탐색하며, 장기 효능 및 최적 투여 전략을 규명하기 위해 추가 연구가 필요하다.

BACKGROUND: 바리시티닙은 경구용 Janus kinase 1 및 2 억제제로, 원형탈모증(AA)에서 제3상 임상시험을 통해 유의한 효능을 보였다. 그러나 AA에 대한 실제 임상에서의 사용에 관한 근거는 제한적이다. OBJECTIVE: 본 연구는 원형탈모증이 있는 한국인 환자에서 바리시티닙의 효능과 안전성을 평가하고자 하였다. METHODS: 본 후향적 다기관 연구에서 원형탈모증 환자 117명은 최소 36주 동안 매일 경구 바리시티닙 4 mg을 투여받았다. 환자의 인구통계학적 특성, Severity of Alopecia Tool(SALT) 점수, 및 이상사례를 평가하였다. RESULTS: <0.001). 이상반응은 대부분 경증에서 중등도의 중증도를 보였으며, 적절한 관리로 해소되었다. CONCLUSION: 바리시티닙은 내약성이 양호하였고, 실제 임상 환경에서 원형탈모증 환자에서 임상적 개선을 유도하였다. 바리시티닙은 치료 저항성 원형탈모증 환자에게 잠재적인 치료 옵션이 될 수 있다.